Page 48 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 48
第42卷第10期
·1390 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2022年10月
表2 江苏七地市及广东汉族人群常见HLA⁃A⁃B⁃C单倍型频率
Table 2 Common HLA⁃A⁃B⁃C haplotype in Han population from 7 prefecture⁃level cities of Jiangsu Province and Guangdong
序号 A⁃B⁃C单倍型 常州 南京 镇江 扬州 淮安 宿迁 徐州 广东
1 30∶01⁃13∶02⁃06∶02 0.070 63 0.075 91 0.059 00 0.073 66 0.111 95 0.106 07 0.098 11 < 0.01
2 33∶03⁃58∶01⁃03∶02 0.064 24 0.060 25 0.053 06 0.057 78 0.057 21 0.048 78 0.031 08 0.055 28
3 02∶07⁃46∶01⁃01∶02 0.027 73 0.025 61 0.036 32 0.032 84 0.031 19 0.024 21 0.013 51 0.086 70
4 33∶03⁃44∶03⁃14∶03 0.016 85 0.020 93 0.015 36 0.018 65 0.021 23 0.016 75 0.026 12 < 0.01
5 11∶01⁃46∶01⁃01∶02 0.014 65 0.019 39 0.015 64 0.015 06 0.009 87 0.015 55 0.010 44 0.039 84
6 11∶01⁃40∶01⁃07∶02∶01G 0.011 04 0.015 87 0.016 05 0.016 03 0.016 75 0.009 19 0.014 99 0.045 50
7 02∶01⁃46∶01⁃01∶02 0.017 99 0.015 28 0.009 71 0.014 60 0.011 21 0.010 87 0.008 43 < 0.01
8 24∶02⁃54∶01⁃01∶02 0.011 58 0.012 11 0.011 58 0.012 01 0.007 77 0.010 87 0.006 75 < 0.01
9 32∶01⁃52∶01⁃12∶02 0.006 90 0.010 42 0.007 35 0.008 39 0.011 44 0.005 29 0.008 36 < 0.01
10 24∶02⁃46∶01⁃01∶02 0.004 19 0.010 11 0.011 04 0.008 90 0.006 13 0.005 32 0.008 83 < 0.01
11 11∶01⁃51∶01⁃14∶02 0.009 08 0.009 89 0.007 33 0.008 91 0.012 42 0.005 58 0.014 63 0.017 36
12 11∶01⁃13∶01⁃03∶04 0.011 56 0.009 67 0.013 19 0.013 39 0.009 42 0.011 21 0.009 86 0.039 52
13 11∶01⁃15∶02⁃08∶01∶01G 0.015 03 0.006 91 0.016 68 0.011 50 0.009 79 0.013 64 0.009 99 0.033 57
14 02∶01⁃13∶02⁃06∶02 0.007 04 0.006 95 0.005 52 0.006 70 0.010 14 0.011 39 0.007 58 < 0.01
15 33∶03⁃44∶03⁃07∶01∶01G 0.005 21 0.008 42 0.006 32 0.006 70 0.008 48 0.010 24 0.011 08 < 0.01
16 02∶01⁃15∶11⁃03∶03 0.007 66 0.002 12 0.008 36 0.006 25 0.003 46 0.005 71 0.011 01 < 0.01
17 11∶01⁃15∶01⁃04∶01 0.008 33 0.005 63 0.011 03 0.005 57 0.006 38 0.005 37 0.005 02 < 0.01
18 11∶01⁃54∶01⁃01∶02 0.007 23 0.003 78 0.010 54 0.006 04 0.004 68 0.007 89 0.005 47 < 0.01
南京 1 常州 3
扬州 6 扬州 6
南京 1
常州 2
镇江 7
镇江 5
宿迁 2
宿迁 3 淮安 4
徐州 5
淮安 7
广东 8
徐州 4
岳阳 10
广东 8 安徽 9
0 5 10 15 20 25 0 5 10 15 20 25
图1 根据HLA⁃A⁃B⁃C单倍型频率绘制的聚类分析谱系图 图 2 根据 HLA⁃DRB1⁃DQB1 单倍型频率绘制的聚类分析
Figure 1 The clustering analysis pedigree based on HLA⁃ 谱系图
A⁃B⁃C haplotype frequency Figure 2 The clustering analysis pedigree based on HLA⁃
DRB1⁃DQB1 haplotype frequency
2.4 江苏七地市HLA⁃A⁃B⁃DRB1单倍型分析 类,而后二者再聚类。广东、重庆聚为一类,而后与
江苏七地市常见的 HLA⁃A⁃B-DRB1 单倍型分 广西聚类。
别见表 4(频率 > 0.01)。A*30:01⁃B*13:02⁃DRB1* 2.5 江苏七地市HLA⁃A⁃B⁃DRB1⁃C⁃DQB1单倍型分
07:01为江苏七地市频率最高的HLA⁃A⁃B⁃DR 单倍 析
型,与上海、辽宁、黑龙江无显著性差异 [10- 12] 江苏七地市常见的HLA⁃A⁃B⁃DRB1⁃C⁃DQB1单
(P >
0.05),与 广 东 、广 西 、重 庆 差 异 显 著 [7,13- 14] (P < 倍型分别见表 5(频率 > 0.01),频率最高单倍型均
0.05)。进一步聚类分析表明(图 3),南京、扬州、常 为A*30∶01⁃B*13∶02⁃DRB1*07∶01⁃C*06∶02⁃DQB1*
州、黑龙江、辽宁聚为一类,淮安、宿迁、徐州聚为一 02∶02,其频率显著高于广东、岳阳、浙江三地 [7-8,15]