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第43卷第6期 张雯晴,田书凝,冯振卿. 单细胞RNA测序技术在非小细胞肺癌研究中的应用[J].
2023年6月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(6):864-870 ·865 ·
瘤学领域的研究和治疗格局,以免疫检查点阻断为 个复杂的综合系统。肿瘤细胞与 TME 内基质细胞
[4]
代表的免疫疗法有着显著的临床反应 。近年来针 的相互作用不仅影响肿瘤的生长,还影响肿瘤的侵
对程序性细胞死亡受体 1(programmed cell death 1, 袭和预后 [21-22] 。肿瘤细胞缺乏均一性,进一步导致
PD1)/程 序 性 细 胞 死 亡 配 体 1(programmed cell 肺癌的靶向治疗难度加大。scRNA⁃seg可以有效识
death ligand 1,PD⁃L1)的免疫检查点阻断剂(im⁃ 别和描述 TME 内细胞的变化和特殊类型的细胞亚
mune checkpoint blockade,ICB)在治疗多种类型人 群,从而有助于改善肿瘤治疗效果和评价转归预后。
类肿瘤方面取得了较好的临床疗效 [5-6] ,多种抗 研究人员分别从拷贝数变异(copy number vari⁃
PD⁃1/PD⁃L1 抗体药物已被美国食品药品监督管理 ation,CNV)和基因表达谱(gene expression profile,
局(food and drug administration,FDA)批准用于晚期 GEP)两个维度解析 NSCLC 的异质性,把肺腺癌
[7]
NSCLC 患者的二线治疗 。表皮生长因子受体 (lung adencocarcinoma,LUAD)患者和肺鳞形细胞癌
(epidermal growth factor receptor,EGFR)激酶反复突 (lung squamous cell carcinome,LUSC)患 者 分 成
变 以 及 间 变 性 淋 巴 瘤 激 酶(anaplastic lymphoma LUADm(腺癌有突变)、LUADn(腺癌无突变)和
kinase,ALK)融合的发现,也给NSCLC患者的治疗带 LUSCn(鳞癌无突变)3组进行分析,发现LUSC患者
来了显著变化 [8-9] 。虽然靶向治疗改善了部分NSCLC 的肿瘤细胞在降维分析后形成了多个特异性聚类,
患者的临床预后,但其 5 年生存率仍低于 20%。对 提示LUSC的癌细胞异质性高于LUAD;此外免疫细
于无敏感基因突变的肺癌患者,靶向药物疗效不 胞在样本中的差异也很大,LUAD 样本显示强烈的
佳、预后不良,且耐药性限制了这些药物的临床治 炎性微环境,T 细胞几乎占 50%。除此之外 NSCLC
疗效果 [10] 。因此,寻找肺癌新的分子靶点、了解 的异质性还体现在肺上皮细胞,肺上皮细胞聚类分
NSCLC的耐药机制对于促进肿瘤的免疫治疗、改善 析揭示了两个不同的Ⅱ型肺泡上皮细胞(alveolar
患者的生存预后至关重要。 type 2 cell,AT2)簇,其中,相比AT2⁃2细胞,AT2⁃1细
高 通 量 单 细 胞 RNA 测 序(single⁃cell RNA 胞高表达 CEACAM6、KITLG、FOXC1 等促进细胞增
sequencing,scRNA⁃seq)数据统计分析改变了以往人 殖迁移的基因,意味着可向恶性肿瘤转化。研究还
们对细胞研究的方式。细胞生活在一个动态环境 揭示了肿瘤异质性与肿瘤中性粒细胞的相关性,细
中,与周围环境相互作用、相互影响。主成分分析 胞组成和肿瘤亚型的关联分析发现中性粒细胞在
(principal component analysis,PCA)可以识别已知和 LUSC 中的浸润比例更高,且表现出一定的髓样抑
未知的细胞簇;在二维投影归一化基因表达谱后, 制 细 胞(myeloid derived suppressor cell,MDSC)特
进行细胞层次重建;以单细胞基因表达数据推断细 征,如表达人类多形核髓样抑制细胞(polymorphonu⁃
胞特异性基因调控网络,并结合单细胞拟时序分 clear MDSC,PMN⁃MDSC)的标志物 LOX⁃1,体现了
[23]
析,从而可以在二维空间中聚类基因表达信息。 肿瘤浸润中性粒细胞功能的多样性和复杂性 。
scRNA⁃seq数据统计分析有3个方向,分别为细胞类 肿瘤相关中性粒细胞(tumor⁃associated neutro⁃
型鉴定、推断基因调控网络以及细胞层次结构的重 phil,TAN)的增加与NSCLC的恶性进展和预后不良
构。近年来,scRNA⁃seq 技术已被广泛应用于多种 有关这一结论在其他肺癌研究中也得到证实,并提
癌症的发生发展机制研究,包括皮肤黑色素瘤 [11] 、 示中性粒细胞浸润受肿瘤内在驱动机制调控。研
[12-13] [14-15] [16]
NSCLC 、肝细胞癌 、基底细胞癌 、结直肠 究人员构建了一种转录因子 Sox2 过表达而肿瘤抑
癌 [17-18] 和乳腺癌 [19] 等。这些研究全面描绘了肿瘤异 制因子 Lkb1 丢失的 NSCLC 小鼠模型(SL 小鼠),接
质性图谱;发现了肿瘤免疫特征、不同的免疫抑制人 着在 SL 小鼠中敲除 Nkx2⁃1 构建 SNL 小鼠,发现在
群、较少定义的免疫细胞亚群以及肿瘤相关信号转导 SNL小鼠内耗尽TAN可减少鳞状细胞癌的发生,这表
网络;鉴定了驱动耐药性、预测转移风险和介导可塑 明TAN与鳞状细胞癌的发生密切相关 [24-25] 。既往研
[20]
性的细胞群等 。本文将scRNA⁃seq 在NSLCL中的 究显示中性粒细胞多、瘤内异质性高这两个因素是
应用和研究进展进行综述。 肺癌免疫治疗效果不好的独立指标,中性粒细胞数量
和肿瘤异质性可能是肺癌免疫治疗呈现差异的关键
1 揭示NSCLC微环境
因素 [26-27] 。
肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)是 Lambrechts 等 [28] 利用 scRNA⁃seq 验证了 NSCLC
肿瘤细胞与周围组织、基质细胞相互作用形成的一 基质细胞之间存在很强的个体间差异,并对内皮细