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第42卷第9期       蔡  欣,王源林,赵 杰,等. 重组酶介导的肠出血性大肠杆菌O157:H7等温扩增方法的建立[J].
                  2022年9月                  南京医科大学学报(自然科学版),2022,42(09):1235-1239,1252                   ·1237 ·


                度为 10 μmol/L 的探针进行扩增,以浓度为 1×10 拷                               E⁃F1+E⁃R2  E⁃F2+E⁃R1  E⁃F2+E⁃R2
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                贝数/μL 质粒为模板进行荧光 RAA 法扩增,筛选出
                最佳探针浓度。                                                  20 000
                1.2.4 RAA⁃LFD法的建立                                        15 000
                    在RAA荧光法优化的条件下,将荧光法优化好                               ( mV )
                的引物和探针序列设计成 LFD 法的引物和探针。                                 10 000
                将设计好的引物探针按照 RAA 荧光法的 50 μL 体                            荧光值
                系配置反应管,将反应管置于 B⁃6100 RAA 恒温振                             5 000
                荡离心仪中震荡混匀2 min后,设置反应温度39 ℃,
                                                                            0
                反应时间16 min。反应结束后的扩增产物通过胶体                                    0   2  4   6  8  10  12  14  16
                金侧向流免疫层析试纸条检测。从反应管中取                                                    时间(min)
                                                                             图1  EHEC O157:H7引物筛选
                5 μL扩增产物,与95 μL PBS缓冲液在1.5 mL EP管
                                                                      Figure 1 Primer screening for EHEC O157:H7
                中混匀,将试纸条的偶联垫末端垂直插入EP管中,使
                其接触混合液,2 min 后取出试纸条观察并拍照记录                        时扩增曲线效果最佳。同样,探针体积为 1.0 μL
                结果(阳性样品出现红色检测线和蓝色质控线,阴性                           时,扩增效果最佳(图2B)。
                样品不出现红色检测线仅出现蓝色质控线)。                              2.2  RAA⁃LFD法的建立
                1.2.5 灵敏性实验                                           利用荧光法筛选好的引物和探针更改荧光标记
                    以 EHEC O157:H7 质粒为模板进行灵敏性评                    的位置,设计出RAA⁃LFD法的引物和探针(表2)。
                价。将构建质粒按浓度梯度 10 倍倍比稀释成 1×                         2.3  灵敏性实验
                10 ~1×10 拷贝数/μL阳性标准品备用。利用优化好                          RAA 荧光法灵敏性实验结果(图3A)显示,16 min
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                的两个 RAA 反应扩增体系依次对上述定量样品进                          左右1×10 ~1×10 拷贝数的样本均有扩增曲线出现,
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                行测定,确定方法的检出限。                                     1×10 ~1×10 拷贝数样本和阴性对照无扩增曲线,由
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                1.2.6 特异性实验                                       此得出最低检出限为1×10 拷贝数。RAA⁃LFD法的
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                    采用与消化道感染相关或者临床症状相近的                           灵敏性检测结果(图3B)显示,16 min左右1×10 ~1×
                                                                                                            4
                细菌质粒样本进行特异性评价。以5种在人群中较                            10 拷贝数出现红色检测线,1×10 ~1×10 拷贝数及
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                为常见的肠道细菌如金黄色葡萄球菌、沙门氏杆                             阴性对照仅出现蓝色质控线,RAA⁃LFD法最低检出
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                菌、弯曲菌、耶尔森菌、志贺杆菌及 EHEC O157:H7                     限为1×10 拷贝数。说明EHEC O157:H7 RAA荧光
                质粒为模板同时进行检测,评价EHEC O157:H7 RAA                    法及RAA⁃LFD法均具有较好的灵敏性。
                荧光法和RAA⁃LFD法的特异性。                                 2.4  特异性试验
                                                                      RAA荧光法检测结果(图4A)显示,只有EHEC
                2  结 果
                                                                  O157:H7 出现光滑的扩增曲线,为阳性扩增,其他
                2.1  EHEC O157:H7 RAA 扩增体系的建立                     样本如金黄色葡萄球菌、沙门氏杆菌、弯曲菌、耶尔
                2.1.1 引物、探针筛选                                     森菌、志贺杆菌及阴性对照均没有扩增,均为阴
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                    以浓度为 1×10 拷贝数/μL 的 EHEC O157:H7               性。RAA⁃LFD法显示(图4B),只有EHEC O157:H7
                质粒为模板,进行 RAA 荧光实验,筛选出最佳上下                         出现红色检测线,为阳性,其他样本及阴性对照仅
                游引物E⁃F2、E⁃R2,扩增曲线如图1所示(未扩增的                       出现蓝色质控线,均为阴性结果。表明本研究建立
                引物组合及每组的阴性对照未显示),E⁃F2、E⁃R2引                       的 RAA 荧光法和 RAA⁃LFD 法特异性较高,不会发
                物对在4 min 内即开始起峰,在16 min内达到峰值,                     生交叉反应。
                表明最佳引物组合为E⁃F2、E⁃R2。
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                2.1.2 引物和探针浓度的优化
                    根据2.1.1实验得出的最佳引物组合,以浓度为                           本研究结合 RAA 技术建立 EHEC O157:H7 的
                1×10 拷贝数/μL质粒为模板,ddH2O为阴性对照,将                     两种快速检测方法,操作简便,无须特殊学习和培
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                浓度为10 μmol/L的E⁃F2、E⁃R2引物设置5个梯度加                   训,与普通聚合酶链式反应(polymerase chain reac⁃
                样量进行RAA荧光检测(图2A),引物体积为1.5 μL                      tion,PCR)、荧光定量 PCR 技术相比,无需高温条件
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