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通讯作者:

周国平,E-mail:guopzhou@126.com

中图分类号:R730.231

文献标识码:A

文章编号:1007-4368(2023)11-1487-07

DOI:10.7655/NYDXBNS20231102

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目录contents

    摘要

    目的:研究信号转导和转录激活因子1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)对癌症相关生长抑制特异性基因6(growth arrest specific 6,Gas6)的影响及其机制。方法:应用数据库预测乳腺癌的基因聚类分析结果,并预测Gas6 与STAT1在多种癌症中的相关性;通过染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)实验检测STAT1是否可与Gas6 启动子结合,应用数据库预测STAT1在Gas6启动子上的结合位点并突变其关键碱基,通过双萤光素酶报告基因实验检测结合位点突变对Gas6启动子活性的影响,同时分别检测敲低或过表达STAT1对Gas6启动子和突变的Gas6启动子活性的影响;通过实时荧光定量PCR技术和蛋白质免疫印迹技术分别检测敲低或过表达STAT1对 Gas6 mRNA及蛋白表达的影响。结果: Gas6基因在乳腺癌中高表达;Gas6与STAT1在多种癌症中有正相关趋势;Gas6启动子序列包含STAT1的结合位点,并且有调控Gas6启动子活性的功能性结合位点。转录因子STAT1可在转录水平对癌症相关基因Gas6进行正向调控。结论:癌症相关基因Gas6是转录因子STAT1的直接靶基因。

    Abstract

    Objective:The current study aims to investigate the effect and mechanism of signal transducer and activator of transcription 1(STAT1)on cancer - related gene Gas6. Methods:The database was used to predict the results of the gene cluster analysis of breast cancer,and to predict the correlation between Gas6 and STAT1 in multiple cancers. The binding of STAT1 to Gas6 promoter was tested by chromatin immunoprecipitation(ChIP)assays. The binding sites of STAT1 on Gas6 promoter were predicted by bioinformatics analysis and identified by mutation plasmid construction,and the effects of binding site mutation on activity of Gas6 promoter was detected by dual luciferase reporter assay. The effects of knockdown and overexpression of STAT1 on Gas6 mRNA and protein expression were measured by qRT-PCR and Western blot,respectively. Results:Gas6 was a highly expressed gene in breast cancer. Gas6 was positively associated with STAT1 in multiple cancers. The Gas6 promoter contained binding sites of STAT1. STAT1 positively regulateed Gas6 at transcriptional levels. Conclusion:The cancer related gene Gas6 is a direct target gene for transcription factor STAT1.

    关键词

    Gas6STAT1启动子转录调控癌症

  • 癌症是当前全球广泛关注的健康问题,具有慢性发展和致死倾向两大特征。近年来,癌症的发病率和致死率迅速上升,已成为中国最常见的疾病死因,在美国是仅次于心脏病的第二大疾病死因[1]。与癌症发病相关的主要风险因素包括遗传、吸烟、饮酒、肥胖、不健康的饮食习惯和运动量不足等[2]。根据 2020 年全球癌症统计数据,乳腺癌已超过肺癌,成为世界上最常见的癌症[3-4],同时是女性癌症相关死亡的主要原因[4-6]。但目前对癌症的治疗,如手术切除、放疗、化疗和靶向治疗,通常需要较长的周期,不良反应较大,复发率较高[7]。因此,有必要探究影响癌症进展的潜在分子机制,并以此提供新的诊疗方法。

  • 生长抑制特异性基因6(growth arrest specific 6, Gas6)编码一种可与受体酪氨酸激酶Axl、Mer和Tyro3 结合的维生素 K 依赖性分泌型蛋白。细胞因子 Gas6 通过与 TAM(Tyro3⁃Axl⁃Mer)受体结合激活下游信号通路(如PI3K、PLCγ、ERK和NF⁃κB)以调节细胞存活、增殖、分化、迁移、黏附和凋亡[8]。研究表明, Gas6通过诱导肿瘤相关巨噬细胞转化为免疫抑制的 M2 样表型促进癌症进展[9-10],这些肿瘤包括乳腺癌、肺癌[11]、骨肉瘤、肝癌和肾细胞癌等,并且Gas6/Axl的表达水平与乳腺癌的不良临床结局相关[9]

  • 据此,本研究通过染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)实验检测信号转导和转录激活因子 1(signal transducer and activator of tran⁃ scription 1,STAT1)是否与Gas6启动子结合,将含人 Gas6启动子或STAT1结合位点突变的Gas6启动子的萤光素酶报告质粒转染至 HEK⁃293T 细胞,同时敲低或过表达转录因子STAT1,应用双萤光素酶报告基因系统检测Gas6启动子的活性变化。在HEK⁃ 293T细胞中敲低或过表达转录因子STAT1,应用实时荧光定量 PCR 和蛋白质免疫印迹技术分别检测 Gas6 mRNA 和蛋白表达。本研究探讨了转录因子 STAT1对癌症相关基因Gas6的调控,为阐明Gas6在癌症中的作用和机制奠定了基础。

  • 1 材料和方法

  • 1.1 材料

  • 人胚肾细胞(HEK⁃293T)、pRL⁃TK(海肾萤光素酶报告质粒)为本实验室保存;DMEM培养基(Gibco 公司,美国);含 Gas6 启动子及点突变的 Gas6 启动子的萤光素酶报告质粒、STAT1 过表达质粒 pENTER⁃STAT1及pENTER、引物、STAT1的小干扰 RNA(small interfering RNA,siRNA)siSTAT1 及 siNC (南京擎科生物科技有限公司);SDS⁃PAGE 凝胶配制试剂盒、Western blot 一抗二抗去除液(强碱性)、 ChIP检测试剂盒(上海碧云天生物技术有限公司); RNA 提取试剂盒、去内毒素小量质粒提取试剂盒 (Omega公司,美国);双萤光素酶报告基因检测试剂盒(Promega 公司,美国);Gas6、GAPDH、STAT1 一抗及羊抗兔二抗(武汉三鹰生物技术有限公司);总蛋白提取试剂盒(南京凯基生物技术股份有限公司); 全DNA提取试剂盒(北京天根生化科技有限公司)。

  • 1.2 方法

  • 1.2.1 生信分析

  • 用 GEO 数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ gds 和 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles)预测乳腺癌的高表达及低表达基因聚类分析结果;用 PROMO 数据库(http://alggen.lsi.upc.es/cgi ⁃ bin/pro⁃ mo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3)和JASPAR 数据库(https://jaspar.genereg.net)预测 Gas6 启动子的转录因子结合位点;用 GEPIA 数据库(http://ge⁃ pia.cancer⁃pku.cn)预测Gas6和STAT1在多种癌症中的相关性。

  • 1.2.2 细胞培养

  • 在37℃、5% CO2培养箱中将HEK⁃293T细胞置于含1%青链霉素双抗和10%胎牛血清的DMEM高糖培养基中培养,2~3 d换液1次,细胞密度为85%~100%时传代或冻存,均使用对数期生长细胞。

  • 1.2.3 ChIP实验

  • 使用 ChIP 试剂盒,依据其说明书进行相关实验及分析。在 1%甲醛中固定 HEK⁃293T 细胞约 10 min,充分裂解细胞,超声剪切基因组 DNA 为 200~800 bp大小(去除交联并进行琼脂糖凝胶电泳观察DNA大小)。将合格样品分别进行特异性免疫沉淀并去除交联,选择相应引物进行 qRT ⁃ PCR 或 PCR,进行琼脂糖凝胶电泳实验并观察结果,相关引物见表1。

  • 表1 PCR引物序列

  • Table1 Sequences of PCR primers

  • 1.2.4 萤光素酶报告基因重组质粒的构建与鉴定

  • 应用美国国立生物技术信息中心数据库NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene)查询人 Gas6 基因(GenBank 编号:NC_000013.11)转录起始位点 (transcription start site,TSS)上游1 400 bp、下游50 bp 的片段序列。将人 Gas6 基因的转录起始位点碱基编号为+ 1。将人 Gas6 启动子片段(-1 400~+50 bp)插入 pGL3⁃Basic 载体以构建质粒 pGas6⁃ 1450 并测序,应用 NCBI 的 blast(https://blast.ncbi. nlm.nih.gov/Blast.cgi)工具鉴定该质粒。并以pGas6⁃1450 作为模板构建 STAT1 结合位点突变的启动子重组质粒,将其命名为 pGas6 ⁃ 1450 mut1、pGas6 ⁃ 1450 mut2、pGas6⁃1450 mut1+2(合称为 pGas6⁃1450 mut)并测序鉴定,突变序列见图1。

  • 1.2.5 双萤光素酶报告基因实验

  • 在96孔板中培养HEK⁃293T细胞(1×104 个/孔), 24 h 后将待测质粒(100 ng)pGas6⁃1450 或 pGas6⁃ 1450 mut与pRL⁃TK质粒(4 ng)共同转染至细胞中,再培养24 h后检测启动子活性;将待测质粒和siRNA 50 nmol/L或过表达质粒(100 ng)与pRL⁃TK 质粒共同转染至细胞,检测敲低或过表达STAT1对启动子活性的影响;使用荧光光度计和双萤光素酶检测试剂盒检测启动子活性,启动子活性统一标准化为 pRL⁃TK的活性。结果重复3次及以上,siRNA序列见表2。

  • 图1 突变序列

  • Figure1 The mutated sequences

  • 表2 siRNA序列

  • Table2 Sequences of siRNA

  • 1.2.6 实时荧光定量PCR(qRT⁃PCR)

  • 在12孔板中培养HEK⁃293T细胞(1×105 个/孔)。 24 h 后将 siRNA、过表达质粒和其对照试剂转染至细胞中,再培养24 h后检测敲低和过表达STAT1对 Gas6 mRNA 表达的影响。使用 Omega RNA 提取试剂盒提取细胞总 RNA,再将其均逆转录为第 1 链 cDNA,并进行 qRT⁃PCR 实验(反应条件:95℃ 10 min;95℃ 15 s、60℃ 30 s、72℃ 30 s,循环 40 次;95℃ 15 s,60℃ 1 min,95℃ 15 s)。该实验以 GAPDH 作为内参进行 3 次以上,并以 2-ΔΔCt评估 mRNA相对表达水平,相关引物序列见表3。

  • 1.2.7 Western blot实验

  • 在6孔板中培养HEK⁃293T细胞(2×105 个/孔), 24 h 后将 siRNA、过表达质粒和其对照试剂转染至细胞中,再培养48 h后使用总蛋白提取试剂盒提取细胞总蛋白,加入适量上样缓冲液后 100℃煮沸 10 min。制备 10% SDS⁃PAGE 凝胶,加样、电泳(电泳条件:80 V,30 min;150 V,40 min)并在快速转膜液中(转膜条件:常温恒流400 mA,30 min)将蛋白转至 PVDF膜,用快速封闭液室温摇床封闭30 min后4℃摇床孵育一抗10~12 h,TBST洗膜3次(20 min/次),室温摇床孵育二抗1 h,再洗膜后曝光显影。完成第一次化学发光检测后分别用蒸馏水、一抗二抗去除液、蒸馏水各漂洗 5 min 后进行封闭等后续操作以完成第二次化学发光检测。该实验以GAPDH作为内参并重复3次以上。

  • 表3 qRT⁃PCR引物序列

  • Table3 Sequences of qRT⁃PCR primers

  • 1.3 统计学方法

  • 应用GraphPad Prism6与SPSS 25.0软件对实验数据进行统计分析。实验结果以均数±标准差(x-±s) 表示,两组间比较采用t检验。P<0.05为差异有统计学意义。

  • 2 结果

  • 2.1 生信分析

  • 应用GEO数据库分析得出乳腺癌的高表达(红色)及低表达(绿色)基因(图2A),其中Gas6属于高表达基因(图2B);应用 PROMO 数据库和 JASPAR 数据库预测出转录因子STAT1与Gas6启动子有多个结合位点,以此设计了两个突变位点使Gas6不能与相应转录因子结合;应用 GEPIA 数据库分析 STAT1 和 Gas6 在多种癌症中的相关性,结果表明 STAT1与Gas6在多种癌症中有正相关趋势(P均< 0.05,图2C~E)。

  • 2.2 转录因子STAT1与Gas6启动子结合

  • 为探究 STAT1 是否与 Gas6 启动子结合,使用HEK⁃293T细胞进行ChIP实验,结果表明:STAT1抗体可沉淀结合在Gas6启动子上的蛋白,而阴性对照抗体IgG不能沉淀结合该启动子的蛋白,即转录因子STAT1在Gas6启动子上有结合位点(图3)。

  • 图2 生物信息分析结果

  • Figure2 Results of the bioinformatic analysis

  • 2.3 点突变对人Gas6启动子活性的影响及STAT1 对Gas6启动子活性的影响

  • 将pGas6⁃1450与pGas6⁃1450 mut进行测序并鉴定,结果显示与目标序列一致,表明含人Gas6启动子及STAT1 结合位点突变启动子的萤光素酶报告基因质粒构建成功。在工具细胞 HEK⁃293T 中进行双萤光素酶报告基因实验,结果表明:与 pGas6⁃ 1450组相比,pGas6⁃1450 mut1组的相对萤光素酶活性变化无统计学意义,而 pGas6 ⁃ 1450 mut2 组与 pGas6⁃1450 mut1+2组的相对萤光素酶活性均明显降低(P<0.01,P<0.05,图4A);与相应对照组相比,pGas6⁃1450 组与 pGas6⁃1450 mut1 组在敲低或过表达 STAT1 后相对萤光素酶活性明显降低或升高(P<0.05,P<0.05),而 pGas6 ⁃ 1450 mut2 组与 pGas6⁃1450 mut1+2组在敲低或过表达STAT1后相对萤光素酶活性的变化差异无统计学意义(图4B、C)。

  • 2.4 STAT1在mRNA水平对人Gas6基因的调控

  • 为探究STAT1对人Gas6 mRNA表达的调控,在工具细胞 HEK⁃293T 中分别敲低和过表达 STAT1,并通过 qRT⁃PCR 检测 STAT1 的敲低效率和过表达效率,同时检测敲低 STAT1 与过表达 STAT1 后 Gas6 mRNA 表达的变化。结果表明:与 siNC 组相比,siSTAT1 组 STAT1 mRNA 表达显著降低(P< 0.01),同时 Gas6 mRNA 表达明显降低(P<0.05,图5A);与 pENTER 组相比,pENTER⁃STAT1 组 STAT1 mRNA表达显著升高(P<0.01),同时Gas6 mRNA表达明显升高(P<0.05,图5B)。

  • 图3 STAT1可与Gas6启动子结合

  • Figure3 STAT1 can bind to the promoter of Gas6

  • 图4 点突变对人Gas6启动子活性的影响及敲低或过表达STAT1对Gas6启动子活性的影响

  • Figure4 Effect of mutations on human Gas6 promoter activity and the effect of knockdown or overexpression of STAT1 on Gas6 promoter activity

  • 2.5 STAT1在蛋白水平对人Gas6基因的调控

  • 为探究 STAT1 在蛋白水平对 Gas6 基因表达的调控,在 HEK ⁃ 293T 细胞中分别敲低和过表达 STAT1,通过Western blot检测STAT1敲低效率和过表达效率及 Gas6 蛋白表达的改变情况。结果表明:与 siNC 组相比,siSTAT1 组 STAT1 与 Gas6 的蛋白表达均明显降低(P<0.05,P<0.05,图6A、B); 与 pENTER 组相比,pSTAT1 组 STAT1 与 Gas6 的蛋白表达均明显升高(P<0.01,P<0.05,图6C、D)。

  • 3 讨论

  • 真核生物基因的表达调控是多层次的,包括转录水平、转录后水平、翻译水平、翻译后水平的调控[12],是生物体内细胞分化、形态发生和个体发育的分子基础。基因转录水平的调控对研究相关疾病的分子机制及其预防、诊断、治疗等具有重要意义[13]。而目前对Gas6基因的研究主要集中在蛋白水平,关于Gas6基因启动子的研究却很少。本研究通过ChIP实验证明转录因子STAT1可与Gas6启动子结合,同时对可能的潜在结合位点进行点突变,明确转录因子STAT1在Gas6启动子上的结合位点,同时通过敲低和过表达STAT1证明其在转录水平对Gas6基因进行调控。

  • 生长抑制特异性基因(growth arrest ⁃ specific transcripts,GAS)家族成员众多,在细胞生长、分化、凋亡、细胞周期调控等方面具有重要功能。Gas6基因是GAS基因家族中的一员,它编码一种可刺激细胞增殖的蛋白质并在多种癌症中过度表达,被认为是预后不良的标志物之一。Gas6还与肥胖、肝纤维化、静脉血栓栓塞、系统性红斑狼疮、肾小球肾炎、慢性肾脏病、先兆子痫等疾病相关。大量研究表明 Gas6/Axl与多种癌症的侵袭性相关,包括乳腺癌、肺癌、胃肠癌、头颈部癌、肝细胞癌、肾细胞癌、胶质瘤、胰腺癌、甲状腺癌等,并在多种肉瘤、急性髓系白血病和其他血液系统恶性肿瘤中过表达[14]。 Gas6蛋白通过激活癌细胞上的Axl受体,调节肿瘤微环境各组分(包括癌细胞、内皮细胞和免疫细胞)之间的细胞信号级联和细胞通讯,导致肝脏癌细胞转移性生长,并且诱导胰腺癌细胞的上皮⁃间充质转化,从而促进癌细胞在体内侵袭和扩散[15]。研究表明,Axl 是针对耐药性和免疫抑制的重要分子靶标[14]

  • 图5 STAT1在mRNA水平调控人Gas6基因表达

  • Figure5 STAT1 regulates the human Gas6 gene at mRNA level

  • 转录因子是控制细胞基因组表达的一类必不可少的蛋白质,已成为癌症研究和治疗的热点[5]。 STAT家族成员被受体相关激酶磷酸化,形成同源或异源二聚体,这些二聚体在细胞核中作为转录激活因子介导多种基因的表达[16]。STAT1属于STAT家族成员之一,该蛋白可被多种配体激活,包括干扰素⁃α、干扰素⁃γ和白介素⁃6等,在对病毒、真菌和分枝杆菌病原体的免疫反应中起重要作用[17-18]。STAT1 通常被认为是肿瘤抑制因子,但有研究认为它也可以促进肿瘤发生[19],其在胃癌、结直肠癌中起致癌作用[20],并且与胃癌的免疫浸润和预后不良相关[21]。由此可见,研究STAT1对探究相关疾病的分子机制具有重要意义。

  • 本研究显示 STAT1 作为转录因子可与癌症相关基因 Gas6 启动子结合而在转录水平正向调控 Gas6的表达,为后续研究提供了新的思路和方向。

  • 图6 STAT1在蛋白水平调控人Gas6基因表达

  • Figure6 STAT1 regulates the human Gas6 gene at the protein level

  • 参考文献

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