目的：了解结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis，MTB)katG、inhA和AhpC基因突变与异烟肼(isoniazid，INH)耐药的相关性。方法：回顾性分析南京市第二医院结核科2019年1月—2021年12月住院肺结核患者MTB培养及耐药基因检测结果。结果：痰或灌洗液MTB培养及菌种鉴定为人型结核分枝杆菌1 712例，INH表型药敏测定，敏感1 308例，耐药404例；其中663例标本同时送检INH耐药基因检测(分子药敏)，99例未检出，564例分子药敏阳性，其中敏感390例，突变174例，突变位点为katG315、inhA启动子和AhpC启动子。以表型药敏作为金标准，分子药敏检出INH耐药的灵敏度为92.4%(95%CI：88.5% ~96.4%)，特异度为96.2%(95%CI：94.3%~98.1%)，阳性预测值为91.4%(95%CI：87.2%~95.5%)，阴性预测值为96.7%(95%CI： 94.9%~98.4%)，约登指数88.6%，准确率95.0%。172例表型药敏为耐药的患者检出耐药基因突变159例，分别为katG315突变 126 次，inhA 启动子突变 25 次和 AhpC 启动子突变 15 次，katG315 突变的发生率显著高于 inhA 和 AhpC 启动子(χ² =123.915、 151.891，P＜0.001)。52 例表型药敏为高度耐药的患者，katG315 突变 41 次，inhA 启动子突变 8 次，AhpC 启动子突变 7 次， katG315突变率显著高于inhA和AhpC启动子(χ² =39.510、42.146，P＜0.001)。katG315联合inhA/AhpC启动子突变菌株的高度耐药率明显高于 katG315 单独突变菌株(χ² =4.951，P=0.045)。耐多药组和准广泛耐药组 katG315 突变率显著高于耐 INH 组(χ² =5.522，P=0.018；χ² =8.422，P=0.007)。准广泛耐药组 katG315 联合 inhA/AhpC 启动子的突变率显著升高(χ² =8.916，P= 0.006)。结论：katG315是本地区INH耐药的主要突变位点，与INH高度耐药密切相关。