Page 46 - 南京医科大学学报自然科学版

第42卷第10期
·1388 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2022年10月

Xuzhou，and DRB1*09∶01⁃DQB1*03∶03，DRB1*07∶01⁃DQB1*02∶02 were the top two common haplotypes in Changzhou，Yangzhou，
Zhenjiang and Nanjing. The clustering analysis showed that 7 prefecture⁃level cities in Jiangsu Province were clustered into one group.
Among the HLA⁃A⁃B⁃DRB1 haplotypes，A*30∶01⁃B*13∶02⁃DRB1*07∶01 was the most frequent haplotype in 7 prefecture⁃level cities
of Jiangsu Province，and A*33∶03⁃B*58∶01⁃DRB1*03∶01 was the second frequent A⁃B⁃DRB1 haplotype in Nanjing，Yangzhou，Huai’
an and Changzhou. The clustering analysis showed that Nanjing，Yangzhou，Changzhou，Heilongjiang and Liaoning were clustered，and
Huai’an，Suqian and Xuzhou were clustered. The most frequent HLA⁃A⁃B⁃DRB1⁃C⁃DQB1 haplotype was A*30∶01⁃B*13∶02⁃DRB1*
07∶01⁃C*06∶02⁃DQB1*02∶02 in 7 prefecture⁃level cities of Jiangsu Province，and the frequency of the haplotypes that containing A*
30∶01 ⁃ B*13∶02 ⁃ DRB1*07∶01 gradually decreased from north to south in Jiangsu Province. The clustering analysis showed that
Changzhou，Xuzhou and Nanjing were clustered together，and then clustered with Zhenjiang. Huai’an and Suqian were clustered
together，and then clustered with Xuzhou. Yueyang，Zhejiang and Guangdong were clustered together. Conclusion：On the whole，the
three prefecture ⁃ level cities in Northern Jiangsu（Suqian，Huai’an and Xuzhou）are clustered together，and the other 4 cities are
clustered together. The HLA haplotype polymorphism in Han population from 7 prefecture level cities of Jiangsu Province is more
biased to the Northern China than the Southern China.
［Key words］ HLA；haplotype frequency；clustering analysis；7 prefecture⁃level cities of Jiangsu
［J Nanjing Med Univ，2022，42（10）：1387⁃1393］

人 类 白 细 胞 抗 原（human leukocyte antigen， 宿迁 946 例、徐州 1 315 例，江苏其余六地市志愿者
HLA）基因复合体位于人类第 6 号染色体短臂上，其 的 HLA 分型由苏州血液中心实验室承担。志愿者
基因座排列顺序依次为 HLA ⁃A、C、B、DRB1、DQB1 年龄在 18~45 周岁、身体健康、符合献血条件，由江
和 DPB1，同一条染色体不同座位上的 HLA 等位基 苏省血液中心南京市血液中心及下属的采供血机
因组成 HLA 单倍型，并以单倍型的方式遗传 。由 构采集，志愿者随机、无血缘关系。
［1］
于 HLA 等位基因存在高度连锁不平衡性，单倍型 1.2 方法
检索能为造血干细胞及器官移植配型提供重要信 应用血液基因组 DNA 提取试剂盒（硅胶膜离
息，并为研究人类遗传学、民族种族演变提供科学 心柱法，北京天根生物技术有限公司）从外周血抽
［2］
依据 。此外，疾病的HLA 易感基因可能是多个等 提 DNA。然后应用聚合酶链反应⁃直接测序分型
位基因组成的基因群，单倍型可以为HLA与疾病的 （polymerase chain reaction ⁃ sequence based typing，
相关性研究提供更为准确的遗传学数据。 PCR⁃SBT）试剂盒（SeCore HLA⁃A/B/DRB1/C/DQB1
®
HLA是人类最复杂的遗传多态性系统，具有显 Locus Sequencing Kit，One⁃lammbda 公司，美国）对
著的人种、民族和地域差异。我国HLA多态性以北 HLA⁃A/B/DRB1/C/DQB1 位点进行高分辨基因分
纬30°为界，大致分为南北两大群体，江苏七地市分 型。分型操作严格按照试剂公司提供的规程进
别位于北纬30°附近，苏北人多是百越之后，还混有 行。应用 uTYPE（One⁃lammbda 公司，美国）软件分
高句丽人的血统，而苏南人多是华夏族的后裔，是 析测序结果，得出相应HLA⁃A/B/DRB1/C/DQB1位点
血统比较纯正的汉人 ［3-4］ ，因此江苏各地市 HLA 多 等位基因分型。
态性有一定差异。了解江苏七地市汉族人群 HLA 1.3 统计学方法
单倍型分布特点，能为指导中华骨髓库江苏分库无 1.3.1 Hardy⁃Weinberg平衡检验
血缘关系供者的检索，研究HLA单倍型与疾病相关 应 用 Arlequin 3.5 软 件 对 江 苏 七 地 市 A、B、
性以及江苏七地市人类遗传学提供有意义的基础 DRB1、C、DQB1位点进行Hardy⁃Weinberg检验。
性资料。 1.3.2 江苏七地市单倍型频率计算及聚类分析
采用最大期望算法（expectation⁃maximization，
1 对象和方法
EM）应用 Arlequin 3.5 软件分别计算江苏七地市
1.1 对象 HLA⁃A⁃B⁃C、DRB1⁃DQB1、A⁃B⁃DRB1、A⁃B⁃DRB1⁃C⁃
选取采样地与籍贯一致的中华骨髓库江苏分 DQB1 单倍型频率 ［5］ 。应用 SPSS 软件对江苏七地市
库志愿者11 889例（汉族），其中常州2 227例、南京 人群与国内已发表汉族人群数据进行系统聚类和
1 752例、镇江1 770例、扬州2 081例、淮安1 453例、 比较分析。国内已发表汉族人群资料的选取原则：