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第41卷第7期 周小蓉,陆 霞,李建涛,等. 成年小鼠ECSIT 3′⁃UTR的鉴定及功能分析[J].
2021年7月 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(07):937-942 ·939 ·
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反 转 录 。 PrimeScriptRT Enzyme Mix I 2 μL,5 × 用 Lipofectamine 2000,按 照 说 明 将 50 nmol/L 的
PrimeScript Buffer(for real time)4 μL,步骤①的反应 siRNA 和 miRNA 转染至 RAW264.7 细胞和 Hepa1⁃6
液 10 μL,3′Adaptor、3′Adaptor MN 各 1 μL,RNase 细胞,4 h 后换完全培养基,培养 36 h 后进行下一步
Free dH2O 3 μL,反应条件为42 ℃ 30 min,85 ℃ 5 s, 实验。
4 ℃保存。③PCR及其产物鉴定回收。使用逆转录 1.2.6 蛋白免疫印迹(Western blot)
产物 cDNA 为模板,以 musECSIT F 作为外侧上游引 提取细胞总蛋白并使用BCA法测定其浓度,加
物,3′Nested⁃Primer 为下游引物和 Taq 酶进行套式 5×加样缓冲液后 99 ℃煮 5 min 使蛋白变性,再进行
PCR扩增。反应条件如下:95 ℃预变性2 min,95 ℃ 聚丙烯酰胺凝胶电泳,电泳结束后使用湿转法将蛋
变性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,40个循环; 白转移至 PVDF 膜上,将膜置于 TBS⁃T 配制的 5%脱
72 ℃延伸 10 min。反应结束后经琼脂糖凝胶电泳 脂奶粉溶液中,室温封闭 1 h,TBS⁃T 清洗膜 3 次,加
检测结果。 入一抗置于4 ℃摇床孵育过夜,次日回收一抗,TBS⁃
1.2.2 目的片段T载体克隆及序列分析 T清洗膜3次,二抗室温孵育1.5 h,清洗膜3次后,使
3′RACE 扩增条带切胶回收,连接于 pMD18⁃T 用ECL显色液曝片,采用Image Lab图像分析软件进
载体(具体操作参照产品说明书),转化大肠杆菌 行灰度分析。
DH5α感受态,菌落 PCR 鉴定的阳性克隆样品送测 1.3 统计学方法
序。经过以上步骤,获得ECSIT 3′下游未知序列,将 应用GraphPad Prism5软件统计数据,计量数据
碱基序列提交到NCBI数据库做BLAST比对。 用均数±标准差(x ± s)表示。使用单因素方差分析
1.2.3 miRNA和siRNA的设计和合成 (one⁃way ANOVA)方法分析组间变异度,组内的两
使用 TargetScan 软件预测 ECSIT 基因潜在结合 两比较采用 Tukey 检验。P < 0.05 为差异有统计学
的 miRNA,其 中 miR ⁃ 7 ⁃ 5p(序 列 为 3′ ⁃ UGUU⁃ 意义。
GUUUUAGUGAUCAGAAGGU⁃5′)和miR⁃296⁃5p(序
2 结 果
列 3′⁃UGUCCUAACUCCCCCCCGGGU⁃5′)预测可能
与ECSIT 3′⁃UTR的序列结合,因此将2种miRNA序 2.1 ECSIT mRNA 3′⁃UTR的鉴定及测序
列交由广州锐博生物技术有限公司合成。根据 3′ ECSIT 的 3′RACE⁃PCR 产物经 2%琼脂糖凝胶
RACE 实验结果及 NCBI 数据库中 ECSIT 的序列设 电泳检测可见阳性条带(图1A),凝胶回收扩增的片
计4个干扰不同序列的siRNA,它们干扰ECSIT靶基 段,克隆于pMD⁃18T载体,转化大肠杆菌DH5α感受
因段为 siRNA1:5′⁃GCCACGTGGACTTCATCTA⁃3′, 态,菌落PCR鉴定阳性克隆(图1B),测序结果显示有
位于第 601~619 个碱基;siRNA2:5′⁃GCCTGATCT⁃ 效序列的长度为346 bp(图1C)。将序列与NCBI数据
CAGTGCTAAA⁃3′,位于第 992~1 009 个碱基;siR⁃ 库中ECSIT的mRNA序列进行比对,一致率达到99%。
NA3:5′⁃GGAAGATGATGAGGCCATT⁃3′ ,位 于 第 2.2 miR⁃7⁃5p调节小鼠细胞中ECSIT蛋白的表达
1 547~1 565 个碱基;siRNA4:5′⁃GTAATAAGTGC⁃ 图 2A 为预测软件识别的 ECSIT 与 miRNA 的互
GTCTATTA⁃3′,位于第 1 547~1 565 个碱基,siRNA 补序列。Western blot 结果发现,与 NC 组相比,He⁃
均交由广州锐博生物技术有限公司设计并合成。 pa1⁃6细胞转染miR⁃7⁃5p可以明显抑制 ECSIT 的蛋
1.2.4 细胞培养 白表达(P < 0.05,n=3),而转染miR⁃296⁃5p对ECSIT
从液氮中取出RAW264.7细胞和Hepa1⁃6细胞, 的表达没有明显影响(P > 0.05,图 2B),并且在
迅速在37 ℃水浴锅中摇晃,融化后转移至预先装好 RAW264.7 中观察到相同的变化趋势(P < 0.01,图
培养基的离心管内,500 r/min 4 ℃离心 5 min,弃上 2C)。以上结果提示miR⁃7⁃5p可能是ECSIT的潜在
清,加入含有10%血清的DMEM 培养基进行重悬后 调节因子。
种板,置于细胞培养箱中培养。当细胞铺满皿底 2.3 siRNA干扰小鼠细胞系中ECSIT蛋白的表达
80%~90%时,进行传代,每48 h换1次完全培养基。 Western blot结果显示,与NC组相比,在Hepa1⁃
1.2.5 miRNA和siRNA转染 6 细胞中转染 siRNA 1、2 后 ECSIT 的表达显著下降
将 siRNA 和 miRNA 配成浓度为 20 μmol/L 的储 (P < 0.01,n=3),但siRNA 3、4对其表达没有明显影
液,并分装冻存于-80 ℃冰箱。密度为30%~50%的 响(P > 0.05,图3A);此外,在RAW264.7中观察到相
细胞换新鲜无血清和不含双抗的DMEM培养基,使 同的变化趋势(P < 0.05,图3B)。