文章摘要
胡晓雯,薛铭琰,张 枫,卞子龙,吴 静,蔡奇慧.基于R shiny的法定传染病可视化分析系统的设计和初步应用[J].南京医科大学学报,2021,(3):444~449
基于R shiny的法定传染病可视化分析系统的设计和初步应用
Design and preliminary application of a visual analysis system for notifiable infectious diseases based on R shiny
投稿时间:2020-09-06  
DOI:10.7655/NYDXBNS20210324
中文关键词: shiny  传染病  可视化  时空分析
英文关键词: shiny  infectious diseases  visualization  spatial⁃temporal analysis
基金项目:国家自然科学基金(61901225);南京医科大学科技发展基金(2017NJMU005)
作者单位
胡晓雯 南京医科大学生物医学工程与信息学院江苏 南京 211166 
薛铭琰 南京医科大学公共卫生学院江苏 南京 211166 
张 枫 南京医科大学生物医学工程与信息学院江苏 南京 211166 
卞子龙 南京医科大学公共卫生学院江苏 南京 211166
浙江大学公共卫生学院浙江 杭州 310058 
吴 静 南京医科大学生物医学工程与信息学院江苏 南京 211166 
蔡奇慧 南京医科大学生物医学工程与信息学院江苏 南京 211166 
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中文摘要:
      目的:设计1种基于R shiny的可视化分析系统,并利用它分析2004—2017年法定传染病的流行情况,从而为防控部门提供参考依据。方法:利用R shiny以及多种R包,基于人群、时间、空间、时空交互4个角度进行可视化描述并搭建可视化系统。结果:本系统绘制了2004—2017年的39种法定传染病的时间空间分布地图,以及疾病聚类、年龄分层热图;同时还对各种法定传染病进行了疾病的时间序列分析、空间自回归分析等。结论:与其他类似系统比较,设计的R shiny可视化统计分析系统操作简便,分析方法多样,提供了预测模型,有利于帮助描述传染病的流行特点,便于公共卫生人员研究。
英文摘要:
      Objective:A visual analysis system based on R Shiny was designed to analyze the prevalence of notifiable infectious diseases from 2004 to 2017,providing reference for disease control and prevention. Methods:Using R shiny and a variety of R packages,distribution was described and the visualized system was built based on four perspectives:population,time,space,and spatial?temporal interaction. Results:This system depicted spatial?temporal distribution maps of 39 notifiable diseases from 2004 to 2017,as well as disease clustering and age stratified heat maps. Meanwhile,it also performed time series analysis and spatial autoregression analysis on various notifiable infectious diseases. Conclusion:The R shiny visual analysis system has many advantages including simple operation and diverse analysis methods compared to other similar systems. And it is helpful to describe the epidemic characteristics of infectious diseases and facilitate the research of public health.
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