Page 44 - 南京医科大学学报自然科学版

第42卷第1期
· 38 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2022年1月

据库，以综合得分（combined score）>0.4 为阈值，构 位、活性氧代谢、未折叠蛋白反应等；细胞组分主要
建得到续断抗OP靶点蛋白相互作用网络图（图3）。 包括高尔基体腔、球形高密度脂蛋白颗粒以及内质
网腔；分子功能主要与芳香酯酶活性、羧酸酯水解酶
F10
ADRA1A 活性和多巴胺跨膜转运体活性等有关（图 4A~C）。
F2
KEGG 通路富集结果显示，差异蛋白主要富集在与
SLC6A4
PON1 催乳素信号通路、利什曼病、结肠直肠癌等相关的
TGFB1
信号通路中（图4D）。
PTGS1 2.5 分子对接
NOS2
利 用 Cytoscape 软 件 中 的 插 Cytohubba，根 据
MAPK14
ESR2
MCC、Degree、Betweenness 等参数对 2.3 中获得的相
PTPN1
互作用网络进行分析，对得分前3位的基因取交集，
确认 MAPK14 和 TGFB1 为网络中的核心靶点。将
CA2
GSK3B MAPK14 和 TGFB1 分 别 通 过 对 接 平 台 AutoDock
BAX Vina 与续断的活性成分 Gentisin 和 beta⁃sitosterol 进
行 分 子 对 接 ，分 别 获 得 20 个 模 型 ，Gentisin 与

MAPK14（最低结合能为-6.2 kcal/mol）、beta⁃sitoster⁃
图3 续断抗骨质疏松靶蛋白相互作用网络
Figure 3 Network of XuDuan target genes on osteoporosis ol 与 TGFB1（最低结合能为-9.0 kcal/mol）的分子对
接结果显示（图5）。一般认为配体与受体结合的构
2.4 GO富集分析和KEGG通路分析结果 象稳定时能量越低，发生的作用可能性越大，结合
为了进一步明确续断抗骨质疏松的可能机制， 能≤-5 kcal/mol 时则视为成分与靶点有较好的活
利用 Enrichr 在线工具分析上述靶基因参与的主要 性，结合能≤-7 kcal/mol 时则结合活性强烈 ［24］ 。本
信号通路。GO 分析结果显示，上述交集靶点的生 研究结果说明续断的活性成分和靶标之间具有良
物过程主要包括参与调控蛋白质在细胞核中的定 好的结合能力。

A B
regulation of protein localization to nucleus（GO：1900180） arylesterase activity（GO：0004064）
positive regulation of ROS metabolic process（GO：2000379） carboxylic ester hydrolase activity（GO：0052689）
activation of signaling protein activity involved in UPR（GO：0006987） dopamine transmembrane transporter activity（GO：0005329）
positive regulation of IRE1⁃mediated UPR（GO：1903896） alpha⁃adrenergic receptor activity（GO：0004936）
extrinsic apoptotic signaling pathway（GO：00097191） typeⅡtransforming growth factor beta receptor binding（GO：0005114）
positive regulation of nuclease activity（GO：0032075） typeⅠtransforming growth factor beta receptor binding（GO：0034713）
protein carboxylation（GO：0018214） monoamine transmembrane transporter activity（GO：0008504）
peptidyl⁃glutamic acid carboxylation（GO：0017187） death domain binding（GO：0070513）
positive regulation of protein complex assembly（GO：0031334） tau⁃protein kinase activity（GO：0050321）
regulation of IRE1⁃mediated UPR（GO：1903894） dynactin binding（GO：0034452）
C D
Golgi lumen（GO：0005796） prolactin signaling pathway
spherical high⁃density lipoprotein particle（GO：0034366） leishmaniasis
endoplasmic reticulum lumen（GO：0005788） colorectal cancer
intrinsic component of external side of plasma membrane（GO：0031233） AGE⁃PAGE signaling pathway in diabetic complications
secretory granule lumen（GO：0034774） amyotrophic lateral sclerosis（ALS）
microvillus（GO：0005902） chagas disease（American trypanosomiasis）
platelet alpha granule lumen（GO：0031093） tuberculosis
mitochondrial envelope（GO：0005740） nitrogen metabolism
actin⁃based cell projection（GO：0098858） toxoplasmosis
platelet alpha granule（GO：0031091） endometrial cancer
A：靶基因参与的细胞内生物过程；B：靶基因参与的细胞分子功能；C：靶基因参与的细胞内成分构成；D：靶基因的KEGG信号通路分析。
图4 GO富集分析和KEGG通路分析
Figure 4 Enrichment analysis of GO and KEGG of XuDuan target genes on osteoporosis