Page 54 - 南京医科大学学报自然科学版
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第42卷第9期
               ·1248 ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2022年9月


              1.2.3 检测方法                                        者 2 例。所有检测标本 EGFR 突变阳性率 39.4%
                  采用NGS检测技术（广州燃石医学检验所有限                         （52/132）。所有检测标本除 EGFR 突变之外，另外
              公司：Illumina 公司检测平台，美国）捕获与肿瘤发                      可检测到前5位基因突变/扩增分别是肿瘤蛋白p53
              生发展高度相关基因的全部外显子，包括腺瘤性结                            （tumor suppressor protein p53，TP53）、鼠类肉瘤病毒
              肠息肉（adenomatous polyposis coli，APC）、乳腺癌易          癌基因（Kirsten rat sarcoma viral oncogene，KRAS）、
              感 基 因 1（breast cancer susceptibility gene 1，      表皮生长因子受体 2（human epithelial growth factor
              BRCA1）、细胞周期依赖性激酶抑制基因2A（cyclin⁃                    receptor 2，ERBB2）、视网膜母细胞瘤基因 1（retino⁃
              dependent kinase inhibitor 2A gene，CDKN2A）等，及     blastoma 1，RB1）、肝细胞生长因子酪氨酸激酶受体
              与肺癌个性化治疗相关或高频突变基因的重要外                             （hepatocyte growth factor receptor，MET）。
              显子及部分内含子区域，包括间变性淋巴瘤激酶                             2.2  初诊肺癌患者血液伴随基因状态
             （anaplastic lymphoma kinase，ALK）、鼠类肉瘤病毒                 共入组初诊肺癌患者血液标本50例，基于血浆

              癌基因同源物 B1（v⁃raf murine sarcoma viral onco⁃        ctDNA NGS 检测结果显示，EGFR 突变阳性率 34%
              gene homolog B1，BRAF）、细胞周期蛋白 E1（cyclin            （17/50），除 EGFR 突变之外，所检测标本还可检测
              E1，CCNE1）等，进行 1 000×高深度测序，以测量上                    到 79 种基因突变/扩增，共出现 123 次伴随基因突

              述基因中出现的低频及超低频的来自肿瘤的 DNA                           变/扩增，人均2.46次/例（123次/50例），伴随基因突
              突变、重排、拷贝数增加等。                                     变/扩增频数≥2 次的见图 1，伴随基因突变/扩增频
              1.2.4 生存随访                                        数为 1 次的共有 60 种基因，伴随基因突变/扩增（除
                  通过门诊或电话随访，于 2016 年 1 月开始，每                    EGFR 外）与患者临床分期、吸烟、年龄、性别、病理
              个月随访1次，直至患者死亡或研究结束。随访截至                           类型均无关（均P＞0.05，表1）。
              2020年11月30日，患者在随访截止时间仍未死亡，                             除 EGFR 突变之外，初诊肺癌患者血液标本中
              则按截尾数据处理。中位随访时间28.5个月。随访                          伴随基因TP53突变频数最高，因此针对此基因做进
              率为95%，3例失访。总生存期（overall survival，OS）              一步生存分析。入组Ⅳ期肺癌患者血液标本40例，
              定义为患者治疗开始至患者死亡或末次随访的时间，                           TP53阳性患者中位OS为66个月，TP53阴性患者中
              中位OS定义为生存率为50%时所对应的生存时间。                          位 OS 为 47 个月，两组生存曲线差异无统计学意义
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              1.3  统计学方法                                        （χ =0.321，P=0.571，图2）。
                  采用 GraphPad Prism7.0 统计软件进行统计分                2.3  初诊肺癌患者肿瘤组织伴随基因状态
              析。定性资料采用例数和率描述；符合正态分布的                                 共入组初诊肺癌患者肿瘤组织 46 例，EGFR 突
              定量资料，采用均数±标准差（x ± s）表示；非正态分                       变阳性率 50%（23/46），除 EGFR 突变之外，所检测
              布资料，采用中位数（四分位数）［M（P25，P75 ）］表示，                   标本还可检测到 160 种基因突变/扩增，所有标本
              两组间比较采用Mann⁃Whitney U检验，多组间比较                     共出现 285 次伴随基因突变/扩增，人均 6.20 次/例
              采用 Kruskal⁃Wallis 检验，配对设计资料采用 Wil⁃                （285 次/46 例），伴随基因突变/扩增频数≥2 次的见
              coxon 符号秩和检验。采用 Kaplan⁃Meier 法绘制生                 图 3，伴随基因突变/扩增频数为 1 次的共有 107 种，
              存曲线图，比较采用 Log⁃rank 检验，P < 0.05 为差异                伴随基因突变/扩增（除EGFR 外）与患者临床分期、
              有统计学意义。                                           年龄均无关（均 P＞0.05），与吸烟状态、性别、病理
                                                                类型均有关（均P＜0.05，表2）。
              2  结 果
                                                                     除 EGFR 突变之外，初诊肺癌患者肿瘤组织标
              2.1  一般临床资料                                       本中伴随基因TP53出现突变频数最高，因此针对此
                  本研究共入组 71 例患者，共 132 份标本，检测                    基因做进一步生存分析，入组Ⅳ期肺癌患者肿瘤组
              标本类型包括血液（67 份）、肿瘤组织（48 份）、胸腔                      织标本 25 例，TP53 阳性患者中位 OS 未达到，TP53
              积液（15 份）、脑脊液（2 份）。71 例患者均为初诊患                     阴性患者中位OS为38.5个月，两组生存曲线间差异
              者，其中男性 32 例、女性 39 例；年龄（65±11）岁，年                  无统计学意义（χ =0.309，P=0.579，图4）。
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              龄范围36~85岁；其中Ⅰ期患者2例，Ⅱ期患者3例，                        2.4  同时进行肿瘤组织和血液标本配对检测的患
              Ⅲ期患者 3 例，Ⅳ期患者 63 例；吸烟患者 23 例；腺                    者伴随基因状态
              癌患者 62 例，鳞状细胞癌患者 7 例，小细胞肺癌患                            共入组 25 例，初诊肿瘤组织中基因突变/扩增
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