Page 9 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 9

第41卷第7期               周小蓉,陆 霞,李建涛,等. 成年小鼠ECSIT 3′⁃UTR的鉴定及功能分析[J].
                  2021年7月                     南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(07):937-942                       ·939 ·


                                                                                 TM
                反 转 录 。 PrimeScriptRT Enzyme Mix I 2 μL,5 ×       用 Lipofectamine 2000,按 照 说 明 将 50 nmol/L 的
                PrimeScript Buffer(for real time)4 μL,步骤①的反应      siRNA 和 miRNA 转染至 RAW264.7 细胞和 Hepa1⁃6
                液 10 μL,3′Adaptor、3′Adaptor MN 各 1 μL,RNase       细胞,4 h 后换完全培养基,培养 36 h 后进行下一步
                Free dH2O 3 μL,反应条件为42 ℃ 30 min,85 ℃ 5 s,         实验。
                4 ℃保存。③PCR及其产物鉴定回收。使用逆转录                          1.2.6 蛋白免疫印迹(Western blot)
                产物 cDNA 为模板,以 musECSIT F 作为外侧上游引                      提取细胞总蛋白并使用BCA法测定其浓度,加
                物,3′Nested⁃Primer 为下游引物和 Taq 酶进行套式                5×加样缓冲液后 99 ℃煮 5 min 使蛋白变性,再进行

                PCR扩增。反应条件如下:95 ℃预变性2 min,95 ℃                    聚丙烯酰胺凝胶电泳,电泳结束后使用湿转法将蛋
                变性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,40个循环;               白转移至 PVDF 膜上,将膜置于 TBS⁃T 配制的 5%脱
                72 ℃延伸 10 min。反应结束后经琼脂糖凝胶电泳                       脂奶粉溶液中,室温封闭 1 h,TBS⁃T 清洗膜 3 次,加
                检测结果。                                             入一抗置于4 ℃摇床孵育过夜,次日回收一抗,TBS⁃
                1.2.2 目的片段T载体克隆及序列分析                              T清洗膜3次,二抗室温孵育1.5 h,清洗膜3次后,使

                    3′RACE 扩增条带切胶回收,连接于 pMD18⁃T                   用ECL显色液曝片,采用Image Lab图像分析软件进
                载体(具体操作参照产品说明书),转化大肠杆菌                            行灰度分析。
                DH5α感受态,菌落 PCR 鉴定的阳性克隆样品送测                        1.3  统计学方法
                序。经过以上步骤,获得ECSIT 3′下游未知序列,将                           应用GraphPad Prism5软件统计数据,计量数据
                碱基序列提交到NCBI数据库做BLAST比对。                           用均数±标准差(x ± s)表示。使用单因素方差分析
                1.2.3 miRNA和siRNA的设计和合成                          (one⁃way ANOVA)方法分析组间变异度,组内的两
                    使用 TargetScan 软件预测 ECSIT 基因潜在结合               两比较采用 Tukey 检验。P < 0.05 为差异有统计学
                的 miRNA,其 中 miR ⁃ 7 ⁃ 5p(序 列 为 3′ ⁃ UGUU⁃         意义。
                GUUUUAGUGAUCAGAAGGU⁃5′)和miR⁃296⁃5p(序
                                                                  2  结 果
                列 3′⁃UGUCCUAACUCCCCCCCGGGU⁃5′)预测可能
                与ECSIT 3′⁃UTR的序列结合,因此将2种miRNA序                    2.1  ECSIT mRNA 3′⁃UTR的鉴定及测序
                列交由广州锐博生物技术有限公司合成。根据 3′                               ECSIT 的 3′RACE⁃PCR 产物经 2%琼脂糖凝胶
                RACE 实验结果及 NCBI 数据库中 ECSIT 的序列设                   电泳检测可见阳性条带(图1A),凝胶回收扩增的片
                计4个干扰不同序列的siRNA,它们干扰ECSIT靶基                       段,克隆于pMD⁃18T载体,转化大肠杆菌DH5α感受
                因段为 siRNA1:5′⁃GCCACGTGGACTTCATCTA⁃3′,             态,菌落PCR鉴定阳性克隆(图1B),测序结果显示有
                位于第 601~619 个碱基;siRNA2:5′⁃GCCTGATCT⁃              效序列的长度为346 bp(图1C)。将序列与NCBI数据
                CAGTGCTAAA⁃3′,位于第 992~1 009 个碱基;siR⁃              库中ECSIT的mRNA序列进行比对,一致率达到99%。
                NA3:5′⁃GGAAGATGATGAGGCCATT⁃3′ ,位 于 第              2.2  miR⁃7⁃5p调节小鼠细胞中ECSIT蛋白的表达
                1 547~1 565 个碱基;siRNA4:5′⁃GTAATAAGTGC⁃                图 2A 为预测软件识别的 ECSIT 与 miRNA 的互
                GTCTATTA⁃3′,位于第 1 547~1 565 个碱基,siRNA             补序列。Western blot 结果发现,与 NC 组相比,He⁃
                均交由广州锐博生物技术有限公司设计并合成。                             pa1⁃6细胞转染miR⁃7⁃5p可以明显抑制 ECSIT 的蛋
                1.2.4 细胞培养                                        白表达(P < 0.05,n=3),而转染miR⁃296⁃5p对ECSIT
                    从液氮中取出RAW264.7细胞和Hepa1⁃6细胞,                   的表达没有明显影响(P > 0.05,图 2B),并且在
                迅速在37 ℃水浴锅中摇晃,融化后转移至预先装好                          RAW264.7 中观察到相同的变化趋势(P < 0.01,图
                培养基的离心管内,500 r/min 4 ℃离心 5 min,弃上                 2C)。以上结果提示miR⁃7⁃5p可能是ECSIT的潜在
                清,加入含有10%血清的DMEM 培养基进行重悬后                         调节因子。
                种板,置于细胞培养箱中培养。当细胞铺满皿底                             2.3  siRNA干扰小鼠细胞系中ECSIT蛋白的表达
                80%~90%时,进行传代,每48 h换1次完全培养基。                          Western blot结果显示,与NC组相比,在Hepa1⁃
                1.2.5 miRNA和siRNA转染                               6 细胞中转染 siRNA 1、2 后 ECSIT 的表达显著下降
                    将 siRNA 和 miRNA 配成浓度为 20 μmol/L 的储           (P < 0.01,n=3),但siRNA 3、4对其表达没有明显影
                液,并分装冻存于-80 ℃冰箱。密度为30%~50%的                       响(P > 0.05,图3A);此外,在RAW264.7中观察到相
                细胞换新鲜无血清和不含双抗的DMEM培养基,使                           同的变化趋势(P < 0.05,图3B)。
   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14