Page 10 - 南京医科大学学报自然科学版

第41卷第8期
·1112 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年8月

A 30 B 120 C ］ 1.4 control
1.2
噬菌体滴度 （ ×10 7 PFU/mL） 20 5 （ % ） 存活率 80 细菌生长情况 nm ） （ 600 1.0 …… MOI=10
25
100
MOI=0.1
0.8
MOI=1
60
15
0.6
40
10
0.4
20
0
0 5 10 15 20 25 30 35 40 0 4 25 37 45 50 55 60 65 70 ［ D 0.2 0 0 30 60 90 120 150 210 240 270 300
时间（min） 温度（℃） 时间（min）
A：噬菌体 vB_EcoM_RZ 的生长曲线，每个实验重复 3 次；B：噬菌体 vB_EcoM_RZ 在不同温度下的存活率，每个实验重复 3 次；C：噬菌体
vB_EcoM_RZ的杀菌试验，每个实验重复3次。
图2 噬菌体vB_EcoM_RZ生物学特性
Figure 2 Biological characteristics of phage vB_ EcoM_ RZ
定的 ORF。在噬菌体基因组的正向链中有 45 个 vB_EcoM_RZ作为毒性噬菌体特性但同时没有携带
ORF，在互补链中有247个ORF（图3）。确定有125个 可能的毒性基因，使其成为治疗应用的潜在优良候
ORF 编码已知功能的蛋白质（蓝色基因），而 167 个 选者。
ORF 编码的蛋白功能未知为假定蛋白（黑色基因， 2.4 噬菌体vB_EcoM_RZ的结构蛋白
图 3）。另外，在 vB_EcoM_RZ 基因组中未发现编码 为了分析 vB_EcoM_RZ 的结构蛋白，将纯化的
阻遏蛋白、整合酶（温带噬菌体的标记）等溶源性周 噬菌体颗粒煮沸进行变性后通过SDS⁃PAGE电泳分
期相关基因。由此认为vB_EcoM_RZ噬菌体为毒性 离。在SDS⁃PAGE 凝胶中观察到至少9个不同的蛋
噬菌体。基因组分析还表明，噬菌体 vB_EcoM_RZ 白条带，分子量范围为 5.8~143.0 kDa（图 4）。在质
不 编 码 与 毒 素 或 其 他 毒 力 因 子 相 关 的 基 因 。 谱中鉴定出43个蛋白质，包括34种已知的蛋白，此

long tail fiber distal subunit GC Skew
loader of qp41 DNA helicase DNA endonuclease Ⅳ
Ndd nucleoid disruption protein
RnaseH protector from prophage⁃induced early lysis GC Skew（-）
GC Skew（+）
homing endonuclease
single⁃stranded DNA binding protein GC content
dihydrofolate reductase
dTMP thymidylate synthase
DNA helicase
putative anti⁃sigma factor
ADP⁃ribosylase
endonuclease Ⅱ
Mrh.1
170 kbp Mrh.2
160 kbp 10 kbp
gp31.1 20 kbp
150 kbp
gp30.7
gp30.1
140 kbp 30 kbp
130 kbp 40 kbp
RZ
170 318 bp
120 kbp 50 kbp
UvsY.2
110 kbp 60 kbp
gp49.3
100 kbp 70 kbp
NrdC.6
90 kbp 80 kbp MobD.4
tail tube protein
gp19.1 thymidine kinase
tail sheath protein
Vs.1
vs.4 gene product
homing endonuclease Vs.7
fibritin
short tail fiber protein
neck protein predicted membrane protein
lysozyme murein hydrolase
baseplate tail fiber connector e.3
Trna.4 nudix hydrolase
baseplate wedge subunit and tail pin baseplate wedge subunit
neck protein baseplate wedge subunit
gp5.1 putative internal head protein
图3 噬菌体vB_EcoM_RZ的基因排布
Figure 3 Gene arrangement of phage VB_ EcoM_RZ