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第41卷第12期         宋正阳,王小娟,钱恩芳,等. Y染色体单倍群SNP复合检测体系的构建及其在家系排查中的
                 2021年12月               应用研究[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(12):1759-1766                  ·1763 ·


                A
                              50         60         70         80         90         100        110        120
                 2 200
                 2 000
                 1 800
                 1 600
                 1 400
                 1 200
                 1 000
                  800
                  600
                  400
                  200
                    0
                        1,C  25,A  2,T  3,A  5,A  6,C  9,C  10,A  11,A  4,G  12,A  27,C  14,C  16,A  19,G  22,G  26,A 17,C  24,C  13,C  21,T 7,C  29,C  32,G  30,T  33,G  31,T
                             35,A  15,C  8,A  28,T  23,C  20,A  36,A  18,C     37,A               34,A
                B      40         50         60          70         80         90         100         110
                 8 000
                 7 000

                 6 000
                 5 000
                 4 000
                 3 000
                 2 000

                 1 000
                    0
                       1,A  3,A  5,G  6,C  7,T  9,G  10,A  11,T  14,A  16,A  18,G  19,T  21,C 22,G  23,G  25,A 26,C  27,A  28,A 30,A  31,C  32,T 33,A  4,C 35,G  36,C  2,G
                                     8,C     12,G 13,C  15,C  17,C  20,G  24,G        29,C        34,G      37,C
                                     A:核心体系模板量为10 ng的分型图谱;B:O体系模板量为10 ng的分型图谱。
                                                 图2   男性标准品DNA 2800分型图谱
                                         Figure 2  The typing profile of male standard DNA 2800


                说明该体系可以用于常用检材的检测(可扫 OSID                          其 Y⁃SNP 单倍群均属于 N1b⁃F2930。在图 3A 中 3
                码查看附图4)。⑤抗女性成分干扰:在男性与女性                           例样本聚在一起。
                成分比例为1∶1、1∶10、1∶100时,核心体系及O体系                         P2 家系 6 例男性样本共检出 4 种 Y⁃STR 单倍
                的出峰率均为100%。所出分型峰均与男性成分单                           型,其中单倍型H2共3例,H3共1例,H4共1例,H5
                独检测结果相同(可扫 OSID 码查看附图 5)。⑥种                       共 1 例。以单倍型 H2 为参考,其与 H3 之间的容差
                属特异性:所检测的灵长类动物黑猩猩检出52个位                           为 1,与 H4 之间的容差为 4,与 H5 之间的容差为 5,
                点峰,恒河猴检出 30 个位点峰,其余样本均未检出                         累计突变步长分别为 1、4、5 步。所有样本之间有 5
                特异性峰(可扫OSID码查看附图6)。                               个 Y ⁃ STR 基 因 座(DYS439、GATA ⁃ H4、DYS518、

                2.3  家系排查应用                                       DYS576、DYS385)的突变步长均为 1 步,其余 21 个
                    来自 4 个社会学家系的 20 例男性样本均获得                      基 因 座(DYS19、DYS389I/II、DYS390、DYS391、

                完整的 Y⁃SNP 与 Y⁃STR 分型,Y⁃SNP 单倍群和 Y⁃                DYS392、DYS393、DYS437、DYS438、DYS448、
                STR 单倍型分型结果可扫 OSID 码查看附表 4。家                      DYS456、DYS458、DYS635、DYS444、DYS447、
                系内各样本间网络图以及结合家系调研信息绘制                             DYS460、DYS481、DYS508、DYS533、DYS643、

                的家谱图见图 3,网络图对家系内 Y⁃STR 以及 Y⁃                      DYF387S1、DYS449)分型一致。6例样本Y⁃SNP 单
                SNP的变异情况进行可视化。Y⁃STR单倍型编号对                         倍群均属于N1b⁃F2930。在图3B中,3例H2单倍型
                应的分型可扫OSID码查看附表4。                                 的个体聚在一起,与 H3 单倍型个体之间容差相差
                    P1家系3例男性样本Y⁃STR 单倍型完全一致,                      1,与 H4 单倍型个体之间容差相差 3,与 H5 单倍型
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