文章摘要
宋慧慧,李 原,葛 峥,黄培林.基于数据挖掘分析 FOXO1在成熟 B细胞肿瘤中的表达及靶基因预测[J].南京医科大学学报,2018,(12):1692~1695
基于数据挖掘分析 FOXO1在成熟 B细胞肿瘤中的表达及靶基因预测
The analysis of FOXO1 in mature B⁃cell neoplasms and its target genes based on datamining
投稿时间:2018-05-13  
DOI:10.7655/NYDXBNS20181206
中文关键词: FOXO1  数据挖掘  成熟B细胞肿瘤  数据库
英文关键词: FOXO1  data mining  mature B⁃cell neoplasms  database
基金项目:南京市医学科技发展专项资金资助(YKK15251)
作者单位
宋慧慧 东南大学附属中大医院血液内科江苏 南京 210009东南大学医学院江苏 南京 210009 
李 原 东南大学医学院江苏 南京 210009 
葛 峥 东南大学附属中大医院血液内科江苏 南京 210009东南大学医学院江苏 南京 210009 
黄培林 东南大学医学院江苏 南京 210009 
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中文摘要:
      目的:利用数据挖掘分析 FOXO1 在B细胞肿瘤中的表达情况,并进一步探讨 FOXO1对 B细胞肿瘤的影响。方法:利用 Oncomine 数据库分析 FOXO1 基因在B细胞肿瘤中 mRNA 水平的变化。通过 BIOGPS分析人体正常组织和其相应的肿瘤组织中 FOXO1 基因的表达差异。利用GEPIA做 FOXO1 基因的表达水平与B细胞肿瘤患者生存期的相关性分析。在 String?DB 数据库中探索 FOXO1 基因在细胞信号转导通路中的位置以及与其关系密切的上下游基因。结果:与正常组织相比,B细胞肿瘤组织中 FOXO1 基因在 mRNA 水平呈低表达,FOXO1 基因的表达水平与B细胞肿瘤患者的总体生存时间无明显相关性(Log?rank P=0.39)。EP300、JUN、MYC、STAT1、FOS、SPI1、E2F1等基因与 FOXO1 有明显或潜在的相互作用。结论:大样本数据挖掘能迅速获取B细胞肿瘤组织中 FOXO1 表达的相关信息,为探索FOXO1在B细胞肿瘤发生发展中的作用提供科学的理论基础。
英文摘要:
      Objective:To explore the expression and significance of FOXO1 in mature B?cell neoplasms. Methods:The expression of FOXO1 in mature B?cell neoplasms was mined in Oncomine database. The different expressions of FOXO1 between the normal tissue and B?cell neoplasms were analyzed by BIOGPS database. The survival time of patients with mature B?cell neoplasms was detected by GEPIA. The FOXO1 interacting proteins were analyzed by String?DB database. Results:At the mRNA level,FOXO1 was lower in mature B?cell neoplasms than in normal tissue,and the expression level was not notable correlated with the prognosis of mature B?cell neoplasms(Logrank P=0.39). FOXO1 related proteins are EP300、JUN、MYC、STAT1、FOS、SPI1、E2F,etc. Conclusion:The information of FOXO1 expression in mature B?cell neoplasms could be quickly extracted by using data mining and would be an scientific and theoretical support for the further research.
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