Page 105 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 105

第43卷第4期          胡定东,郭    震,王丽君,等. 基于影像组学方法构建弥漫性低级别胶质瘤癫痫发生及远期
                  2023年4月              生存预测模型[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(04):542⁃549                   ·543 ·


                    弥漫性低级别胶质瘤(diffuse low⁃grade glioma,           标准:①病理诊断为 WHO 胶质瘤分级 CNS 2 级
                DLGG)通常指中枢神经系统(central nervous system,            和 3 级;②具有完整的临床资料,如年龄、性别、肿
                CNS)WHO 2~3 级的胶质瘤       [1-2] 。癫痫发作是 DLGG         瘤病理分级及手术、放化疗等治疗情况;③有完整
                                                        [3]
                患者常见的首发症状之一,发生率为65%~90% 。在                        的随访资料。其中,研究人群的基线临床资料从
                大多数情况下,癫痫作为首发症状有助于患者及时                            TCGA数据库获取,研究队列按照7∶3随机划分训练
                诊断与治疗。DLGG 患者的远期生存较好,10 年疾                        集和验证集,训练集人群的数据用于模型构建,验
                病无进展生存率可达80%,良好的癫痫控制率对于                           证集人群的数据用于检验模型预测效能。
                改善预后和生活质量极为重要。然而,关于癫痫发                            1.2  方法
                作导致的 DLGG 患者远期生存差异的原因及促进                          1.2.1  建立并验证风险评分公式
                DLGG 癫痫发作的因素,目前仍知之甚少。一方                               本研究收集并使用 TCIA 影像数据库提供的影
                面,出现癫痫的胶质瘤患者有可能早期发现疾病并                            像数据集(BraTS⁃TCGA⁃LGG ),该影像数据集包
                                                                                            [13]
                及时干预;另一方面,也有几项研究表明,该生存差                           括部分 TCGA⁃LGG 队列人群的术前 MRI 影像及勾
                异背后的一个潜在机制可能是异柠檬酸脱氢酶                              画完成的感兴趣区(region of interest,ROI)肿瘤标
               (isocitrate dehydrogenase,IDH)的突变或神经回路中            签,肿瘤分割 ROI 由自动混合生成⁃判别方法产生,
                突触和电的整合,而IDH 的突变是已知的预后影响                          并由影像科医生手动纠正。最终的ROI用于提取肿
                因素之一    [4-5] 。此外,肿瘤的位置也会影响癫痫的发                   瘤靶区内丰富的影像特征,包括强度、体积、形态、
                生,位于幕上和皮质的胶质瘤有更大的癫痫风险,                            直方图和纹理参数,以及从胶质瘤生长模型中提取
                额叶较枕叶胶质瘤癫痫发作风险较高 。近年来,                            的空间信息和扩散特性。该数据集提供的ROI标签
                                                  [6]
                分子生物学和影像技术的发展促进了对胶质瘤的                             可以进行定量计算和临床研究,而无需重复手动注
                早期诊断和预后评估。已有一些基因组学研究确                             释,同时允许跨研究进行比较。
                定了某些基因表达特征可预测DLGG患者的癫痫等                               本研究首先选用最小冗余及最大相关(minimum
                临床症状及生存预后         [7-9] ,但是这种预测方法是建立              redundancy⁃maximum relevance,MRMR)算法进行特
                在取得组织标本并检测到特定基因表达的基础上                             征与癫痫的相关性分析与排序                [14] ,即最大化特征
                的,经济代价较高,也不具有人群的普适性,因此寻                           与癫痫事件之间的相关性,而最小化特征与特征之
                找更经济、便捷、普适和无创的预测方法是临床亟                            间的相关性。研究者通过排序后选择相关性排名
                待解决的任务。已有越来越多的影像组学研究表                             前 10%的特征。最小冗余⁃最大相关算法使用
                明患者影像资料中的影像特征有助于对癌症临床                             MATLAB软件实现。
                症状、病理分型、基因突变以及生存预后进行有效                                随后,进一步使用最小绝对收缩和选择算子
                的评估   [10-11] 。因此,基于 DLGG 患者术前 MRI 建立            (least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)
                癫痫风险评分,并结合临床指标进行预后评估具有                            方法进行候选预测特征的筛选。筛选出的预后影
                非常重要的临床价值。本研究在DLGG患者中构建                           像 特 征 用 于 如 下 建 模 :癫 痫 风 险 评 分(radiomic
                了预测模型,帮助初步评估患者发生癫痫的概率以                            score,Rad⁃score)=(β特征1×特征1的参数值)+(β特
                及远期生存情况,有助于采取更有效和个体化的治                            征 2×特征 2 的参数值)+(β特征 3×特征 3 的参数
                疗策略。                                              值)+…+intercept。β特征代表该特征的回归系数,
                                                                  intercept代表公式截断值。
                1 资料和方法
                                                                      使用 R 软件中的“Optimal Cutpoints”包通过约
                1.1  资料                                           登指数寻找 Rad⁃score 的风险阈值,使用阈值将人
                    本研究纳入的患者临床资料来源于癌症基因组图                         群分为癫痫发生高低风险群组。使用“pPOC”包
                谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库,影像资料           对训练集和验证集进行模型的内部及外部验证,
                来源于癌症影像数据库(the cancer imaging archive,            并 计 算 AUC 指 标 评 估 模 型 的 预 测 效 能 。 通 过
                TCIA) (https://www.cancerimagingarchive.net/)。本   Kaplan⁃Meier 生存分析法比较高低风险组间的 5 年
                     [12]
                研究筛选出低级别胶质瘤(low grade glioma,LGG)                 OS差异。

                研究队列中在 TCIA 共享术前多序列 MRI(T1、T1⁃                    1.2.2  构建及评估癫痫预测列线图
                Gd、T2、T2⁃FLAIR)资料的患者组成研究队列,纳入                         将总人群队列的 Rad⁃score 结合临床特征(年
   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110