文章摘要
张舒婷,刁鹏飞,金致纯,严 斌,王 林.基于TCGA数据库分析ITGA5 mRNA在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其预后价值[J].南京医科大学学报,2020,(6):832~838
基于TCGA数据库分析ITGA5 mRNA在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其预后价值
Expression and prognostic value of ITGA5 mRNA in head and neck squamous cell carcinoma based on TCGA database
投稿时间:2019-08-26  
DOI:10.7655/NYDXBNS20200611
中文关键词: 头颈部鳞状细胞癌  整合素α5  癌症基因组图谱
英文关键词: HNSCC  ITGA5  cancer genome atlas
基金项目:国家自然科学基金(81571005);江苏省高等学校自然科学研究重大项目(17KJA320003);江苏省“333高层次人才培养工程”(BRA2016511);江苏省高校优势学科建设工程资助项目
作者单位
张舒婷 南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室南京医科大学附属口腔医院正畸科江苏 南京 210029 
刁鹏飞 南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室南京医科大学附属口腔医院正畸科江苏 南京 210029 
金致纯 南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室南京医科大学附属口腔医院正畸科江苏 南京 210029 
严 斌 南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室南京医科大学附属口腔医院正畸科江苏 南京 210029 
王 林 南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室南京医科大学附属口腔医院正畸科江苏 南京 210029 
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中文摘要:
      目的:分析头颈部鳞状细胞癌中整合素α5(integrin α5,ITGA5)的表达与预后的相关性。方法:利用TCGA 数据库中头颈部鳞状细胞癌的RNA表达数据集和相应的临床随访信息,提取mRNA表达谱进行差异分析,并在GEO数据库中进一步验证。结果:通过TCGA表达谱数据分析发现ITGA5 mRNA在肿瘤组织中的表达明显高于正常组织,且Kaplan?Meier 分析显示ITGA5高表达组的患者总体存活时间明显缩短(P < 0.05)。在GEO数据库中验证后证实ITGA5 mRNA表达水平是1个独立的预后指标,对预测患者生存具有较好的敏感性和特异性。结论:ITGA5与头颈部鳞状细胞癌患者的生存预后密切相关,可能作为新的预后标志物。
英文摘要:
      Objective:This study aims to analyze the correlation between the expression of integrin α5(ITGA5) and prognosis of head and neck squamous cell carcinoma(HNSCC). Methods:The RNA?seq data and relevant clinical follow?up information of HNSCC in TCGA database were used to establish mRNA spectrum for variation analysis,further verification was conducted in GEO databases. Results:The mRNA expression of ITGA5 was found significantly higher in tumor tissues compared to normal tissues,and the overall survival of patients by Kaplan?Meier analyses in ITGA5 high?expression group was notably shortened(P < 0.05). The expression level of ITGA5 could be treated as an independent prognostic indicator since it was verified in GEO databases to be sensitive and specific for patient survival and prognosis. Conclusion:ITGA5 is closely related to the survival and prognosis of HNSCC patients and may serve as a novel prognostic biomarker.
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