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第42卷第10期
·1436 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2022年10月
表2 基线水平新生儿口咽优势菌门/属的平均丰度比较
Table 2 Comparison of average abundance of dominant oropharynx microbiotas at phylum/genus level in neonates at baseline
微生物类群 纯母乳喂养组(B1,n=8) 混合喂养组(M1,n=12) P值 q值 *
门
变形菌门 24.268 33.105 0.427 0.740
厚壁菌门 14.610 09.704 0.238 0.640
拟杆菌门 04.883 05.787 0.910 0.951
放线菌门 04.402 02.993 0.238 0.640
属
链球菌属 00.830 00.586 0.427 0.792
葡萄球菌属 09.074 05.592 0.384 0.792
慢生根瘤菌属 04.957 06.796 0.734 0.922
不动杆菌属 03.516 01.109 0.678 0.922
伯克氏菌属 01.097 02.101 1.000 1.000
拟杆菌属 01.526 01.784 0.208 0.792
罗氏菌属 00.004 00.038 0.408 0.792
双歧杆菌属 00.839 00.539 0.135 0.792
孪生菌属 00.002 00.029 0.433 0.792
副拟杆菌属 00.012 00.260 1.000 1.000
*:Wilcox秩和检验,P值:两组样本丰度的秩和是否有显著差异的概率值;q值:矫正后的P值,即将检验得到的P值采用FDR做多重检验
校正得到q值。
厌氧菌丰度较前明显上升。进一步对生后第 5~7 (7.35% vs. 2.83%,P=0.792)、双歧杆菌属(4.78% vs.
天咽拭子样本中常见菌属进行定量,结果显示, 1.19%,P=0.735)、副拟杆菌属(1.41% vs. 0.24%,
罗氏菌属在纯母乳喂养组中的含量显著高于混 P=0.967)含量亦高于混合喂养组,但差异并不显
合 喂 养 组(4.33% vs. 1.58%,P=0.016),拟杆菌属 著(图 3B)。
A 80 B 50
三三三三 B1 三三三三 B1
60 三三三三 B2 三三三三 三三三三 B2
三三三三
三三三三
( % ) 40 三三三三 三三三三 ( % ) 10 8 三三三三 三三三三 三三三三
M1
M1
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
M2
三三三三
三三三三
M2
三三三三
三三三三
相对丰度 15 三三三三 三三三三 相对丰度 6 4 三三三三 三三三三
三三三三
20
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
10
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
5 三三三三 三三三三 3 2 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三 三三三三 三三三三 三三三三 1 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三
0 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三 0 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三 三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
副拟杆菌属
三三三三
三三三三
双歧杆菌属
不动杆菌属
葡萄球菌属 三三三三
三三三三
变形菌门 厚壁菌门 拟杆菌门 放线菌门 链球菌属 慢生根瘤菌属 三三三三 伯克氏菌属 拟杆菌属 罗氏菌属 孪生菌属
三三三三
三三三三
三三三三
三三三三
A:门水平,主要优势菌门;B:属水平,相对丰度百分比前10位的菌属。
图3 各组样本在门/属水平的菌群相对丰度柱状图
Figure 3 Histogram of relative abundance of each group at phylum/genus level
2.5 不同喂养组间的差异类群分析
3 讨 论
使用 STAMP 2.1.3 软件包进行统计分析,采用
Welch’s⁃t检验比较组间菌群丰度的变化。由图4可 呼吸道作为人体重要的组成部分,其特定部位
见,不同喂养组间的差异菌属均为丰度很低的罕见 的微生物定植对于婴儿呼吸道免疫功能的发育起
菌,而纯母乳喂养与混合喂养对新生儿早期口咽部 着非常重要的作用。而围生期可能是呼吸道免疫
优势菌属的影响并不显著。 介导效应形成的重要时期,有研究显示,新生儿呼