Page 44 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第12期
·1750 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年12月
6 SRC和RAC1(图6)。
2.5 Hub基因的预后信息
本研究在 bc⁃GenExMiner 数据库中采用生存曲
线评价了 5 个 Hub 基因在乳腺癌组织中总生存期
4
(OS)的预后价值。在乳腺癌患者中,乳腺癌患者中
-Lg P 高 表 达 SRC 基 因 的 OS 更 差(HR=1.16,95% CI:
1.07~1.27,P=0.000 7),高表达 JUN(HR=0.89,95%
2
CI:0.81~0.97,P=0.006 4)和 CDC42(HR=0.87,95%
CI:0.79~0.95,P=0.002 4)基因的OS更佳(图7)。
3 讨 论
-4 -2 0 2 4 目前,高 MD 和患乳腺癌的风险增加之间的关
Log2FC [16-21]
红色为表达上调的DEGs,绿色代表下调的DEGs。 联是公认的 。然而,具体发生和发展的分子机
图2 所有差异基因的火山图 制仍未充分阐明。随着高通量测序技术的发展,在
Figure 2 Volcanic map of all the different genes 基因组水平探讨致密型乳腺的女性易患乳腺癌的
GO:0046934 phosphatidylinositol⁃4,5⁃bisphosphate 3⁃kinase activity
GO:0004713 protein tyrosine kinase activity MF
GO:0005088 Ras guanyl⁃nucleotide exchange factor activity
CC
GO:0005516 calmodulin binding
BP
GO:0008134 transcription factor binding
GO:0003779 actin binding
GO:0005524 ATP binding
GO:0031965 nuclear membrane
GO:0005856 cytoskeleton
GO:0030054 cell junction
GO:0005925 focal adhesion
GO:0009986 cell surface
GO:0005887 integral component of plasma membrane
GO:0005886 plasma membrane
GO:0001525 angiogenesis
GO:0000165 MAPK cascade
GO:0007155 cell adhesion
GO:0035556 intracellular signal transduction
GO:0045087 innate immune response
GO:0043547 positive regulation of GTPase activity
GO:0007165 signal transduction
0 50 100 150 200 250
Number of gene hits
图3 DEG的GO富集通路图
Figure 3 Enrichment analysis of GO in DEG hy GO
[22]
告和数据系统(BI⁃RADS) 。在1项美国佛蒙特州
hsa04010:MAPK signaling pathway
人口研究中,使用 BI⁃RADS 乳房密度分类,乳房极
hsa04014:Ras signaling pathway
hsa05205:Proteoglycans in cancer
致密的女性被诊断出患有乳腺癌的相对风险为 4.6
hsa04810:Regulation of actin cytoskeleton
(95%CI:1.7~12.6) 。
[23]
hsa04080:Neuroactive ligand⁃receptor interaction
本研究通过生物信息学的方法预测致密型乳
hsa04015:Rap1 signaling pathway
hsa04151:P13K⁃Akt signaling pathway 腺的女性乳腺癌高发的潜在治疗和预后评估靶
hsa05200:Pathways in cancer
点。最终筛选出5个关键基因,分别为EGFR、JUN、
0 10 20 30 CDC42、SRC、RAC1。EGFR属于受体酪氨酸激酶的
Number of gene hits
图4 DEG的KEGG富集通路图 ErbB家族,主要生理功能是调节上皮组织的发育和
Figure 4 Enrichment analysis of KEGG in DEG 体内平衡 [24] 。EGFR经常在不同类型的人类癌症中
分子机制成为可能,进而可以寻找更多的基因靶 发生突变或过表达,是肿瘤发生的驱动因素,并且是
标。评估乳房钼靶MD的最常用工具是乳房成像报 目前临床实践中采用的多种癌症疗法的靶标 [25-26] 。