Page 176 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第7期
·1106 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年7月
联合 Sanger 测序法进行补充 [11] 。Sanger 验证可采 同时患者妹妹和弟弟相同位点也发生了杂合变异。
用正向测序或反向测序,反向测序峰图显示的碱基 蛋白质三维结构预测:将需要预测的蛋白序列
有 可 能 为 被 检 测 碱 基 的 反 向 互 补 序 列 。 chr5 ⁃ 导入在线软件 SWISS⁃model(https://swiss⁃model.ex⁃
78251291突变导致部分序列移码,正向测序得到的 pasy.org/interactive),选择覆盖突变位点 range 范围
图显示左侧乱峰,无法使用,故采用反向测序图。 的蛋白质同源性模型 [12-14] 。模型的一致性和相似度
最终确定致病的2个突变位点(图1):①第5位 不 低 于 30% ,可 视 化 分 析 软 件 Swiss ⁃ PdbViewer
外显子上c.979C>T,导致氨基酸改变 p.R327X,为无 (http://www.genebee.msu.su/spdbv/text/getpc.htm) [15]
义突变,变异来源于母亲;②第4位外显子上c.724_ 绘制蛋白质三维结构图,分析预测该突变位点对蛋
725insCCCTTCAGGTCC,导 致 氨 基 酸 改 变 p. 白结构的影响。既往研究证实与野生型相比,Mu⁃
H242delinsPLQVH,为整码突变,变异来源于父亲, tant1(p.R327X)因提前终止转录而产生截短的蛋
表2 验证引物信息
引物名称 引物序列(5′→3′) 退火温度(℃) 扩增产物大小(bp)
F454⁃B8_F AAAGCTATCATTCTTGCTCAATGG 58~64 506
R454⁃B8_R ATGTCTGAATAATGAAAGGCTATGTC 58~64 506
F660⁃A1_F ATAAGGCAATGCTAACCGCTC 58~64 388
R660⁃A1_R GCATAAATCTGAACTGTCTTATCCTTC 58~64 388
突变位点1:c.979C>T(p.R327X),变异来源于母亲;突变位点2:c.724_725insCCCTTCAGGTCC(p.H242delinsPLQVH)(第242位碱基移码突
变导致后位序列发生变异,此处只截取部分),来源于父亲,且患者弟弟、妹妹携带同源变异基因。
图1 ARSB基因Sanger测序图