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第43卷第4期 胡定东,郭 震,王丽君,等. 基于影像组学方法构建弥漫性低级别胶质瘤癫痫发生及远期
2023年4月 生存预测模型[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(04):542⁃549 ·543 ·
弥漫性低级别胶质瘤(diffuse low⁃grade glioma, 标准:①病理诊断为 WHO 胶质瘤分级 CNS 2 级
DLGG)通常指中枢神经系统(central nervous system, 和 3 级;②具有完整的临床资料,如年龄、性别、肿
CNS)WHO 2~3 级的胶质瘤 [1-2] 。癫痫发作是 DLGG 瘤病理分级及手术、放化疗等治疗情况;③有完整
[3]
患者常见的首发症状之一,发生率为65%~90% 。在 的随访资料。其中,研究人群的基线临床资料从
大多数情况下,癫痫作为首发症状有助于患者及时 TCGA数据库获取,研究队列按照7∶3随机划分训练
诊断与治疗。DLGG 患者的远期生存较好,10 年疾 集和验证集,训练集人群的数据用于模型构建,验
病无进展生存率可达80%,良好的癫痫控制率对于 证集人群的数据用于检验模型预测效能。
改善预后和生活质量极为重要。然而,关于癫痫发 1.2 方法
作导致的 DLGG 患者远期生存差异的原因及促进 1.2.1 建立并验证风险评分公式
DLGG 癫痫发作的因素,目前仍知之甚少。一方 本研究收集并使用 TCIA 影像数据库提供的影
面,出现癫痫的胶质瘤患者有可能早期发现疾病并 像数据集(BraTS⁃TCGA⁃LGG ),该影像数据集包
[13]
及时干预;另一方面,也有几项研究表明,该生存差 括部分 TCGA⁃LGG 队列人群的术前 MRI 影像及勾
异背后的一个潜在机制可能是异柠檬酸脱氢酶 画完成的感兴趣区(region of interest,ROI)肿瘤标
(isocitrate dehydrogenase,IDH)的突变或神经回路中 签,肿瘤分割 ROI 由自动混合生成⁃判别方法产生,
突触和电的整合,而IDH 的突变是已知的预后影响 并由影像科医生手动纠正。最终的ROI用于提取肿
因素之一 [4-5] 。此外,肿瘤的位置也会影响癫痫的发 瘤靶区内丰富的影像特征,包括强度、体积、形态、
生,位于幕上和皮质的胶质瘤有更大的癫痫风险, 直方图和纹理参数,以及从胶质瘤生长模型中提取
额叶较枕叶胶质瘤癫痫发作风险较高 。近年来, 的空间信息和扩散特性。该数据集提供的ROI标签
[6]
分子生物学和影像技术的发展促进了对胶质瘤的 可以进行定量计算和临床研究,而无需重复手动注
早期诊断和预后评估。已有一些基因组学研究确 释,同时允许跨研究进行比较。
定了某些基因表达特征可预测DLGG患者的癫痫等 本研究首先选用最小冗余及最大相关(minimum
临床症状及生存预后 [7-9] ,但是这种预测方法是建立 redundancy⁃maximum relevance,MRMR)算法进行特
在取得组织标本并检测到特定基因表达的基础上 征与癫痫的相关性分析与排序 [14] ,即最大化特征
的,经济代价较高,也不具有人群的普适性,因此寻 与癫痫事件之间的相关性,而最小化特征与特征之
找更经济、便捷、普适和无创的预测方法是临床亟 间的相关性。研究者通过排序后选择相关性排名
待解决的任务。已有越来越多的影像组学研究表 前 10%的特征。最小冗余⁃最大相关算法使用
明患者影像资料中的影像特征有助于对癌症临床 MATLAB软件实现。
症状、病理分型、基因突变以及生存预后进行有效 随后,进一步使用最小绝对收缩和选择算子
的评估 [10-11] 。因此,基于 DLGG 患者术前 MRI 建立 (least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)
癫痫风险评分,并结合临床指标进行预后评估具有 方法进行候选预测特征的筛选。筛选出的预后影
非常重要的临床价值。本研究在DLGG患者中构建 像 特 征 用 于 如 下 建 模 :癫 痫 风 险 评 分(radiomic
了预测模型,帮助初步评估患者发生癫痫的概率以 score,Rad⁃score)=(β特征1×特征1的参数值)+(β特
及远期生存情况,有助于采取更有效和个体化的治 征 2×特征 2 的参数值)+(β特征 3×特征 3 的参数
疗策略。 值)+…+intercept。β特征代表该特征的回归系数,
intercept代表公式截断值。
1 资料和方法
使用 R 软件中的“Optimal Cutpoints”包通过约
1.1 资料 登指数寻找 Rad⁃score 的风险阈值,使用阈值将人
本研究纳入的患者临床资料来源于癌症基因组图 群分为癫痫发生高低风险群组。使用“pPOC”包
谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库,影像资料 对训练集和验证集进行模型的内部及外部验证,
来源于癌症影像数据库(the cancer imaging archive, 并 计 算 AUC 指 标 评 估 模 型 的 预 测 效 能 。 通 过
TCIA) (https://www.cancerimagingarchive.net/)。本 Kaplan⁃Meier 生存分析法比较高低风险组间的 5 年
[12]
研究筛选出低级别胶质瘤(low grade glioma,LGG) OS差异。
研究队列中在 TCIA 共享术前多序列 MRI(T1、T1⁃ 1.2.2 构建及评估癫痫预测列线图
Gd、T2、T2⁃FLAIR)资料的患者组成研究队列,纳入 将总人群队列的 Rad⁃score 结合临床特征(年

