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第42卷第1期 阚雪纯，何润东，葛佳颖，等. 基于网络药理学的续断抗骨质疏松分子作用机制研究［J］.
2022年1月 南京医科大学学报（自然科学版），2022，42（01）：035-040 · 37 ·

核心靶点的分子活性成分结构，使用 ChemBio 3D绘 道的成分，并且按 OB≥30%和 DL≥0.18 作为筛选续
制小分子的二维结构，并将其保存为 PDBQT 格式 断潜在活性成分的标准，共获得续断活性化合物
备用。将处理好的受体和配体分别保存为 PDB 格 8 个（表 1）。接着利用相关靶点预测技术预测上述
式备用，并在 AutoDock Vina 分子对接软件下，对续 活性成分作用靶点 53 个，再以“Osteoporosis”为关
断活性成分和重要靶蛋白进行分子对接验证。 键词，分别在GeneCards 和DisGeNET 数据库中收集
到 4 273 和 1 098 个相关疾病基因数据库作为疾病
2 结 果
靶点。将 GeneCards 和 DisGeNET 数据库中获得的
2.1 续断活性成分及其靶基因 相关化合物靶点与活性成分作用靶点取交集得到
通过 TCMSP 数据库检索有关续断中所有已报 续断作用靶点14个（图1）。

表1 经OB和DL筛选的续断活性成分
Table 1 Active ingredients of XuDuan screened by OB and DL
编号 名称 中文名 OB（%） DL
MOL003152 gentisin 龙胆根素 64.06 0.21
MOL000358 beta⁃sitosterol β⁃谷甾醇 36.91 0.75
MOL000359 sitosterol 谷甾醇 36.91 0.75
MOL009312 （E，E）⁃3，5⁃Di⁃O⁃caffeoylquinic acid （⁃）⁃3，5⁃二咖啡酰奎宁酸 48.14 0.68
MOL009317 cauloside A_qt 葳岩仙皂苷 A 43.32 0.81
MOL008188 japonine 臭山羊碱 44.11 0.25
MOL009322 sylvestroside Ⅲ 林生续断苷Ⅲ 48.02 0.53
MOL009323 sylvestroside Ⅲ_qt 林生续断苷Ⅲ_qt 56.47 0.43

NOS2 GSK3B
GeneCards DisGeNET
PON1 F2
Osteoporosis
903
F10
3 344 179 PTGS1
Gentisin
MAPK14
14
beta⁃sitosterol
PTPN1 Sylvestroside Ⅲ_qt
12 0
XuDuan ESR2

SLC6A4 CA2
27 （E，E）⁃3，5⁃Di⁃O⁃caffeoylquinic
acid
TGFB1 BAX
ADRA1A
Drug Targets
红色代表骨质疏松症，紫色代表中药续断，绿色代表续断的活
图1 续断作用靶点韦恩图 性成分，黄色代表中药⁃疾病共同靶标基因。
Figure 1 Venn diagram of XuDuan targets
图2 中药⁃成分⁃疾病⁃靶标调控网络
Figure 2 Regulation network of XuDuan⁃compound⁃
2.2 中药⁃疾病调控网络的构建和分析
disease⁃target
通过 GeneCards 和 DisGeNET 数据库获得 OP 疾
病相关靶点，并与续断作用靶点取交集后获得续断 14个靶标基因影响OP的发生。
⁃OP 疾病交集靶点 14 个。然后，利用 Cytoscape 软 2.3 续断抗骨质疏松靶蛋白相互作用网络构建与
件构建中药⁃疾病调控网络（图 2）。由图可见续断 关键靶点筛选
主要通过龙胆根素、β⁃谷甾醇、林生续断苷Ⅲ_qt 以 将疾病靶点与有效成分靶点通过韦恩图取交
及（⁃）⁃3，5⁃二咖啡酰奎宁酸等 4 种活性成分作用于 集得到的14个药物⁃疾病靶点基因导入String在线数