基于R shiny的法定传染病可视化分析系统的设计和初步应用
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国家自然科学基金(61901225);南京医科大学科技发展基金(2017NJMU005)


Design and preliminary application of a visual analysis system for notifiable infectious diseases based on R shiny
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    摘要:

    目的:设计1种基于R shiny的可视化分析系统,并利用它分析2004—2017年法定传染病的流行情况,从而为防控部门提供参考依据。方法:利用R shiny以及多种R包,基于人群、时间、空间、时空交互4个角度进行可视化描述并搭建可视化系统。结果:本系统绘制了2004—2017年的39种法定传染病的时间空间分布地图,以及疾病聚类、年龄分层热图;同时还对各种法定传染病进行了疾病的时间序列分析、空间自回归分析等。结论:与其他类似系统比较,设计的R shiny可视化统计分析系统操作简便,分析方法多样,提供了预测模型,有利于帮助描述传染病的流行特点,便于公共卫生人员研究。

    Abstract:

    Objective:A visual analysis system based on R Shiny was designed to analyze the prevalence of notifiable infectious diseases from 2004 to 2017,providing reference for disease control and prevention. Methods:Using R shiny and a variety of R packages,distribution was described and the visualized system was built based on four perspectives:population,time,space,and spatial-temporal interaction. Results:This system depicted spatial-temporal distribution maps of 39 notifiable diseases from 2004 to 2017,as well as disease clustering and age stratified heat maps. Meanwhile,it also performed time series analysis and spatial autoregression analysis on various notifiable infectious diseases. Conclusion:The R shiny visual analysis system has many advantages including simple operation and diverse analysis methods compared to other similar systems. And it is helpful to describe the epidemic characteristics of infectious diseases and facilitate the research of public health.

    参考文献
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    引证文献
引用本文

胡晓雯,薛铭琰,张 枫,卞子龙,吴 静,蔡奇慧.基于R shiny的法定传染病可视化分析系统的设计和初步应用[J].南京医科大学学报(自然科学版),2021,(3):444-449

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  • 收稿日期:2020-09-06
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  • 在线发布日期: 2021-04-01
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