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第41卷第12期 徐文秀,蒋梦萍,王丹丹,等. 应用生物信息学分析正常女性不同乳腺密度差异表达基因[J].
2021年12月 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(12):1747-1752,1773 ·1751 ·
A B
WSB1 HIST1H2BM
MYLIP
CUL3
CBX2 AGO4
ASB4
SMURF2
CCNF
REST JUN
TRIM4
HERC6
TNRC6C
HIST1H2BB
ANAPC5
FBXO17
UBE3D EED
图5 PPI网络的排名前2的模块1(A)和模块2(B)
Figure 5 Top 2 modules of PPI network
Radiality JUN 属于激活蛋白⁃1(AP⁃1)转录因子家族,参与许
多细胞活动,例如增殖、凋亡、存活、肿瘤发生和组织
1
Stress 形态发生 。在多种肿瘤的发生和发展中起着至关
[27]
1
1 MNC
4 重要的作用,包括恶性黑色素瘤、鼻咽癌等 [28-29] 。SRC
1 1 原癌基因是1种蛋白质酪氨酸激酶,在细胞生长、分
1 2
5 2 裂、迁移和存活信号通路中起关键作用 。RAC1是
[30]
5 小鸟苷三磷酸酶(GTPase)Rho家族的成员,属于Ras
[31]
超家族 。RAC1定位于染色体7p22,并包含7个外
1
[32]
3 显子,全长29 kb ,对许多细胞活动至关重要,例如
Closeness 吞噬作用、黏附和运动、细胞增殖、轴突和树突生长以
Degree
[33]
通过cytoHubba 5种分类方法中前15个基因的重叠,确定了5个 及血管生成 。CDC42也是1个与多种人类癌症相
Hub基因。 关的小鸟苷三磷酸酶,与上皮间质转化、细胞周期
图6 5种分类方法的韦恩图 进程、迁移/侵袭、肿瘤生长、血管生成和致癌转化有
Figure 6 Venn diagrams for 5 classifi caticn methods 关 [34] 。此外,在数据库中分析了这 5 个 Hub 基因与
EGFR CDC42 RAC1
1.0 1.0 1.0
0.8 0.8 0.8
生存率 0.6 生存率 0.6 生存率 0.6 ≤ median
0.4
0.4
0.4
≤ median
>median ≤ median >median
>median
0.2 0.2 0.2
HR:0.89;95% CI:0.82⁃0.97 HR:0.87;95% CI:0.79⁃0.95 HR:1.06;95% CI:0.97⁃1.16
P⁃value=0.009 0 P⁃value=0.002 4 P⁃value=0.169 0
0.0 0.0 0.0
0 2 4 6 8 10 12 14 0 2 4 6 8 10 12 14 0 2 4 6 8 10 12 14
时间(年) 时间(年) 时间(年)
JUN SRC
1.0 1.0
0.8 0.8
生存率 0.6 生存率 0.6
0.4
0.4
≤ median
>median
>median ≤ median
0.2 0.2
HR:0.89;95% CI:0.81⁃0.97 HR:1.16;95% CI:1.07⁃1.27
P⁃value=0.006 4 P⁃value=0.000 7
0.0 0.0
0 2 4 6 8 10 12 14 0 2 4 6 8 10 12 14
时间(年) 时间(年)
图7 Hub基因的Kaplan⁃Meier生存曲线
Figure 7 Survival curves of Hub gene