Page 9 - 南京医科大学学报自然科学版
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第42卷第8期 马廷政,曹平平,汪徐春,等. 利用FRET技术检测膜受体与胞外配体相互作用的优化策略[J].
2022年8月 南京医科大学学报(自然科学版),2022,42(08):1049-1054 ·1051 ·
表1 FRET实验中使用的引物
Table 1 Primers used in FRET assays
引物 序列(5′→3′)
ECFP⁃LRP6⁃F CGGGGTACCGAGAACGCGAGAAGGGAAGAT
ECFP⁃LRP6⁃R CGCGGATCCTGTACATGGTCTGCCTCATCCT
EYFP⁃WNT3A⁃F CCCAAGCTTATGGCCCCACTCGGATACTTCTTA
EYFP⁃WNT3A⁃R CCGGAATTCAGCCACCAGAGAGGAGACACTA
ECFP⁃LRP6⁃F1 CTCCTGGCCTGCAGCTTCTGTGTGCTCCTGAGAGCGGGATCCATGGTGAGCAAGGGC
ECFP⁃LRP6⁃F2 GGAATTCGCCACCATGGGGGCCGTCCTGAGGAGCCTCCTGGCCTGCAGCTTCTGTG
ECFP⁃LRP6⁃F3 TAACGGCCGCCAGTGTGCTGGAATTCGCCACCATGGGGGCCGTC
ECFP⁃LRP6⁃F4 GCGGTGGAGGTTCACTCGAGGAGGCTTTCCTTTTGTTTTCACGGAG
ECFP⁃LRP6⁃R1 GAAAACAAAAGGAAAGCCTCCTCGAGTGAACCTCCACCGCC
ECFP⁃LRP6⁃R2 GACACTATAGAATAGGGCCCTCTAGATTCAGGAGGAGTCTGTACAGGGAG
EYFP⁃WNT3A⁃F1 GGGGTACCGCCACCATGGCCCCACTCGGATACTTCTTACTCCTCTGCAGCCTGAAGCAG
EYFP⁃WNT3A⁃F2 TCCTCTGCAGCCTGAAGCAGGCTCTGGGCGGATCCATGGTGAGCAAGGGC
EYFP⁃WNT3A⁃F3 CCGCTCGAGAGCTACCCGATCTGGTGGTCGC
EYFP⁃WNT3A⁃R1 CCGCTCGAGGCCGGAGCCTCCCTTGTACAGCTCGTCCATGCCG
EYFP⁃WNT3A⁃R2 TGCTCTAGACTACTTGCAGGTGTGCACGTCG
0%、图像采集速度 2.0 μs/pixel,并使用 1 024×1 024 胞外区进行了截短,将LRP6的P1P2结构域截除,保
的图像格式。ECFP 通道由 440 nm 激光器激发,图 留LRP6的P3P4结构域(LRP6与WNT3A结合区域)
像采集使用滤波器(SMD510:480/20)。EYFP 通道 与LA结构域。
由 488 nm 激光器激发,图像采集使用 Mirror:565/ 2.2 FRET荧光融合蛋白的构建与优化
50。获取所有图像后,使用FV10⁃ASW软件(奥林巴 使用经典FRET荧光对ECFP与EYFP作为荧光
斯公司,日本)中的敏化荧光发射窗口进行FRET效 供受体,分别融合在 LRP6 或者 WNT3A 蛋白的 N 端
率及供受体距离的计算。 (图1B)。当两个目的蛋白不存在直接相互作用时,
1.3 统计学方法 使用 440 nm 激发光激发 ECFP 荧光标签时不发生
使用 FV10⁃ASW 4.0 软件进行 FRET 效率及供 FRET,只能使ECFP发出自身476 nm荧光,EYFP不
受体距离的统计学计算。采用 Graphpad 8.0 软件 发光;而当 2 个目的蛋白存在直接相互作用时,如
(https://www.graphpad.com/)进行数据的处理和分 LRP6 与 WNT3A 相互作用,ECFP 与 EYFP 之间的距
析,定量结果表示为平均值±标准误(x ± SEM)。 离≤10 nm而发生FRET现象,即440 nm激发光激发
ECFP 后,通过 FRET 可检测到 EYFP 荧光标签发出
2 结 果
的527 nm峰荧光(图1A)。
2.1 LRP6与WNT3A蛋白质三级结构分析 依据PDB与Zdock网站对WNT3A与LRP6的蛋
LRP6膜受体的胞外区由3个结构域组成,依次 白三级结构分析结果,将构建 FRET 荧光融合蛋白
为 P1P2 结 构 域(PDB ID:5GJE),可 结 合 WNT1、 荧光标签ECFP及EYFP荧光标签分别融合在LRP6
WNT2、WNT6等配体;P3P4结构域(PDB ID:3S8Z), 或者WNT3A的氨基端(图2A,上图),利用融合蛋白
可结合 WNT3、WNT3A、DKK1 等配体;LA 结构域 表达载体转染293T细胞,24 h后进行激光共聚焦显
(细胞膜锚定结构域)。利用 PDB 网站获取蛋白质 微镜观察,发现 LRP6 细胞膜定位不清晰(图 2B,上
三级结构,并使用 Zdock 数据库进行蛋白对接模型 图)。但是,使用 pCDNA3.1 作为载体,将 ECFP 荧
预测显示,LRP6 的 P3P4 结构域(PDB ID:3S8Z)与 光标签融合在 LRP6 蛋白的信号肽与成熟蛋白之
WNT3A(PDB ID:7DRT)的铰链区结合(图 1A),并 间,并使用柔性连接肽进行连接可减少对成熟蛋
且 LRP6 与 WNT3A 的氨基端和羧基端都是处于蛋 白结构与功能的影响(图 2A,下图)。转染 293T 细
白质外围开放末端,能够连接荧光标签进行FRET实 胞 24 h 后进行激光共聚焦显微镜观察显示,LRP6
验。LRP6胞外结构域为棍棒状结构,全长>20 nm, 细胞膜定位较为明显(图 2B,下图白色箭头指示膜
超出常规FRET技术10 nm检测范围。因此对LRP6 定位)。