目的：比较GeneXpert法和涂片抗酸染色法在多种样本来源的结核分枝杆菌检测中的准确性及有效性，为结核病的诊断和治疗提供依据。方法：用GeneXpert法和涂片法对766份结核及疑似结核患者的标本进行结核分枝杆菌检测，其中460例同步进行了结核培养，并对各种方法的检出阳性率进行比较。结果：766份标本分别用涂片法和GeneXpert法进行检测，涂片法的总体阳性率为24.0%，GeneXpert法的总体阳性率为40.1%，两者差异具有统计学意义（χ2=85.47，P < 0.001）。对不同标本类型的检测结果进行统计分析，473例痰液的涂片法和GeneXpert法阳性率分别为29.4%和39.1%（χ2=24.60，P < 0.01）；185例灌洗液涂片和GeneXpert阳性率分别为21.1%和53.0%（χ2=47.68，P < 0.01）；61例胸腹水涂片和GeneXpert阳性率分别为3.3%和19.7%（χ2=8.10，P < 0.01）；47例其他标本类型（包括尿液、脑脊液、大便、脓液等）涂片和GeneXpert阳性率分别为8.5%和25.5%（χ2=6.13，P < 0.05）；各种标本类型两种方法检测结果的差异均具有统计学意义。766份标本中两方法合并阳性率为43.6%。对其中的460例标本同时进行结核分枝杆菌培养，涂片法、GeneXpert法和培养法的阳性率分别为28.5%、47.0%和35.4%，3种方法之间两两比较均存在显著性差异。结论：GeneXpert法检测各种标本的阳性率明显高于涂片法，能更好地为临床结核病的诊断提供实验室依据。