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第44卷第12期        陈梦星,宗慧敏,张 洋. 糖基化基因构建的IgA肾病风险预测模型及免疫细胞浸润分析[J].
                 2024年12月                    南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(12):1671-1681                      ·1677 ·


                                       A
                                                   0  10  20  30  40  50  60  70  80  90  100
                                         Points
                                         PIGH
                                                   3.4 3 2.6  2  1.6 1 0.6
                                         CHSY1
                                                   5 4 3 2 1 0
                                         ST8SIA1
                                                  -0.5 0 0.5 1  1.5  2  2.5  3 3.5  4  4.5  5  5.5
                                         Total points
                                                   0   20   40   60  80  100  120  140  160
                                         Risk of disease
                                                      0.30 0.50 0.70  0.90     0.99
                              B                                    C
                                  1.0                                                     OFGs
                                                                       0.8
                                                                                          All
                                 Actual probability  0.6  Apparent     Net benefit  0.4
                                                                                          None
                                                                       0.6
                                  0.8
                                                                       0.2
                                  0.4
                                                  Bias⁃corrected
                                                  ldea                  0
                                         0.4  0.6   0.8   1.0             00  0.2  0.4  0.6  0.8  1.0
                                         Predicted probability                 Threshold probability
                                                                         1∶100 1∶4  2∶3  3∶2  4∶1 100∶1
                                                                                Cost:Benefit ratio
                   A:Nomogram model for predicting IgAN risk based on OFGs. B:Construction of calibration curve. C:Construction of decision analysis curve.
                                             图3 基于最优特征基因预测IgAN风险的列线图
                              Figure 3 Nomogram model for predicting IgAN risk based on the optimal feature genes



                切片和冰冻肾组织分别进行免疫组织化学检测和                             的糖基化相关基因及其机制非常重要,如能找到灵敏
                Western blot 以进一步验证(图7A~F)。两次实验结                  度和特异度更高的诊断标志物,将推动靶向治疗。
                果均显示,与微小病变性肾病相比,IgAN 中 CHSY1                          本研究从GGDB网站下载糖基化相关基因,根据
                和PIGH表达水平显著下降,而ST8SIA1表达水平显                       GEO数据库中IgAN数据集筛选出58个DEGRG。GO
                著增加。值得注意的是,糖尿病肾病和微小病变性                            分析结果显示这些 DEGRG 主要定位在高尔基体,
                肾病中 OFG 的表达水平差异无统计学意义,提示                          与糖蛋白代谢合成和糖基转移酶活性等功能有
                OFG 对 IgAN 有潜在的诊断价值。此外,根据 Ne⁃                     关。KEGG 分析结果表明 DEGRG 主要富集在鞘糖
                phroseq v5数据库中OFG在IgAN肾组织和正常样本                    脂生物合成、黏蛋白 O⁃聚糖生物合成和黏多糖生
                之间的表达水平进行统计学分析,再一次验证了其                            物合成等通路。这些结果进一步阐明了糖基化相
                差异表达(图7G~I)。                                      关基因在 IgAN 中潜在的作用机制。随后,通过
                                                                  LASSO、SVM⁃REF 和RF 3种算法确定了3个重叠基
                3  讨 论
                                                                  因(CHSY1、PIGH 和 ST8SIA1)作为 OFG。基于 OFG
                    目前,诊断IgAN的金标准仍然依赖于有创的肾                        绘制预测IgAN发生的列线图,校准曲线和决策曲线
                穿刺活检,但存在出血和感染等风险,限制了其在                            均提示该模型优秀的预测作用。此外,肾组织免疫
                临床中的广泛应用。因此,越来越多的研究致力于                            组织化学检测和Western blot 证实OFG可鉴别IgAN
                寻找合适的IgAN诊断标志物。然而,这些候选标志                          与其他肾脏疾病,具有良好的诊断价值。
                物的灵敏度和特异度均不高。近年来研究发现,异                                CHSY⁃1 是一种催化硫酸软骨素合成的糖基转
                常糖基化与多种免疫性疾病有关,如系统性红斑狼                            移酶,硫酸软骨素是糖胺聚糖的家族成员,与核心
                疮、类风湿性关节炎等          [10] ,但目前 IgAN 中的糖基化          蛋白共价连接形成硫酸软骨素蛋白聚糖                    [11] 。研究
                研究仅局限在Gd⁃IgA1中,因此深入探索IgAN中新                       表明硫酸软骨素可通过减少核因子⁃κB 核转位、
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