Page 26 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第11期
·1498 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年11月
A B
1 197
0.1
0 41
0 0.0
TP53 39%
TTN 36% 富集评分 -0.1
MUC16 34%
CSMD3 33%
RYR2 30% -0.2 KEGG_细胞周期
ZFHX4 29% KEGG_ECM受体相互作用
LRP1B 26%
USH2A 26% -0.3 KEGG_黏着斑
SPTA1 23% KEGG_同源重组
XIRP2 23% KEGG_紧密连接
KRAS 22%
NRXN1 21%
PTPRD 21%
ADAMTS12 20%
COL11A1 20%
NAV3 20%
NPAP1 20%
FLG 19% 高表达 低表达
PCDH15 19%
ZNF536 19%
APOB 18%
PAPPA2 18%
PCLO 18%
JNR 18%
ANK2 17%
PCDH11X 17%
DNAH9 16%
FBN2 16%
SI 16%
ZNF804A 16%
错义突变 框内缺失
移码插入突变 移码缺失突变
无义突变 多重突变
C D
VT11B
MALT1
YKT6 LITAF EPM2AIP1
XIAP
LITAF NFE2L1
ATP1B4 AGO1 ZSCAN29 PURA
hsa⁃miR⁃446c⁃5p MAP2K7 POU4F1
MFSD8 ZNF317
POLR2F
MET
SAMD4B POLR2F
IFNLR1 ITGA11 BTRC MYC
MRPL12
MLLT1
MLLT1 ZNF451
ATP1B4
ZNF264
hsa⁃miR⁃446c⁃5p CDK6
ZNF582
GIGYF1
MET TGFBR2 CNOT4
BTRC XRCC6 SHROOM2 IGF1R
IGF1R
IADE2
MYC XIAP
ATXNIL
CDK6 TGFBR2
ATXN1
MALT1
FERMT2
MAP3K7
A:瀑布图显示105例miR⁃449c低表达肺腺癌中突变基因的情况,右侧百分比表示基因突变频率;B:富集分析显示miR⁃449c显著富集的
信号通路;C:网络图显示miRNA靶基因KEGG通路调控网络;D:网络图显示miRNA靶基因GO功能调控网络。
图2 突变和富集分析
Figure 2 Mutates and enrichment analysis
2.5 miR⁃449c可以调节肺腺癌细胞中c⁃Myc、CDK6 mRNA表达显著升高(图 5C),差异均有统计学意义。
和MET基因的表达 进一步 Western blot 检测蛋白表达,结果显示
为了验证在肺腺癌细胞中 miR⁃449c 是否在 miR⁃449c 过表达后,PC9 和 A549 细胞中 c⁃Myc 及其
c⁃Myc、CDK6和MET信号转导通路中发挥着相应的 下 游 细 胞 周 期 调 节 因 子 Cyclin D1、Cyclin D2 和
作用,首先检测了miR⁃449c过表达后c⁃Myc、CDK6和 Cyclin E2 蛋白表达均显著降低;miR⁃449c过表达后
MET mRNA水平的变化。结果显示,与对照miR⁃NC MET蛋白表达在两株细胞中结果并不一致;在PC9细
组相比,miR⁃449c过表达后A549和PC9细胞中c⁃Myc 胞中,miR⁃449c过表达后CDK6蛋白表达显著增加,
和 MET mRNA 表达显著降低(图 5A、B),但 CDK6 但A549细胞中CDK6蛋白表达量均较低(图 5D),因