目的：研究盐城市幽门螺杆菌（Helicobacter pylori，Hp）感染的流行特征，并探讨Hp的vacA和cagA基因型与常见胃肠疾病的关系。方法：取江苏盐城确诊的1 892例常见胃肠疾病的近幽门胃黏膜组织，培养菌株，提取基因组DNA，采用PCR法检测Hp的vacA和cagA基因型。结果：2 682例消化病患者，胃肠疾病确诊率为70.54%，发病率男性高于女性（P < 0.01）；1 892例样本，胃肠疾病Hp总感染率为41.81%，良性胃肠疾病Hp感染率之间无差异（P > 0.05），胃癌低于良性胃肠疾病，差异显著（P < 0.05）；各县区Hp的临床感染，市区感染率低于其他县区（P < 0.05），而各县区无差异（P > 0.05）；Hp基因型中，cagA阳性率盐城地区为88.85%，各市县区无差异（P > 0.05），响水达95.92%，与最高的射阳相比较，差异显著（P < 0.05）；vacA阳性率各县市区无差异（P > 0.05）；cagA和vacA均为阳性、cagA阳性而vacA阴性、cagA阴性而vacA阳性三者各县市区比较，均无差异（P > 0.05）。盐城市Hp的vac基因亚型中，各市县区均无差异（P > 0.05）。胃溃疡、复合性溃疡、胃癌和胃淋巴瘤与其他胃肠病之间，Hp的cagA阳性率比较，有差异（P < 0.05），Hp的vacA阳性率比较，差异亦显著（P < 0.01），Hp的cagA和vacA均为阳性比较，差异显著（P < 0.01），而Hp的cagA阳性和vacA阴性的比率及Hp的cagA阴性和vacA阳性的比率比较，差异无意义（P > 0.05），各种胃肠病Hp感染的vac基因亚型，各种胃肠病之间经统计学处理无差异（P > 0.05）；s1b阳性率经统计学处理无差异（P > 0.05）。结论：盐城胃肠疾病发病率男性高于女性；盐城地区市区Hp感染率低于其他县区；盐城地区Hp的vacA和cagA亚型以cagA 、vacA均阳性和cagA阴性而vacA阳性两种形式存在。