Page 12 - 南京医科大学学报自然科学版
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第42卷第1期
               · 6  ·                            南 京    医 科 大 学 学         报                        2022年1月


                                                  表2 F9敲除单细胞克隆基因型
                                          Table 2 Genotypes of F9 knockout single cell clones

                序号                                    目的片段                                           类型
                WT    …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAAACTGGA//ACCTAACATCCTTCACATGCGGAGCAAA…                   WT
                  1   …CAATCAGGCATAATTCAAGCA-----------//ACCTAACATCCTTCACATGCGGAGCAAA…              -11 bp
                  2   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAAAACTGTGGA//ACCTAACATCCTTCACATGCGGAGCAAA…               +2 bp
                  3   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                  -121 bp
                  4   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                  -121 bp
                  5   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                  -121 bp
                  6   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCA//…------AAGAA…                                        -117 bp
                  7   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                 -120 bp
                  8   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                 -120 bp
                  9   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAAACTGGA//-----------TTCACATGCGGAGCAAA…                  -11 bp
                 10   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                 -120 bp
                 11   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                 -120 bp
                 12   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                  -121 bp
                 13   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAA-CTGGA// ACCTAACATCCTTCACATGCGGAGCAAA…                 -1 bp
                 14   …CAAAGAGGTAACGCCGGAT------…// …------ATGCGGAGCAAA…                         +9 bp,-140 bp
                 15   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAAAACTGGA// ACCTAACATC-TTCACATGCGGAGCAAA…              +1 bp,-1 bp
                 16   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                  -121 bp
                 17   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                 -120 bp
                 18   …CAAAGAGGTAT------…//…------TCCTTCACGTGCGCTGCAAA…                            -132 bp
                 19   …CAAAGAGGTATAATTCA----AACTGGA// ACCTAAC---CTTCACATGCGGAGCAAA…                 -7 bp
                 20   …CAAAGAGGTATAAT------…//…------ ATCCTTCACATGCGGAGCAAA…                       -127 bp
                 21   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAA------…//…------TCCTTCACATGCGGAGCAAA…                 -120 bp
                 22   …CAAAGAGGTATAATTCAGGC---CTGGA// ACCTAACATCCTTCACATGCGGAGCAAA…                 -3 bp
                 23   …CAAAGAGGTATAATTC--------TGGA// ACCTAACATCCTTCACATGCGGAGCAAA…                 -8 bp
                 24   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAAAACTGGA// ACCTAACAATCCTTCACATGCGGAGCAAA…               +2 bp
                 25   …CAAAGAGGTATAATTCAGGCAA-CTGGA// ACCTAACAACCTTCACATGCGGAGCAAA…               -1 bp,+1 bp
                 首行加黑加粗处为靶序列;WT为野生型;+为增加;-为删除;红色字母为突变的碱基;蓝色字母为增加的碱基。

              序列相关核酸酶(CRISPR/Cas9)技术在鼠和人类细                      技术成功构建了多个猪模型。2015年Chen 等                  [19] 构
              胞中实现了基因编辑,开启了基因编辑技术新篇                             建的 3 只 B 细胞缺陷仔猪;2018 年 Zhang 等         [12] 构建
              章。此后,利用 CRISPR/Cas9 技术构建的血友病动                     的 GGTA1、CMAH 和β4GalNT2 三基因敲除猪;2019
              物模型,尤其是多种小鼠血友病模型得到了极大的                            年 Yao 等 [20] 构建的听力缺陷猪。以上成果表明了
              发展,为研究血友病提供了便利。                                   CRISPR/Cas9 技术在构建基因修饰猪方面的可行
                  然而,小鼠与人类之间存在明显的物种差异,                          性和便捷性。本研究利用 2 个 sgRNA 对巴马小型
              并非构建血友病动物模型的最佳选择,深入研究血                            猪的胎儿成纤维细胞的 F9 基因进行打靶。CRIS⁃
              友病亟需一个与人类生理、病理情况更为相似的动                            PR/Cas9 表达质粒转染细胞后经过药物筛选,获得
              物模型。猪在遗传背景、生理特点及疾病发生发展                            55 个单细胞克隆。基因型分析显示其中有 25 个单
              等方面具有小鼠无法比拟的优势,且猪的凝血系统                            细胞克隆在靶点处发生了基因突变[(包含15个大
              与人类极为相似,更符合血液病动物模型的需求。                            片段缺失(> 100 bp),8个小片段缺失(< 100 bp),5
              本研究通过分析人和猪F9的遗传距离,以及对人和                           个碱基的插入,4 个碱基的突变],敲除效率高达
              猪 FⅨ氨基酸序列、蛋白质二级结构及三级结构的                           45.5%。本研究结果显示在进行基因敲除时,在靶
              模拟与分析,揭示了人与猪 FⅨ的高度同源性。因                           点处使用2个sgRNA是较为理想的选择。
              此,猪是构建血友病乙动物模型的良好选择。此外,                                综上,本研究通过高效的 CRISPR/Cas9 打靶载
              本课题组利用CRISPR/Cas9技术结合体细胞核移植                       体成功获得了巴马小型猪F9基因敲除细胞系,为接
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