Page 59 - 南京医科大学学报自然科学版

第41卷第3期 周 春，吕 红，张若洋，等. 基于MassARRAY平台的人血小板抗原基因分型的质谱检测方法［J］.
2021年3月 南京医科大学学报（自然科学版），2021，41（03）：361-368 ·365 ·

GGCGAGTGCCTCTGTGGTCAATGTGTCTGCCACAG 的SNP 位点及两端相关序列，质谱和一代测序的检
CAGTGACTTTGGCAAGATCACGGGCAAGTACTGC ⁃ 测结果均为HPA⁃15a型。
GAG⁃3′。 2.3 参考质粒的质谱分析
DA2938质粒中野生型HPA⁃1、HPA⁃10、HPA⁃2、 质粒样品的灵敏度检测：29个位点每种分型检
HPA⁃5 和⁃ HPA⁃6 插入序列的测序图经酶切鉴定， 测 1 次，共计 87 个分型结果。其中 A 型结果定义为
DA2938 质粒测序分析结果与 GenBank 数据库中公 阴性，共29个，非A型（A型和AB型）结果定义为阳
布的序列完全一致（图 1），为野生型 HPA⁃1、HPA⁃ 性，其中B型29个、AB型29个，共58个。实际检测
10、HPA⁃2、HPA⁃5和HPA⁃6。 真阳性结果 58 个，假阴性结果 0 个，灵敏度=58/58×

2.2 MassARRAY MALDI⁃TOF 质谱检测和一代测 100%=100%。
序HPA分型 质粒样品的特异度检测：29个位点每种分型检
以HPA⁃15为例，MassARRAY MALDI⁃TOF质谱 测1次，共计87个分型结果。其中A型结果（29个）
检测和一代测序 HPA 分型见图 2。DA2943 质粒含 定义为阴性，非 A 型（B 型 29 个和 AB 型 29 个）结果

野生型 HPA⁃15、HPA⁃17、HPA⁃18、HPA⁃20、HPA⁃22 定义为阳性。实际检测真阴性结果29个，假阳性结

A B

C D

E

A：插入序列1~264碱基测序图；B：插入序列265~462碱基测序图；C：插入序列463~594碱基测序图；D：插入序列595~858碱基测序图；E：
插入序列859~1044碱基测序图。
图1 DA2938质粒的测序结果
Figure 1 Sequencing results of DA2938 plasmid