Page 8 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第7期
·938 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年7月
ways,ECSIT)是 Toll 样受体/白介素⁃1 受体(Toll⁃like 游信号通路的改变。目前,通过干预ECSIT 3′⁃UTR
receptors/interleukin⁃1 receptor,TLRs/IL⁃1R)信号通 从而调节 ECSIT 的表达尚无文献报道。因此,本研
路中高度保守的信号分子,在先天免疫、胚胎发育 究使用 3′RACE 技术克隆得到 ECSIT 3′⁃UTR 的序
和线粒体相关功能中发挥重要作用 [5-7] 。Toll 样受 列,并观察 miRNA 和 siRNA 对细胞中 ECSIT 表达的
体识别病原体相关分子模式并通过转化生长因子 影响,以验证调控 ECSIT mRNA 翻译表达的序列区
激酶1(TGF beta⁃activated kinase 1,TAK1)或有丝分 域,为后续从分子水平探明 ECSIT 的作用机制及其
裂原/细胞外信号调节激酶激酶 1(mitogen/extracel⁃ 在心血管疾病等防治方面的开发应用奠定良好的
lular signal⁃regulated kinase kinase 1,MEKK⁃1)激活 理论基础。
NF⁃κB和AP⁃1转录因子的表达,促进炎症信号的激
1 材料和方法
活,肿瘤坏死因子受体相关因子 6(tumor necrosis
factor receptor⁃associated factor 6,TRAF6)是这两个 1.1 材料
级 联 下 游 信 号 分 子 。 在 应 激 条 件 下 ,ECSIT 与 C57BL/6J 小鼠为 SPF 级(购自南京医科大学医
TRAF6结合,参与 NF⁃κB 信号与 MEKK⁃1 的信号通 药实验动物基地并饲养于此基地),研究经南京医
路调控 [5] 。骨形态发生蛋白(bone morphogenetic 科大学实验动物伦理委员会批准(批准号:IACUC
protein,BMP)是转化生长因子β(transforming growth 2008005)。
factor β,TGF⁃β)超家族的成员。在 BMP 通路中, 反转录试剂盒 PrimerScript TM RT、pMD⁃18T 载
ECSIT 可以作为 Smad1 和 Smad4 的辅助因子,并与 体、DL1000 Marker(TaKaRa 公司,日本);氨苄青霉
特定BMP靶基因(如Tlx2)的启动子结合,在小鼠的 素(上海生光公司);凝胶回收试剂盒、大肠杆菌
胚胎发育过程中起关键作用,且 ECSIT 敲除小鼠具 DH5α感受态细胞(北京天根生化);Taq 酶(NEB 公
[6] TM
有胚胎致死性 。此外,ECIST 与分子伴侣 NDU⁃ 司,美国);Lipofectamine 2000 转染试剂(Invitrogen
FAF1 相互作用并参与线粒体复合物Ⅰ的组装,沉 公司,美国);ECSIT 抗体(Abcam 公司,美国);GAP⁃
默 ECSIT 的表达可导致线粒体复合物Ⅰ组装严重 DH抗体、HRP标记的山羊抗兔IgG、山羊抗小鼠IgG
[7]
损伤,进而导致线粒体功能紊乱 。已有研究报道, (上海碧云天生物有限公司);DMEM 细胞培养基
ECSIT在成年小鼠骨骼肌、肝脏、肾脏和心脏中均有 (Gibco 公司,美国);胎牛血清(BI 公司,以色列)。
表达 。但是,ECSIT 的表达受哪些因素调控,尤其 PCR 仪、mini PROTEAN 3cell 电泳仪(Bio⁃Rad 公司,
[5]
是在翻译水平上的调控尚不清楚。 美国);SSC⁃24P 空气恒温摇床(江苏太仓实验设备
在真核生物中,长为 20~30 个核苷酸的非编码 厂);AE⁃100电子分析天平(METTLER公司,瑞士);
RNA 分子已成为基因组表达和功能的关键调控因 台式离心机(Heraeus公司,德国)。
子,根据其作用模式不同,其主要被分为两类,即微小 根据 NCBI 数据库里的小鼠 ECSIT 基因序列设
RNA(microRNA,miRNA)和小干扰 RNA(siRNA) 。 计合成引物,测序由上海英骏生物技术有限公司完
[8]
miRNA是一类由内源基因编码的长度为20~24个核 成。引物序列为3′Adaptor:5′⁃GCTGTCAACGATAC⁃
苷酸的非编码单链RNA,可在多种生物过程中调控 GCTACGTAACGGCATGACAGTGTTTTTTTTTTTTT ⁃
基因表达,包括发育、细胞分化、脂肪代谢和生长控 TTTTT⁃3′,3′Adaptor MN:5′⁃GCTGTCAACGATAC⁃
[9]
制 。转录后基因表达的抑制方法包括抑制翻译和 GCTACGTAACGGCATGACAGTGTTTTTTTTTTTTT ⁃
mRNA 的剪切,miRNA 可直接与靶mRNA 的3′⁃UTR TTTMN⁃3′,3′musECSIT⁃F:5′⁃ATGAGTTTGACGTG⁃
序列互补结合,通过去烯化作用对靶mRNA 进行非 GATGAA⁃3′,3′Nested⁃primer:5′⁃CGCTACGTAACG⁃
切割降解,起到翻译抑制作用 [10- 11] 。RNA 干扰 GCATGACAGTG⁃3′。
(RNA interference,RNAi)是一种内源性 RNA 干扰 1.2 方法
途径,通过精确调控基因表达,为调控细胞信号通 1.2.1 3′RACE实验
路提供了强大的机制,作为 RNAi 复合物的一个组 使用 TRIzol 法提取小鼠总 RNA,再参照 Prime⁃
成部分,siRNA 能够沉默具有互补序列的特定基因 Script RT 试剂盒说明书方法将 RNA 逆转录为 cD⁃
TM
的表达 [12] 。ECSIT mRNA 的 3′⁃UTR 作为其 mRNA NA。具体步骤为:①去除基因组 DNA。5 × gDNA
的重要组成部分,可能与 miRNA 或 siRNA 结合,引 Eraser Buffer 2 μL,gDNA Eraser 1 μL,Total RNA
导 ECSIT mRNA 发生翻译受阻或降解,从而引起下 (1 000 ng),RNase Free dH2O 补齐,42 ℃ 2 min。②