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第41卷第4期 张志华,郑必霞,林 谦. 2例Ⅲ型糖原累积病患儿基因型和表型分析[J].
2021年4月 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(04):634-636 ·635 ·
本为NM_000028。 N219D 错义突变为新发突变,在大型正常人群测序
基因测序结果:病例1未筛查到糖原累积病Ⅰa 数据库ExAC 和 1000G中均未发现该突变。我们利
型G6PC基因外显子及其侧翼序列突变。发现患儿 用 ConSurf(http://consurftest.tau.ac.il)对该突变所在
AGL 基因型结果为 c.644A>T/c.655A>G 复合杂合型 氨基酸位点保守性进行了分析,发现 219 位天冬酰
突变(图1A、B)。进一步对其突变来源进行筛查,发 胺为高度保守区。Polyphen2(http://genetics.bwh.
现其父亲携带 AGL 基因 c.655A>G 杂合突变,母亲 harvard.edu/pph2/)软件预测显示其为可能致病性突
携带c.644A>T杂合突变。c.644A>T系错义突变,导 变(图2)。同时SIFT和Mutationtaster网站预测结果
致 AGL 蛋白第 215 位天冬氨酸突变为缬氨酸(p. 也均显示该突变为致病性突变。
D215V),已有文献在 GSDⅢ患儿中检测到该突变, 近期随访,2 例病例患儿均定期消化科及营养
为致病性突变。该突变未见数据库及文献报道。 科门诊随访,生玉米淀粉饮食(1.5~2.0 g/kg,每天
c.655A>G系错义突变,导致AGL蛋白第219位天冬 4 次)及高蛋白低糖饮食治疗中。病例1患儿已4岁
酰胺突变为天冬氨酸(p.N219D)。 7 个月,血糖监测正常,体格发育同正常同龄儿童,
病例2未筛查到糖原累积病Ⅰa型G6PC基因外 2019年11月复查肝脏超声提示肝肿大好转,肝右叶
显子及其侧翼序列突变。发现患儿 AGL 基因型结 斜径 95 mm,肋下 5 mm。病例 2 患儿已 5 岁 2 个月,
果为c.3142_3158delinsAA纯合突变(图1C),该突变 血糖控制基本良好,但偶有夜间空腹低血糖,近期心
系缺失插入突变,推测导致AGL蛋白第1 048~1 053 脏超声提示心室轻度肥厚,心功能正常。目前身高
位氨基酸缺失,同时在该位置插入1个天冬酰胺(p. 105 cm,体重16 kg,较正常同龄儿童低1个标准差。
C1048_F1053delinsN)。进一步对其突变来源进行
2 讨 论
筛查,发现患儿父母均为c.3142_3158delinsAA 突变
携带者。该突变未见数据库及文献报道。 1992年美国学者Yang⁃Feng 等成功将人类AGL
新发错义突变致病性分析:病例 2 携带的 p. 基因定位于 1 号染色体短臂的 2 区 1 带(1p21),
A B C
c.644A>T c.655A>G
病例1 病例1 c.3142_3158delinsAA
病例2
A/T A/G
病例1 母亲 病例1母亲 病例2母亲
A/A
A/T
病例1 父亲 病例1父亲 病例2父亲
T/T A/G
A:病例1及其父母c.644A>T/ p. D215V杂合突变测序图,父亲为野生型;B:病例1及其父母c.655A>G/ p.N219D杂合突变测序图,母亲为
野生型;C:病例2 c.3142_3158delinsAA纯合突变测序图,父母分别为杂合突变。
图1 GSDⅢ患儿AGL基因突变测序图
A The conservation scale:
211 221
I C I T D VV YNH T AA N S KW I Q E 1 2 3 4 5 6 7 8 9
Variable Average Conserved
p.N219D
B This mutation is predicted to be PROBABLY DAMAGING with a score of 0.999(sensitivity:0.14;specificity:0.99)
0.00 0.20 0.40 0.60 0.80 1.00
A:来自Uniref90数据库150种AGL蛋白同源氨基酸序列比对结果显示219位处于最高保守位置;B:Polyphen2危害性预测显示。
图2 新发错义突变p.N219D生物信息学预测