目的：探讨低深度全基因组拷贝数变异测序（copy number variation sequencing，CNV-seq）技术在流产物遗传学分析及诊断中的应用。方法：收集2016年1月—2018年12月在淮安市第一人民医院就诊的流产组织样本112例，采用二代测序技术对流产物样本进行全基因组测序，利用生物信息学方法分析流产样本可能存在的染色体异常。结果：①在112例流产样本中，染色体结果异常共56例（50.0%，56/112），出现异常信号频率高的分别是16三体（27.1%）、45，X（24.3%）、13三体（10.8%）、18三体（10.8%）。在56例染色体异常结果中，染色体数目异常37例（66.1%），染色体结构异常12例（21.4%），嵌合体7例（12.5%）。在12例染色体结构异常中，共发现24个基因组拷贝数变异（copy number variation，CNV），最小片段长度0.24 Mb，最大片段58.90 Mb。在检测出的24个CNV中，18个CNV有临床意义。其中2个包含微缺失/微重复综合征。②患者年龄≥35岁发生染色体异常导致的流产者占63.2%，年龄＜35岁发生染色体异常导致的流产者占47.3%，≥35岁组的异常率比＜35岁组高15.9%。结论：CNV-seq技术不但能够高效检测出非整倍体和嵌合体，还能高效检测出小片段的缺失和重复，大大提高了染色体异常的检出率，可为流产病因分析及夫妻双方再次生育提供更有价值的信息。