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第43卷第9期 江胜军,姜冬梅,季晨博. 非靶向与靶向代谢组学在妊娠期糖尿病生物标志物发现中的比较[J].
2023年9月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(9):1230-1238 ·1231 ·
代谢物通常指在生命体内实现代谢过程的小分
1 对象和方法
子有机化合物,包括有机酸、脂质、吲哚等通过代谢
过程产生或消耗的物质,代谢物的变化直接反映了 1.1 对象
生物体内正在发生或已经发生的活动或过程 [1-2] 。代 选取2021年7月—2021年9月在南京医科大学
谢组学是对小分子代谢物的整体研究,能够全面认识 附属妇产医院产科门诊行24~28周产检的GDM患者
病理和生理条件下生物系统的变化,为小分子代谢物 20例为GDM组,同时期口服糖耐量试验(oral glucose
调控和各种生物信号转导提供独特见解 。检测技 tolerance test,OGTT)阴性的健康孕妇20例为对照组
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术进步和代谢物数据库的开发加速了代谢物的鉴 (normal control,NC)。研究对象的纳入排除标准:
定发现,也促进了代谢组学在疾病筛查、诊断、进 ①纳入标准,年龄25~35岁,自然妊娠,单胎妊娠;在
展评估等方面的应用,并逐渐在发现非酒精性脂 24~28周时行75 g OGTT的产妇;知情并自愿参加本
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肪肝 、癌症 、心血管疾病 、糖尿病 及肥胖 等 研究;②排除标准,妊娠前就存在糖代谢异常或患
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疾病标志物中崭露头角。 有糖尿病;患有其他妊娠合并症或并发症。GDM诊
妊 娠 期 糖 尿 病(gestational diabetes mellitus, 断标准按国际糖尿病和妊娠研究协会提出的 75 g
GDM)是妊娠期间首次发生或发现的不同程度的 OGTT 的诊断标准 [15] :服糖前及服糖后 1 h、2 h,3 项
葡萄糖耐受不良,是妊娠期最常见的代谢性疾病 血糖值应分别低于 5.1、10.0、8.5 mmol/L(92、180、
之一 。一项对 GDM 血清样本进行的代谢组学分 153 mg/dL),任何一项血糖值达到或超过上述标准
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析结果表明,衣康酸可作为GDM发展的潜在生物标 即诊断为GDM。
志物 [10] ,Liu 等 [11] 研究发现 26 种血清代谢物可能是 1.2 方法
GDM 的潜在标志物,但随后 Li 等 [12] 的代谢组学分 1.2.1 血样采集
析发现的差异代谢物与前两项研究存在较大的异 所有入组受试者于晨起空腹状态下抽取肘静
质性。上述研究显示,代谢物可能成为 GDM 诊断 脉血3 mL于真空采血管中,置于4 ℃环境下自然凝固
或病程进展的生物标志物,但其诊断效能还需进 分层1 h,然后在4 ℃、3 000 r/min条件下离心15 min,
一步提升。 吸出分离的乳黄色上清液,取200 μL分装至冷藏管
目前,代谢物的检测主要通过核磁共振或色谱⁃ 中,每份血清样本分装2管,置于-80 ℃冰箱备存,直
质谱联用实现,按照无偏检测或靶向策略,可分为 至上机分析。
非靶向代谢组学和靶向代谢组学。非靶向代谢组 1.2.2 代谢物的分离与鉴定
学是对样本中的所有代谢物进行无偏检测与鉴定, 非靶向和靶向代谢组学分析均采用含同位素
覆盖率较广但只能相对定量,而靶向代谢组学则是 标记的提取液(甲醇∶乙腈=1∶1)提取血清样本中的
对选定的代谢物进行定量测量,并不能实现全面覆 代谢物。随后使用超高效液相色谱仪,通过液相色
盖 [13-14] 。基于超高效液相色谱⁃质谱(ultra high per⁃ 谱柱对目标化合物进行色谱分离,液相色谱 A 相为
formance liquid chromatography ⁃ mass spectrometry, 水相,B 相为乙腈。非靶向和靶向代谢组学分析采
UPLC⁃MS)技术,比较非靶向和靶向代谢组学在生 用不同的离子源参数通过高分辨质谱仪对待测样
物标志物发现中的异同,将为代谢组学驱动的生物 本进行质谱检测,离子源参数见表 1。通过质谱采
标志物发现及转化应用提供新的思路和依据。 集软件采集峰信号,使用 R 程序包(内核为 XCMS)
表1 非靶向和靶向代谢组学色谱⁃质谱方法比较
Table 1 Comparison of untargeted and targeted metabolomics chromatography⁃mass spectrometry methods
方法 非靶向代谢组学 靶向代谢组学
超高效液相色谱仪型号 Vanquish ACQUITY UPLC H⁃Class
液相色谱柱型号 1.7 μm,2.1 mm ×100.0 mm 1.7 μm,2.1 mm ×150.0 mm
高分辨质谱仪型号 Q Exactive HFX 6 500 +三重四极杆
离子源参数 护套气体流速:30 Arb;辅助气体流速:25 Arb;温度:350 ℃; 气幕气体=35 psi,离子喷涂电压=
全 ms 分辨率:120 000;ms/ms 分辨率:7 500;NCE 模式下碰 +5 000 V/-4 500 V,温度=400 ℃,离
撞能量:10/30/60;喷射电压:3.6 kV(正极)或-3.2 kV(负极) 子源气1=50 psi,离子源气2=50 psi
质谱采集 ProteoWizard Software SCIEX Analyst Work Station Software