目的：探讨新型冠状病毒(新冠病毒)奥密克戎变异株BF.7及BA.5.2感染新生儿的临床特点，并且对感染不同亚型病毒株新生儿的临床特征进行比较。方法：选取2022年12月收治的疑似新冠病毒感染的新生儿，进行病毒核酸检测及分型， 分析核酸阳性患儿的临床特点、实验室检查及转归，比较新生儿感染不同亚型病毒株的临床特征的差异。结果：新冠病毒核酸检测阳性新生儿43例，其中无症状感染2例，轻型37例，重型4例。轻型病例均表现为上呼吸道感染症状，其中3例伴有消化道症状；重型病例中3例表现为呼吸道症状，1例表现为消化道症状。症状性感染新生儿住院时间5.0(4.0，7.0)d，所有病例均治愈出院，大多数新生儿出院后随访无异常临床表现。对病毒载量较高的33例样本行全基因测序，显示14例为奥密克戎变异株BF.7亚型，19例为BA.5.2亚型。BA.5.2病例中，2例为重型，17例为轻型，4例存在消化道症状；而BF.7组中，2例为无症状， 12例为轻型，无病例表现为消化道症状。两组患儿在发病年龄，住院时间，发热、咳嗽、惊厥发生率，实验室检查方面，差异无统计学意义(P＞0.05)。结论：新生儿感染新冠病毒奥密克戎变异株后，临床以轻症、呼吸道症状为主，少数表现为消化道症状；感染BA.5.2亚型后，部分患儿出现消化道症状，少数患儿出现重型临床表现，奥密克戎变异株BA.5.2引起消化道症状、重症的发生率是否比BF.7更高需要进一步大样本的研究。