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第44卷第12期 陈梦星,宗慧敏,张 洋. 糖基化基因构建的IgA肾病风险预测模型及免疫细胞浸润分析[J].
2024年12月 南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(12):1671-1681 ·1677 ·
A
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
Points
PIGH
3.4 3 2.6 2 1.6 1 0.6
CHSY1
5 4 3 2 1 0
ST8SIA1
-0.5 0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 4 4.5 5 5.5
Total points
0 20 40 60 80 100 120 140 160
Risk of disease
0.30 0.50 0.70 0.90 0.99
B C
1.0 OFGs
0.8
All
Actual probability 0.6 Apparent Net benefit 0.4
None
0.6
0.8
0.2
0.4
Bias⁃corrected
ldea 0
0.4 0.6 0.8 1.0 00 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
Predicted probability Threshold probability
1∶100 1∶4 2∶3 3∶2 4∶1 100∶1
Cost:Benefit ratio
A:Nomogram model for predicting IgAN risk based on OFGs. B:Construction of calibration curve. C:Construction of decision analysis curve.
图3 基于最优特征基因预测IgAN风险的列线图
Figure 3 Nomogram model for predicting IgAN risk based on the optimal feature genes
切片和冰冻肾组织分别进行免疫组织化学检测和 的糖基化相关基因及其机制非常重要,如能找到灵敏
Western blot 以进一步验证(图7A~F)。两次实验结 度和特异度更高的诊断标志物,将推动靶向治疗。
果均显示,与微小病变性肾病相比,IgAN 中 CHSY1 本研究从GGDB网站下载糖基化相关基因,根据
和PIGH表达水平显著下降,而ST8SIA1表达水平显 GEO数据库中IgAN数据集筛选出58个DEGRG。GO
著增加。值得注意的是,糖尿病肾病和微小病变性 分析结果显示这些 DEGRG 主要定位在高尔基体,
肾病中 OFG 的表达水平差异无统计学意义,提示 与糖蛋白代谢合成和糖基转移酶活性等功能有
OFG 对 IgAN 有潜在的诊断价值。此外,根据 Ne⁃ 关。KEGG 分析结果表明 DEGRG 主要富集在鞘糖
phroseq v5数据库中OFG在IgAN肾组织和正常样本 脂生物合成、黏蛋白 O⁃聚糖生物合成和黏多糖生
之间的表达水平进行统计学分析,再一次验证了其 物合成等通路。这些结果进一步阐明了糖基化相
差异表达(图7G~I)。 关基因在 IgAN 中潜在的作用机制。随后,通过
LASSO、SVM⁃REF 和RF 3种算法确定了3个重叠基
3 讨 论
因(CHSY1、PIGH 和 ST8SIA1)作为 OFG。基于 OFG
目前,诊断IgAN的金标准仍然依赖于有创的肾 绘制预测IgAN发生的列线图,校准曲线和决策曲线
穿刺活检,但存在出血和感染等风险,限制了其在 均提示该模型优秀的预测作用。此外,肾组织免疫
临床中的广泛应用。因此,越来越多的研究致力于 组织化学检测和Western blot 证实OFG可鉴别IgAN
寻找合适的IgAN诊断标志物。然而,这些候选标志 与其他肾脏疾病,具有良好的诊断价值。
物的灵敏度和特异度均不高。近年来研究发现,异 CHSY⁃1 是一种催化硫酸软骨素合成的糖基转
常糖基化与多种免疫性疾病有关,如系统性红斑狼 移酶,硫酸软骨素是糖胺聚糖的家族成员,与核心
疮、类风湿性关节炎等 [10] ,但目前 IgAN 中的糖基化 蛋白共价连接形成硫酸软骨素蛋白聚糖 [11] 。研究
研究仅局限在Gd⁃IgA1中,因此深入探索IgAN中新 表明硫酸软骨素可通过减少核因子⁃κB 核转位、

