Page 54 - 南京医科大学自然版
P. 54
第46卷第4期
·522 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2026年4月
系统的开发提供理论支持与技术方案。 BN)和 3 种不同分化的腺癌,分为管状高分化腺癌
(tubular well differentiated adenocarcinoma,TW)、管
1 材料和方法
状中分化腺癌(tubular moderately differentiated ade⁃
1.1 材料 nocarcinoma,TM)、管状低分化腺癌(tubular poorly
1.1.1 数据来源与处理 differentiated adenocarcinoma,TP),本 研 究 中 取 其
本研究基于公开网络收集胃癌病理图像数据, 全 部 数 据 集 作 为 训 练 数 据 ,包 含 TP 17 995 张,
选取华威大学计算机科学系组织图像分析中心创 TW 13 068 张,TM 16 456 张,良性 18 777 张。划分
建的,用于泛癌肿瘤检测的大型病理学图像数据库 后癌分级训练集样本量n=46 405、验证集样本量n=
[11]
HISTOPANTUM ,提取其中的胃癌数据集部分用 9 943、测试集样本量n=9 948。
于胃癌与正常组织分类识别诊断模型训练;选取由 在真实场景应用模拟时,从 TCGA 中挑选无标
韩国首尔的 Kangbuk 三星医院提供的 KBSMC_gas⁃ 注的WSI进行切割与输入,以模拟真实场景的直接
tric_cancer_grading_dataset 等 [12] 数据集用于胃癌分 输入,检测模型能力。在挑选时,已确认所用 WSI
级识别模型训练。HISTOPANTUM数据集的构建基 与HISTOPANTUM中数据无重复。
于对 4 种不同癌症类型(结直肠癌、子宫癌、卵巢癌 为提高训练速度,增强模型稳定性,并提升泛
和胃癌)的全面采样。研究团队从癌症基因组图谱 化能力,为模型训练提供更稳定的输入,训练前将
(The Cancer Genome Atlas,TCGA)项目中获取了每 图像处理为 224×224 像素,并进行像素归一化。对
种癌症类型的 40 张全切片图像(whole slide image, 图像采用随机旋转、随机平移、随机缩放、随机剪切
WSI),并确保样本涵盖多种肿瘤亚型、性别、种族和 变换等数据增强,缓解过拟合,提升模型的泛化能
中心,以增强数据集的多样性。随后,经验丰富的 力、鲁棒性、性能和适应性,提高成本效益(图 1)。
病理学家对这些切片中的肿瘤和非肿瘤区域进行 研究使用 MATLAB 中的 Augmented Image Data Store
了细致标注,从而提取出肿瘤和非肿瘤的图像块, 方法进行数据增强,在训练过程中实时生成增强图
形成了包含 281 142 个图像块的 HISTOPANTUM 数 像。增强后数据集样本量不变。
据集。每个图像块的分辨率为512×512像素。本研 1.1.2 模型框架选择
究中取胃癌图像作为训练数据,包含胃正常组织图 为探究不同种类网络在病理图像识别中的效
像15 323张,胃癌图像13 527张。划分后癌与非癌分 果,尽可能全面评估不同架构的性能,本研究选用
类训练集样本量n=20 194、验证集样本量n=4 327、测 SqueezeNet、GoogleNet、InceptionV3、DenseNet201、
试 集 样 本 量 n=4 329;KBSMC_gastric_cancer_grad⁃ MobileNetV2、ResNet18、ResNet50、ResNet101、Xcep⁃
ing_dataset涵盖了2016—2020年收集的98例胃癌患 tion、Inception ⁃ ResNetV2、ShuffleNet、NASNet ⁃ mo⁃
者的WSI。这些图像经过40倍放大后,使用Aperio数 bile、Darknet⁃19、Darknet⁃53、EfficientNetB0、VGG16、
字切片扫描仪进行扫描。随后,图像被分割成大小 VGG19等17种CNN网络进行训练测试。通过多模
为 512×512 像素的补丁图像,以适应深度学习模型 型横向对比确定胃癌分类诊断的最优架构。
的输入要求。两位资深病理学家 Kim Kyungeun 和 这些网络都拥有各自的特点,通过初步训练
Song Boram对图像进行了标注,区分了良性(benign, 后,不仅可以筛选出针对本项目的最优网络,同时
Pixel Data
normalization augmentation
图1 图像数据增强示例
Figure 1 Example of image data augmentation

