Page 44 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第12期
               ·1750 ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2021年12月


                                  6                             SRC和RAC1(图6)。
                                                                2.5  Hub基因的预后信息
                                                                     本研究在 bc⁃GenExMiner 数据库中采用生存曲
                                                                线评价了 5 个 Hub 基因在乳腺癌组织中总生存期
                                  4
                                                                (OS)的预后价值。在乳腺癌患者中,乳腺癌患者中
                -Lg P                                           高 表 达 SRC 基 因 的 OS 更 差(HR=1.16,95% CI:

                                                                1.07~1.27,P=0.000 7),高表达 JUN(HR=0.89,95%
                                  2
                                                                CI:0.81~0.97,P=0.006 4)和 CDC42(HR=0.87,95%
                                                                CI:0.79~0.95,P=0.002 4)基因的OS更佳(图7)。

                                                                3  讨 论

              -4         -2         0         2         4            目前,高 MD 和患乳腺癌的风险增加之间的关
                                  Log2FC                                   [16-21]
                   红色为表达上调的DEGs,绿色代表下调的DEGs。                    联是公认的          。然而,具体发生和发展的分子机
                         图2 所有差异基因的火山图                          制仍未充分阐明。随着高通量测序技术的发展,在
                 Figure 2 Volcanic map of all the different genes  基因组水平探讨致密型乳腺的女性易患乳腺癌的


                       GO:0046934 phosphatidylinositol⁃4,5⁃bisphosphate 3⁃kinase activity
                                     GO:0004713 protein tyrosine kinase activity               MF
                             GO:0005088 Ras guanyl⁃nucleotide exchange factor activity
                                                                                               CC
                                            GO:0005516 calmodulin binding
                                                                                               BP
                                       GO:0008134 transcription factor binding
                                               GO:0003779 actin binding
                                               GO:0005524 ATP binding
                                            GO:0031965 nuclear membrane
                                               GO:0005856 cytoskeleton
                                               GO:0030054 cell junction
                                              GO:0005925 focal adhesion
                                                GO:0009986 cell surface
                                GO:0005887 integral component of plasma membrane
                                            GO:0005886 plasma membrane
                                               GO:0001525 angiogenesis
                                              GO:0000165 MAPK cascade
                                               GO:0007155 cell adhesion
                                     GO:0035556 intracellular signal transduction
                                         GO:0045087 innate immune response
                                  GO:0043547 positive regulation of GTPase activity
                                            GO:0007165 signal transduction
                                                               0    50    100  150   200   250
                                                                        Number of gene hits
                                                   图3   DEG的GO富集通路图
                                          Figure 3 Enrichment analysis of GO in DEG hy GO


                                                                                       [22]
                                                                告和数据系统(BI⁃RADS) 。在1项美国佛蒙特州
                      hsa04010:MAPK signaling pathway
                                                                人口研究中,使用 BI⁃RADS 乳房密度分类,乳房极
                       hsa04014:Ras signaling pathway
                       hsa05205:Proteoglycans in cancer
                                                                致密的女性被诊断出患有乳腺癌的相对风险为 4.6
                  hsa04810:Regulation of actin cytoskeleton
                                                                (95%CI:1.7~12.6) 。
                                                                                 [23]
              hsa04080:Neuroactive ligand⁃receptor interaction
                                                                     本研究通过生物信息学的方法预测致密型乳
                       hsa04015:Rap1 signaling pathway
                    hsa04151:P13K⁃Akt signaling pathway         腺的女性乳腺癌高发的潜在治疗和预后评估靶
                         hsa05200:Pathways in cancer
                                                                点。最终筛选出5个关键基因,分别为EGFR、JUN、
                                          0    10   20   30     CDC42、SRC、RAC1。EGFR属于受体酪氨酸激酶的
                                             Number of gene hits
                       图4   DEG的KEGG富集通路图                       ErbB家族,主要生理功能是调节上皮组织的发育和
                 Figure 4  Enrichment analysis of KEGG in DEG   体内平衡     [24] 。EGFR经常在不同类型的人类癌症中
              分子机制成为可能,进而可以寻找更多的基因靶                             发生突变或过表达,是肿瘤发生的驱动因素,并且是
              标。评估乳房钼靶MD的最常用工具是乳房成像报                            目前临床实践中采用的多种癌症疗法的靶标                      [25-26] 。
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