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通讯作者:

谢婕,E-mail:jiexie@njmu.edu.cn;

叶岚,lanye@njmu.edu.cn

中图分类号:R394.33

文献标识码:A

文章编号:1007-4368(2023)06-749-07

DOI:10.7655/NYDXBNS20230601

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目录contents

    摘要

    目的:建立快速、高效制备小鼠睾丸基因敲降的平台。方法:设计和构建靶向睾丸特异性表达基因Sox30转录本的 shRNA表达载体(pSliencer-GFP-shSox30)及其对照质粒(pSliencer-GFP-shScramble),与慢病毒颗粒包装后通过网微注射转导至出生24 d小鼠睾丸生精小管管腔,利用免疫荧光等检测慢病毒敲降鼠体内靶向基因的效率及敲降Sox30后对生殖细胞发育的影响。结果:慢病毒处理敲降后,相比对照组小鼠,shSox30病毒敲降组小鼠睾丸组织中Sox30蛋白表达水平显著下调,生精管腔中圆形精子发育阻滞在2~3步,Ⅶ~Ⅷ期生精管腔中无长型精子。结论:shRNA慢病毒有效降低小鼠睾丸靶基因的表达水平,在制备睾丸特定基因敲降动物模型中具有巨大优势。

    Abstract

    Objective:The current study aims to establish an efficient and fast method for in vivo knockdown of endogenous genes in mouse testis. Methods:Lentiviral vector(pSliencer -GFP - shSox30)along with the control vector(pSliencer -GFP - shScramble)were designed and constructed. These lentiviral particles were microinjected into the mouse testis at postnatal day 24. Immunofluorescence and histological analysis was performed to evaluate the functional consequences in mouse testis upon Sox30 knockdown. Results:After the shSox30 lentiviral particles treatment,Sox30 protein was substantially decreased in mouse testis. Immunofluorescence of testis sections revealed that many spermatids were arrested at step 2-3. Histological examination of testis sections revealed that elongated spermatids were absent in seminiferous tubules at stage Ⅶ-Ⅷ. Conclusion:The shRNA-mediated lentivirus effectively decreases the expression level of target genes in mouse testis,providing a useful platform to knockdown endogenous genes in vivo.

    关键词

    RNA干扰动物模型Sox30小鼠睾丸

    Keywords

    RNAianimal modelSox30mousetestis

  • 小鼠的精子发生是一个高度复杂且有序的过程,涉及多个与精子发生相关的基因[1-3]。不同的精子发生相关基因在不同的时间窗内准确而有序地表达是精子发生成功的必要条件。为了更好地研究这些基因在精子发生过程中发挥何种功能,需要研究者建立相关基因的基因敲除动物模型。近年来,有研究者基于 RNA 干扰(RNA interference, RNAi)现象开发基因敲减平台,通过构建pSliencer⁃ GFP⁃shRNA 表达载体,并递送至小鼠睾丸内,成功敲降目的基因的表达[4]

  • RNAi是指小干扰 RNA(small interfering RNA,siRNA)诱发导致的同源mRNA高效特异性降解,从而引起基因表达沉默的现象[5]。siRNA结合至RNA 诱导的沉默复合物(RNA⁃induced silencing complex,RISC)[6-7],再释放siRNA的随从链从而激活 RISC。激活后的RISC在siRNA的引导链的指导下降解其同源互补的mRNA,从而沉默特定基因的表达[8]。shRNA(short hairpin RNA)载体在细胞核内转录为pri⁃shRNA(primary shRNA),然后在双链RNA结合蛋白DGCR8 和 Drosha 蛋白的加工下形成 pre ⁃ shRNA(precursor shRNA)[9]。pre⁃shRNA 在 Exportin⁃5 等蛋白因子的协助下从细胞核转运至细胞质[10]。细胞质中的 pre⁃shRNA在Dicer酶等蛋白因子加工下去除其茎环结构成为siRNA,从而启动RNAi过程来沉默目的基因表达[11]。基于这一原理,有研究者设计靶向特定序列的shRNA敲降载体,从而诱导RNA特异性降解[12]

  • 传统的基因敲除动物模型一般使用CRISPR/Cas9等基因编辑技术进行遗传学模型的构建[13]。即使 CRISPR/Cas9 技术经过多年发展已经趋于成熟,但仍存在耗时较长、费用较高、不能在特定时间点敲除目的基因,以及脱靶效应等诸多问题[14]。同时,某些基因的敲除小鼠模型存在胚胎死亡现象,常导致实验人员无法得到敲除小鼠。为了规避这些问题,需要研究者开发一个快速、特异、安全的睾丸原位基因敲减平台。近些年来,很多研究通过向睾丸递送 siRNA[15]或反义寡核苷酸(antisense oli⁃ gonucleotides,ASO)[16]来完成睾丸特定基因的敲减。虽然向小鼠睾丸递送 siRNA 和 ASO 可以规避 CRISPR/Cas9等基因技术存在的问题,但也存在着作用时间维持较短的问题[17]。shRNA敲降载体具有表达shRNA的元件,可以通过慢病毒整合到基因组上稳定表达。研究者可以向小鼠睾丸递送shRNA慢病毒敲降载体基因来维持稳定、长效的基因表达沉默。本研究通过构建靶向Sox30基因的shRNA慢病毒敲降载体,通过网微注射进入出生24 d小鼠睾丸来敲降 Sox30基因转录本,观察Sox30蛋白是否可被持续敲降,及生精管腔中生殖细胞是否有发育异常现象。

  • 1 材料和方法

  • 1.1 材料

  • 实验所使用的小鼠均为 24日龄C57BL/6J(SPF级)雄性小鼠(南京医科大学实验动物中心),本研究经南京医科大学实验动物福利伦理委员会批准。Oligo(上海生工公司);限制性内切酶BglⅡ、HindⅢ、XbaⅠ、XhoⅠ、CutSmart Buffer、10×NEB Buf⁃ fer3.1(NEB 公司,美国);FastPure Gel DNA Extrac⁃ tion Mini Kit(南京 Vazyme 公司);EndoFree Mini Plasmid Kit Ⅱ(TIANGEN公司,美国);胰酶、胎牛血清、DMEM(Gibco公司,美国);琼脂糖(上海生工公司),TRIzol(Thermo Fisher Scientific 公司,美国);RT reagent Kit(TaKaRa 公司,日本);DAPI(Sigma 公司,美国);花生凝集素(peanut agglutinin,PNA) (Vector Labs公司,美国),EGFP抗体、Sox30抗体、二抗(Abclonal公司,美国)。

  • 1.2 方法

  • 1.2.1 Oligos退火形成双链

  • 将公司合成的shSox30⁃oligo1和shSox30⁃oligo2 用高压灭菌后的ddH2O溶解。按照4 μL oligo1、4 μL oligo2、2μL 10×NEB buffer2、10μL ddH2O配置退火体系。95℃水浴退火5 min,自然冷却至室温,4℃保存。

  • 1.2.2 载体线性化

  • 空载环状的 pSilencer 载体按照 2 μg pSilencer 载体、1 μL XbaⅠ内切酶、1μL XhoⅠ内切酶、5 μL CutSmart Buffer,再加 ddH2O 补齐至 50 μL 体系,37℃水浴 3 h。将酶切后的产物在 1%琼脂糖凝胶中电泳30 min,使用DNA凝胶回收试剂盒回收目的产物。空载的pSuper载体分两步进行酶切,先按照 2 μg pSuper载体、1 μL BglⅡ内切酶、5 μL 10×NEB Buffer 3.1,加 ddH2O 补齐至 50 μL 体系,37℃水浴 3 h。线性产物使用试剂盒纯化后,再按照 2 μg pSuper线性载体、1 μL HindⅢ内切酶、5μL 10×NEB Buffer2.1,加 ddH2O 补齐至 50μL 体系,37℃水浴 3 h。1%琼脂糖凝胶中电泳30 min,使用DNA凝胶回收试剂盒纯化产物得到双酶切的线性pSuper产物。同样地,pSuper⁃shSox30按照pSuper酶切体系酶切。

  • 1.2.3 pSuper⁃shSox30 与 pSliencer⁃GFP⁃shSox30 的连接与鉴定

  • 20 ng线性pSuper载体、1 μL 10×T4 Buffer、1 μLT4 DNALigase、再加双链 Oligos 补足至 10 μL 体系, 16℃过夜连接。连接产物转化,涂氨苄抗性平板,挑单克隆菌落,经菌落PCR后初步选取阳性菌落送测序验证。测序验证成功连接的pSuper⁃shSox30,酶切(同1.2.2)回收小片段,与线性pSilencer按照 20 ng pSilencer、20 ng pSupersh⁃shSox30 小片段、1 μL 10× T4 Buffer、1 μL T4 DNA Ligase、ddH2O 补至 10 μL,16℃过夜连接。连接产物转化,挑取单克隆菌落测序验证。

  • 表1 shSox30核苷酸序列

  • Table1 The oligonucleotide sequences of shSox30

  • 1.2.4 293T细胞培养与转染

  • 293T 细胞用含 10%胎牛血清、100 U/mL 青霉素、100 U/mL 链霉素的 DMEM 培养基于 37℃、5% CO2的恒温培养箱常规培养,每1~2 d换液1次,当细胞密度达 70%~80%时转染。按照 2.5 μg 质粒、 50 μL 0.5 mmol/L CaCl2、100 μL 2×HBS,加水补齐至 200 μL配置转染试剂。转染后36~48 h收样。空白组为未转染质粒组,过表达组为单转 Sox30 过表达质粒 PRK5⁃HA⁃Sox30,对照组为 Sox30 过表达质粒 PRK5⁃ HA ⁃ Sox30 与 shScramble 共转染,实验组为 Sox30过表达质粒PRK5⁃HA⁃Sox30分别与shSox30⁃1、 shSox30⁃2共转染。

  • 1.2.5 RNA提取与RT⁃qPCR

  • 细胞加入TRIzol试剂,冰上研磨至组织充分裂解, 12 000 r/min 4℃离心 30 min,取上清并加入 200 μL 氯仿,剧烈摇晃后室温静置 3 min,12 000 r/min 4℃ 离心 30 min,取上清并加入等体积的异丙醇,静置 10 min 后 12 000 r/min 4℃离心 15 min,75%乙醇清洗沉淀后加入适量 DEPC水溶解 RNA。通过紫外可见分光光度计检测 RNA浓度和纯度;采用TaKaRa的 PrimeScript RT reagent Kit逆转录试剂盒合成 cDNA, qPCR反应程序:95℃ 30 s,95℃ 5 s,60℃ 30 s。

  • 1.2.6 慢病毒包装与网微注射

  • 病毒上清溶液在4℃、50 000 g转速下离心90 min 以获得高滴度的慢病毒。再使用高滴度的慢病毒包装 pSilencer⁃GFP⁃shSox30 敲降载体形成慢病毒敲降载体。慢病毒敲降载体与台盼蓝染液混合后使用毛细管注射进入出生 24 d 的小鼠睾丸生精小管。

  • 1.2.7 免疫荧光检测

  • TBS清洗组织切片后用 1%TBST配制的含 10% 鸡血清的封闭液室温封闭 1 h,一抗稀释液(EGPF 抗体1∶500)4℃过夜孵育,加入二抗稀释液(PNA+ 绿色荧光二抗1∶100)37℃孵育 1 h,TBS清洗 3次后滴加DAPI封片,荧光显微镜拍片保存。

  • 1.3 统计学方法

  • 实验数据结果采用GraphPad Prism7软件分析,符合正态分布的定量数据结果以均数±标准差(x- ± s)表示。两组间比较采用 t 检验,多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用 Dunnett⁃t 检验,P <0.05为差异有统计学意义。

  • 2 结果

  • 2.1 shRNA载体的构建

  • 为了成功敲降小鼠睾丸内 Sox30 基因的表达,将特异性shRNA靶标序列分别设计在Sox30基因的 1号外显子和5号外显子区域(图1A)。利用同源重组方法构建pSliencer⁃GFP⁃shSox30⁃1,pSliencer⁃GFP ⁃shSox30⁃2敲减载体和pSliencer⁃GFP⁃shScramble对照载体,转化进原核细胞 DH5α后 PCR 筛选 sense⁃ Loop⁃antisense片段插入成功的阳性单克隆菌落,通用引物H1和CMV⁃R进行PCR扩增,目的条带为426 bp (图1B、C)。阳性菌落提取质粒进行测序,Sense⁃ Loop⁃Antisense序列测序结果正确的pSliencer⁃GFP⁃ shSox30⁃1和pSliencer⁃GFP⁃shSox30⁃2质粒用作后续敲降实验(图1D)。

  • 2.2 shRNA敲降效率的验证

  • Sox30 是生殖细胞特异表达的转录因子,为了在体外验证两条 shRNA 的敲降效率,将构建好的 pSliencer⁃GFP⁃shScramble、pSliencer⁃GFP⁃shSox30⁃1 或 pSliencer⁃GFP⁃shSox30⁃2 重组质粒分别与 Sox30 过表达PRK5⁃HA⁃Sox30质粒共转入293T细胞中,未转染的细胞作为空白对照组。转染后继续培养36 h 后收取细胞样品进行 RT ⁃ qPCR 和 Western blot 实验。重组质粒带有 EGFP 标签,荧光显微镜下发现 50%以上的293T细胞都是EGFP阳性细胞(图2A),且实验组和对照组间的阳性细胞比例差异无统计学意义(图2B)。RT⁃qPCR实验分别检测空白对照组、过表达组、对照组、实验组 1、实验组 2 中 Sox30 基因的 mRNA 水平,结果显示两组实验组的 Sox30 转录本表达量显著下降,仅为过表达组的30%~40% (图2C)。Western blot结果显示两组实验组中Sox30 蛋白表达量下降,约为过表达组的 40%~50%(图2D)。其中实验组2在Sox30 mRNA水平和蛋白水平的敲降效率更高,用于后续睾丸组织病毒注射实验。

  • 2.3 Sox30敲降小鼠模型的构建及验证

  • 根据细胞实验中 shSox30 的敲减效率结果,选取敲减效率较高的pSliencer⁃GFP⁃shSox30⁃2重组质粒用于构建小鼠敲降模型。小鼠出生后 18 d 睾丸生精管腔发育至圆形精子阶段,在第24天完成发育并逐步过渡至长型精子阶段。为了探究Sox30敲降对精子变形过程的影响,选取出生后24 d的野生型雄鼠,通过网微注射将 pSliencer⁃GFP⁃shSox30⁃2 重组质粒注射至小鼠生精小管中,在重组质粒持续表达并敲降 Sox30 转录本 48 h 及 7 d 后,收集小鼠睾丸样品。本研究中提取小鼠睾丸总蛋白和 RNA,分别进行 RT⁃qPCR 和 Western blot 实验,系统验证睾丸组织中 Sox30 在 mRNA 水平和蛋白水平的敲降效率。发现注射 48 h 后,实验组中 Sox30 基因 mRNA 水平下降,仅为对照组的 20%,蛋白表达量约为对照组的一半,注射7 d后,实验组中Sox30基因 mRNA 水平为对照组的 60%~70%,蛋白表达水平降低(图3A、B)。

  • A:shRNA设计模式图及序列;B:pSilencer⁃GFP⁃shSox30慢病毒表达载体构建策略,GFP表达由CMV(cytomegalovirus)启动子驱动,shSox30 表达由H1启动子驱动,LTR(long terminal repeats,长末端重复序列);C:左图为pSliencer⁃GFP⁃shSox30⁃1连接产物菌落PCR结果,其中:2、3、4、 6、7、9、12、14成功连接;右图为pSliencer⁃GFP⁃shSox30⁃2连接产物菌落PCR结果,其中:1、5、6、7成功连接;箭头所指为成功连接后的目的片段;D:pSliencer⁃GFP⁃shSox30测序结果;Sense序列为识别靶标mRNA的部分,Loop序列可以形成shRNA的茎环结构,Antisense序列为Sense序列的互补序列。

  • 图1 shRNA设计模式图及载体构建

  • Figure1 Schematic illustration of shRNA and the result of pSliencer⁃GFP⁃shSox30 expression constructed

  • Sox蛋白家族分为A~H亚型。Sox30属于Sox H 亚家族,且为唯一成员。为了明确 shSox30 敲减系统是否存在脱靶效应,选取与 Sox30 同源性最近的Sox D亚家族成员Sox5、Sox6,分别进行RT⁃qPCR和 Western blot 实验。同对照组相比,注射 48 h 后,实验组中 Sox5 和 Sox6 的 mRNA 水平无显著性差异,Sox5和SOX6的蛋白水平在两组中差异无统计学意义(图3C~E)。以上结果提示,本研究中的敲减体系不存在脱靶效应。

  • 2.4 Sox30敲降小鼠生殖表型观察

  • 选取注射后 48 h 的对照组和实验组睾丸制备组织切片,根据 EGFP 在生殖细胞中的荧光信号明确 shRNA 感染的细胞类型。结果显示,注射 48 h 后,在前细线期精母细胞(preleptotene,PL)、偶线期精母细胞(zygotene,Zyg)、粗线期精母细胞(pachy⁃ tene,Pac)、圆形精子细胞(round spermatid,RS)、减数第一次分裂中期细胞(metaphase I,MI)以及睾丸体细胞支持细胞(sertoli,Ser)中观察到绿色荧光信号(图4A)。以上提示本研究中的shRNA敲降系统成功感染多类型生殖细胞。进一步选取注射后7 d的对照组和实验组睾丸制备成组织切片,观察圆形精子发育进程。PNA可特异性识别圆形精子顶体蛋白,根据顶体蛋白覆盖面角度可区分圆形精子的发育时期。圆形精子发育至 2~3 步时顶体蛋白染色呈 1~2 个小点,发育至4~6步时顶体蛋白覆盖面角度逐渐延展至120°。免疫荧光结果显示,实验组中生精管腔内圆形精子发育阻滞在2~3步,无法正常发育至长型精子阶段(图4B)。苏木素⁃伊红染色结果显示,实验组睾丸生精小管Ⅶ~Ⅷ管腔中明显缺少长型精子(图4C)。

  • A:293T细胞转染后绿色荧光蛋白表达情况,标尺为100 μm(×100);B:对照组和实验组中荧光信号阳性细胞统计(n=3);C:shSox30干扰效率的RT⁃qPCR鉴定(两组比较,***P <0.001,n=3);D:shSox30干扰效率的Western blot鉴定。

  • 图2 评估shRNA介导的基因敲降效率

  • Figure2 Evaluation of shRNA mediated knock⁃down efficiency

  • 3 讨论

  • 本研究特异性设计靶向 Sox30 基因转录本的 shRNA序列,将shRNA构建进入pSilencer载体中形成pSliencer⁃GFP⁃shSox30敲降载体。利用慢病毒包装系统形成侵染能力较强的慢病毒敲降载体,并通过网微注射将慢病毒敲降载体注射进出生 24 d 雄鼠睾丸的输出小管,使其进入生精小管管腔。处理 48 h和7 d后,分别收集小鼠睾丸进行实验验证。本研究利用 RT⁃qPCR、Western blot 实验,从体外和体内水平验证shRNA体系具备高效敲减效率,且敲减效率至少可持续1周。采用PNA进行免疫荧光,结合睾丸组织免疫组化实验,证实了该体系成功敲降生殖细胞重要转录因子 Sox30 的表达,观察到圆形精子发育阻滞在第2~3步,Ⅶ~Ⅷ期生精管腔中无长型精子,实验组中产生了与 Sox30 全敲雄性小鼠类似的生殖表型。

  • 精子发生是一个连续且有序的生理过程,涉及精原干细胞的自我更新、精母细胞的减数分裂,以及单倍体精子的变形过程[18-19]。某一精子发生相关基因可能在精子发生的多个阶段都发挥功能。传统的基因敲除模型可能在生精细胞发育分化的较早阶段就敲除了目的基因而导致精子发生阻滞在早期阶段,导致无法研究这一基因在精子发生晚期阶段的表型和功能。借助本平台可以根据实验需要,在第一波生精波发生的相应时间点将慢病毒敲降载体注射进入小鼠睾丸生精管腔中,从而可以达到在特定时间点完成目的基因的敲降工作。传统的基因敲除模型通过CRISPR/Cas9等基因编辑技术进行基因打靶工作,但是此技术存在脱靶效应。同时,基因编辑技术是在基因组层面上进行操作,基因打靶脱靶至基因组其他基因位点后可能导致不可逆的功能和表型改变。而且,脱靶后的位点很难被检测到,可能会产生实验者无法解释的实验结果。慢病毒敲降平台在基因敲降应用上具有显著优势。一方面,该平台靶向转录组mRNA设计shR⁃ NA 敲降序列,即使出现脱靶效应也不会改变小鼠的基因组序列,产生可遗传的变异;另一方面,慢病毒敲降载体注射至小鼠睾丸生精小管中,仅在注射部位局部发挥敲降功能,并不会通过血睾屏障传递至全身,脱靶效应也只发生在睾丸中。虽然直接注射siRNA或者反义寡核苷酸也可以达到敲减基因表达的功能,但是有研究指出siRNA在注射后48 h达到最高敲降效率,此后由于无法持续表达扩增而慢慢失效。而本研究注射的是shRNA载体,在侵染细胞后会迅速入核并在细胞核内持续表达加工形成前体shRNA,再转位至胞质经过加工获得siRNA,敲降持续时间较久。

  • A:RT⁃qPCR检测感染48 h和7 d后睾丸中Sox30 mRNA水平(两组比较,*P <0.05,**P <0.01,n=3);B:Western blot检测感染48 h和7 d后睾丸中Sox30蛋白表达水平;C、D:RT⁃qPCR检测感染48 h后睾丸中Sox家族同源基因Sox5(C)和Sox6(D)mRNA水平(n=3);E:Western blot检测感染48 h后睾丸中Sox家族同源蛋白表达水平。对照组为注射shScramble,实验组为注射shSox30。

  • 图3 Sox30敲降小鼠睾丸mRNA和蛋白表达水平

  • Figure3 The expression of mRNA and protein level from mouse testis treated with shSox30 lentivirus

  • A:荧光显微镜观察睾丸组织中 shRNA 感染的细胞类型,标尺为 20 μm(×200);B:PNA 染色观察圆形精子发育情况,标尺为 20 μm (×200)。PNA红色信号为圆形精子顶体蛋白,DAPI蓝色信号为细胞核组份。C:伊红⁃苏木素染色观察睾丸组织整体发育情况,标尺为20 μm (×200)。Ser为支持细胞,PL为前细线期精母细胞,Zyg为偶线期精母细胞,Pac为粗线期精母细胞,RS为圆形精子细胞,MI为减数第一次分裂中期细胞。对照组为注射shScramble,实验组为注射shSox30。

  • 图4 Sox30敲降雄鼠生殖表型分析

  • Figure4 Analysis of the reproductive phenotype of male mice with Sox30 knockdown

  • 本研究前期已构建 Sox30 基因全身性敲除小鼠,并系统阐述了Sox30全敲小鼠的睾丸表型,以及 Sox30 在精子发生过程中的作用机制。在 Sox30 全敲小鼠睾丸中,精子发生阻滞在2~3步的圆形精子阶段。然而Sox30蛋白的表达一直持续到精子变形的晚期,Sox30全敲小鼠模型无法研究其在精子变形的中晚期是否发挥作用。因此,利用慢病毒敲降平台构建的Sox30敲降小鼠模型为研究Sox30在精子变形晚期的功能机制奠定了研究基础。

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