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第42卷第11期             梅  杰，许隽颖，王惠宇，等. TUBA1C在乳腺癌中的表达及其生物学功能探讨［J］.
                 2022年11月                    南京医科大学学报（自然科学版），2022，42（11）：1530-1538                      ·1531 ·


                    乳腺癌是一种常见的恶性肿瘤，在全球女性恶                                       表1 微管基因对应的探针
                                  ［1］
                性肿瘤中发病率最高 。作为一种复杂的异质性疾                                    Table 1  Probes used for tubulin genes
                病，乳腺癌在分子特征和恶性程度上显示出很大的                                   微管基因                    最佳探针
                      ［2］
                差异性 。尽管近年来针对乳腺癌的治疗手段不断                                   TUBA1A                 209118_s_at
                                                                         TUBA1B                 211058_x_at
                发展，包括外科手术、内分泌治疗、化疗、放疗和靶
                                                                         TUBA1C                 209251_x_at
                向疗法在内的综合手段已在很大程度上提高了疗
                                                                         TUBA3C                 210527_x_at
                效，但对晚期患者仍缺乏有效治疗手段                  ［3-6］ 。因此，
                                                                         TUBA3D                 216323_x_at
                应进一步探究与乳腺癌发生、发展相关的功能基
                                                                         TUBA4A                  212242_at
                因，探索新的发病机制和治疗靶点。                                         TUBA4B                  207490_at
                    细胞骨架，包括微管、微丝和中间丝，与增殖、                                TUBA8                   220069_at
                迁移、侵袭等多种细胞生物学行为密切相关 。微                                   TUBAL3                  220310_at
                                                        ［7］
                管是真核细胞中普遍存在的纤维结构，在多种肿瘤                                   TUBB                    204141_at
                的发生和发展中起着至关重要的作用。细胞中微                                    TUBB1                   230690_at
                                                                         TUBB2A                  204141_at
                管的形成与重塑在很大程度上由微管基因超家族
                                                                         TUBB2B                 214023_x_at
                介导  ［8-9］ 。此外，包括紫杉醇在内的多种微管靶向
                                                                         TUBB3                  202154_x_at
                化疗药物已广泛用于乳腺癌等常见肿瘤的临床治
                                                                         TUBB4A                  212664_at
                疗 ［10］ 。鉴于微管基因超家族在乳腺癌中的重要作                               TUBB4B                 213726_x_at
                用，本研究对微管基因超家族成员的表达差异和预                                   TUBB6                   209191_at
                后价值进行系统分析，从而选定微管蛋白α家族 1c                                 TUBB8                     N.A.
                蛋白（tubulin，alpha 1c，TUBA1C）作为研究对象。进                      TUBD1                   231853_at
                一步通过免疫组化（immunochemistry，IHC）染色和                         TUBE1                   226181_at
                细胞学实验，明确 TUBA1C 在乳腺癌中表达的临床                               TUBG1                   201714_at
                意义及其生物学功能。                                               TUBG2                   203894_at
                                                                         TUBGCP2                202477_s_at
                1  对象和方法                                                 TUBGCP3                 203690_at
                                                                         TUBGCP4                211337_s_at
                1.1  对象
                                                                         TUBGCP5                 227967_at
                1.1.1 癌症基因组图谱数据获取                                        TUBGCP6                225758_s_at
                    从UCSC Xena（https：//xenabrowser.net/datapages/）
                下载癌症基因组图谱（the Cancer Genome Atlas，TCGA）           据 ［12］ 。判断 TUBA1C 在癌与癌旁组织中是否显著
                乳腺癌 RNA 测序数据。基因表达采用 log2 （x+1）标                   差异表达的标准如下：P值为1×10 ，倍数变化为2，
                                                                                                 -4
                准化形式表示。共保留含有微管基因超家族表达                             基因排名位于前10％。
                数据的 1 104 个乳腺癌和 114 个正常样本。通过参                     1.1.4 组织芯片获取
                考Nami等 的研究确定微管基因超家族的成员。                               两张乳腺癌组织芯片（tissue microarray，TMA）
                         ［8］
                1.1.2 Kaplan⁃Meier plotter数据库                    （HBreD140Su03和HBreD077Su01）购自上海芯超生

                    采用 Kaplan⁃Meier plotter 数据库（http：//kmplot.    物科技有限公司。HBreD140Su03 芯片包含 140 个
                com）分析微管基因超家族的预后价值                 ［11］ 。选择每      乳腺癌组织位点，HBreD077Su01芯片包含其中配对
                个基因的JetSet最佳探针表达量代表微管基因超家                         的 77 个癌旁组织位点。组织芯片的使用由上海芯
                族的表达量（表1）。乳腺癌样本的基因表达中位水                           超生物科技有限公司临床研究伦理委员会审批通
                平作为生存分析的分组截点。在线计算风险比                              过（审批编号：YBM⁃05⁃02）。

               （hazard ratio，HR）、95%置信区间（confidence inter⁃        1.2  方法
                val，CI）和P值。                                       1.2.1 免疫组化
                1.1.3 Oncomine数据库                                     在两张TMA上进行IHC染色。过程如下：按常
                    从Oncomine数据库（https：//www.oncomine.org/）       规方法进行脱蜡，水合，将切片用二甲苯浸泡5 min，
                中获取各种恶性肿瘤中 TUBA1C 的 mRNA 表达数                      更换二甲苯后再浸泡 5 min。分别用无水乙醇浸泡
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