目的：了解新疆维吾尔自治区克孜勒苏柯尔克孜自治州（克州地区）人群主要生活方式和健康卫生问题，为提高人群健康水平提供依据。方法：基于克州地区基本公共卫生服务系统中2016年全民健康体检大数据，评价体检人群健康异常情况，以脂肪肝这一最主要的健康问题为代表，分析体检人群脂肪肝患病率、人群分布特征以及可能的影响因素。结果：在42.5万总体检人群中，23.3%有1项及以上的健康评价异常情况，其中检出率排名最靠前的为脂肪肝，检出率为4.35%，男性明显高于女性，随着年龄增长逐步上升，在45~＜55岁年龄组达到高峰，随后又逐步下降，但仍维持在较高水平。经logistic多因素分析，在调整性别、年龄、地区和民族等因素后，素食为主的饮食习惯是脂肪肝患病的保护因素（OR=0.84，95%CI：0.79~0.89，P < 0.001）；相对于无饮酒史者，有饮酒史的体检人群发生脂肪肝的风险提高（OR=1.85，95%CI：1.73~1.98，P < 0.001）。结论：克州地区体检人群脂肪肝是最主要的健康问题，需要进一步改善饮食习惯，减少饮酒人群比例。