目的：调查南京地区乙肝病毒的基因型分布，并分析基因型与临床表现之间的相关性。方法：分别用特异引物PCR法和基因型特异探针分析（试剂盒）法两种方法测定慢性乙肝病毒感染者病毒基因型。统计分析基因型与临床表型的相关性。结果：分型结果相同的95株乙肝病毒中，32株为B型，59株为C型，1株为D型，株为BC混合型。基因型B和C在ASC中分别为7例（50％）和6例（42.86％），在CHB患者中分别为17（42.5％）和21（50％），在LC患者中分别为5（35.71%）和9（64.29%），在HCC患者中分别为3例（11.11%）和24例（88.89%）。在HCC患者中，基因型B组患者的平均年龄比C型的小。 结论：南京地区乙肝病毒有B、C、D、BC混合四种基因型，其中以C型和B型为主。与基因型B比较，基因型C乙肝病毒感染所致的肝病更严重。