目的：了解柯萨奇病毒A6（coxsackievirus A6，CV-A6）感染情况和排毒时长，指导科学制定防控策略和措施。方法：制定病例定义，搜索病例。经过知情同意，采集某幼儿园所有病例和罹患率较高的小1班、中2班全体儿童的咽拭子和肛拭子标本，RT-PCR检测肠道病毒核酸，对检测阳性的儿童，每间隔1周再次采集标本开展检测，直至连续两次均为阴性时终止采样。结果：儿童罹患率为8.2%（17/208），发现隐性感染者17例。小1班和中2班流行曲线都呈现单峰分布，卫生学调查排除饮食和饮水传播。病原检测显示为CV-A6型肠道病毒核酸阳性。检测阳性者中隐性感染比例为52%（95%CI：34%~69%）。排毒时长中位数为18 d（95%CI：16~25 d），最短为1周内（4 d），最长为5.5周（39 d），Log-rank检验显示病例与隐性感染者、男性与女性、咽部与肠道排毒时长差异无统计学意义（P > 0.05）。结论：此轮由CV-A6肠道病毒引起的手足口病暴发疫情中，CV-A6隐性感染比例高，排毒时间长。建议提高监测敏感性，病例解除隔离返园（校）、班级复课后应开展持续的健康监测和防控措施。