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第43卷第9期 江胜军,姜冬梅,季晨博. 非靶向与靶向代谢组学在妊娠期糖尿病生物标志物发现中的比较[J].
2023年9月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(9):1230-1238 ·1235 ·
靶向代谢组学分析共筛选出 46 种有统计学差异的 定性更好(图4C)。
代谢物,其中25种显著上调,21种显著下调(图4A、 2.6 生物标志物的诊断效果
B)。两种方法检测并筛选出的共同差异代谢物有 图 5 显示,非靶向代谢组学分析 LFC 绝对值前
6 种,分别是胆碱、葫芦巴碱、精氨酸、3⁃羟基癸酸、 5 位为植物鞘氨醇、R⁃3⁃羟基丁酸、琥珀酸半醛、牛
乙酰肉碱和α⁃亚麻酸。为比较两种方法所检测出代 磺鹅脱氧胆酸钠和α⁃羟基异丁酸,AUC 值最大为
谢物的稳定性,本研究比较了两者共同检测出的差 0.855,诊断效能较好(表 4)。靶向代谢组学分析
异代谢物在质控样本中的 RSD,结果显示非靶向代 LFC 绝对值前 5 位为柠檬酸、L⁃氧化型谷胱甘肽、
谢组学的RSD均小于靶向代谢组学,检测数值的稳 乙酰肉碱、胆绿素和异烟酸,AUC 值最大为 0.983,
A B
Group
GDM
NC
4
2
0
-2
C
-4 0.15 非靶向 *
靶向 **
0.10
RSD ** ** ** **
0.05
0
3⁃羟基癸酸
胆碱 葫芦巴碱 精氨酸 乙酰肉碱 α⁃亚麻酸
A:非靶向代谢组学代谢物检出含量差异趋势;B:靶向代谢组学代谢物检出含量差异趋势;C:共被检代谢物的稳定性,两组比较,P<
*
0.05,P<0.01。
**
图4 差异趋势及代谢物稳定性
Figure 4 Difference trend and stability of metabolites
诊断效能很好(表 4)。 并不能做到真正的无偏检测。目前的代谢组学技
术仅捕获一部分代谢物,因此会产生固有的偏倚结
3 讨 论
果 [18-19] 。Li等 [12] 采集了GDM患者24~28周的血清样
随着代谢组学发展,代谢物作为疾病标志物的 本进行非靶向代谢组学分析,与本研究的样本性质
可能性越来越大。本研究采用非靶向代谢组学和 和样本收集时间一致,但是该研究检测到叶黄素等
靶向代谢组学分析比较 GDM 患者和正常孕妇的血 36种差异代谢物,与本研究检测到的差异代谢物不
清代谢物差异,评估两种方法在发现GDM疾病标志 同,这可能是多种因素共同作用的结果,但是非靶
物中的异同。结果表明,两种方法均可以筛选出具 向代谢组学分析较差的重复性也说明其并不能实
[2]
有一定诊断效能的生物标志物,但是由于两种方法 现对机体代谢组的全面覆盖 。进行非靶向代谢组
对于代谢物的覆盖范围和定量程度不同,两者在生 学分析时,必须选择固定相和电离模式的组合,这
物标志物筛选方面各有优势。非靶向代谢组学对 可能会提高对某些代谢物的检测灵敏度,并降低对
代谢物的覆盖相对广泛但是缺乏绝对量化,而靶向 另一些代谢物的检测灵敏度 [14] 。本研究中,非靶向
代谢组学能够确定特定代谢物的基准水平,二者在 代谢组学和靶向代谢组学分析所检测的血清样本
生物标志物的筛选方面可以优势互补。 来源完全一致,但是前者检测出的代谢物主要为脂
非靶向代谢组学对代谢物的广覆盖率为确定 质,后者主要为氨基酸及多肽类似物,这也证实了
新标志物提供了可能性,但是非靶向代谢组学分析 色谱分离条件和离子源参数可能会影响部分代谢