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第44卷第4期               何奕婷，祁婉婉，冯振卿. 单细胞测序技术在妇科恶性肿瘤研究中的应用［J］.
                  2024年4月                     南京医科大学学报（自然科学版），2024，44（04）：553-560                       ·557 ·


                blasts，CAF）亚群具有免疫调节作用，其表达的细胞                      瘤 研 究方面的应用仍然存在一定局限性，如在
                因子白介素⁃6和趋化因子CXCL12能够在肿瘤中激                         scRNA⁃seq 中，一些编码具有重要调控或信号功能
                活 JAK/STAT 信号，从而促进肿瘤生长和耐药。上                       蛋白质的低表达基因即使被检测到，也容易丢失，
                述研究表明在腹水生态系统中不同细胞行使着不                             并且容易受到技术噪声的影响              ［41］ ；由于技术和经费
                同的功能，不同细胞间的通讯和相互作用可能平衡                            的限制，来自大块组织的细胞只有小部分可以被测
                疾病进展和对治疗的反应，从治疗上改变这种平衡                            序 ［42］ ，测序的细胞在多大程度上代表了整个组织中
                可能是重塑耐药环境的一个途径。有研究收集了                             感兴趣的细胞尚不清楚，故亟待解决进一步提高细
                来自 14 例 OC 患者的包括原发灶、转移灶、腹水、外                      胞捕获的通量。此外，在分离过程中，组织中单细胞
                周血以及盆腔淋巴结在内的5个部位共39个样本，                           的空间信息经常丢失          ［43］ 。因此，单细胞测序数据通

                进行scRNA⁃seq联合T细胞受体测序（T cell receptor              常不能显示细胞是如何构成组织的，以实现感兴趣
                sequencing，TCR⁃seq），发现 OC 患者腹水中的记忆                组织中的协调功能。为了解决这些问题，研究人员
                T 细胞是肿瘤原发灶及转移灶中终末态T细胞的重                           不断研发一些新技术，如荧光原位杂交（fluorescence
                要补充池，揭示了肿瘤组织及腹水中巨噬细胞功能                            in situ hybridization，FISH）、单分子荧光原位杂交
                表型和起源的异质性，为深入理解 OC 腹水对肿瘤                         （single molecule fluorescence in situ hybridization，
                进展的影响以及进一步探索靶向OC腹水的免疫治                            smFISH）、激光捕获显微解剖、激光扫描显微镜（包
                疗策略提供了重要的实验依据 。                                   括双光子激光扫描显微镜）和荧光原位测序等，从
                                           ［39］
                    为给具有复发风险的子宫内膜癌患者提供更                           而保存或恢复测序单细胞的空间信息                  ［44］ 。近期，有
                多的信息，从而提高免疫治疗的效果，Dou等                  ［40］ 利用    研究人员研发了活细胞转录组测序技术                   ［45］ ，兼具全
                包括全基因组测序、全外显子组测序、甲基化阵列、                           基因表达分辨率和动态解析能力，在单细胞进行转
                总 RNA 测序、微小 RNA 测序、靶向蛋白质组学、全                      录组测序后依然能够保持细胞存活。空间解析转
                局蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、乙酰蛋白质组                            录组学（spatially resolved transcriptomics，SRT）是继
                学和糖蛋白质组学这10个组学平台对138 例 EC 肿                       scRNA⁃seq 后出现的新一代技术，通过 SRT 可以帮
                瘤和 20 例来自健康供体的正常子宫内膜标本进行                          助揭示亚细胞RNA分布模式、空间标志和空间调节
                了全面的蛋白质基因组学分析。关于 MYC 活性与                          的生物过程，这对于理解复杂组织中的基因表达和
                二甲双胍治疗之间的关联分析表明，二甲双胍对于                            调控至关重要 。
                                                                              ［46］
                治疗 MYC 活性升高的 EC 具有潜在作用；PTEN 和
                                                                  4 小结与展望
                PIK3R1 基因突变与 AKT 磷酸化水平升高及对 AKT
                抑制剂敏感性增加相关，PIK3R1 或许可以成为对                             目前，妇科恶性肿瘤的发病率和病死率居高不
                AKT 抑制剂产生应答的潜在生物标志物。另外，                           下，并呈现年轻化趋势，单细胞测序技术的出现为在
                CTNNB1热点突变阻断了磷酸化诱导的β⁃catenin降                     单个细胞水平上进一步深入研究妇科恶性肿瘤提供
                解，并可能使 Wnt⁃FZD 拮抗剂对具有 CTNNB1 热点                   了新的方向。将 scDNA⁃seq、scRNA⁃seq、单细胞蛋
                突变的 EC 耐药。这些发现明确了一些分子标志                           白质组学测序以及联合TCR⁃seq等多种技术广泛应
                物，对于深入探究EC耐药的机制、指导EC患者分层                          用于妇科恶性肿瘤的研究，在识别肿瘤细胞特殊亚
                管理和精准治疗具有重要意义。                                    群、发现肿瘤发生发展中关键性的节点基因、挖掘
                                                                  TME中的丰富信息、探究耐药性肿瘤细胞的特征等
                3 单细胞测序技术的不足和改进
                                                                  方面发挥了重要作用，这些发现对于帮助临床确立
                    自从单细胞水平层面探究疾病以来，研究人员                          精准有效的诊断标志物、治疗靶点、疗效及预后评
                对肿瘤的异质性、肿瘤微环境的复杂性有了进一步                            价指标等具有重要意义。然而，单细胞测序技术仍
                理解，单细胞测序技术被广泛应用于生命科学领                             然存在一些不足之处，比如对低表达基因的检出率
                域。近年来，单细胞测序技术在妇科恶性肿瘤研究                            不高、缺乏细胞或组织的空间信息等。未来，活细胞
                中的应用层出不穷，其在阐明肿瘤发生发展机制、                            转录组学测序、SRT 等技术将会逐步发展并进一步
                检测肿瘤细胞亚型分类、鉴定稀有细胞、绘制细胞                            完善，这些技术的成熟与推广，以及多组学之间的联
                谱系、指导靶向精准治疗及疾病预后等方面发挥                             合应用将为妇科恶性肿瘤个性化与精准化的诊断、
                了重要作用（表 1）。然而，单细胞测序技术在肿                           治疗及预后提供新的思路和理论基础。
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