Page 26 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 26

第43卷第11期
               ·1498 ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2023年11月


              A                                                 B
                  1 197
                                                                    0.1
                                                     0      41
                     0                                              0.0
                    TP53                          39%
                    TTN                           36%              富集评分  -0.1
                  MUC16                           34%
                  CSMD3                           33%
                   RYR2                           30%              -0.2  KEGG_细胞周期
                  ZFHX4                           29%                    KEGG_ECM受体相互作用
                  LRP1B                           26%
                  USH2A                           26%              -0.3  KEGG_黏着斑
                  SPTA1                           23%                    KEGG_同源重组
                   XIRP2                          23%                    KEGG_紧密连接
                   KRAS                           22%
                  NRXN1                           21%
                  PTPRD                           21%
               ADAMTS12                           20%
                 COL11A1                          20%
                   NAV3                           20%
                  NPAP1                           20%
                    FLG                           19%                             高表达          低表达
                 PCDH15                           19%
                  ZNF536                          19%
                   APOB                           18%
                 PAPPA2                           18%
                   PCLO                           18%
                    JNR                           18%
                   ANK2                           17%
                PCDH11X                           17%
                  DNAH9                           16%
                   FBN2                           16%
                      SI                          16%
                 ZNF804A                          16%
                      错义突变           框内缺失
                      移码插入突变         移码缺失突变
                      无义突变           多重突变
              C                                                 D
                                VT11B
                                     MALT1
                              YKT6                                                               LITAF EPM2AIP1
                                          XIAP
                            LITAF                                                             NFE2L1
                                                                              ATP1B4 AGO1 ZSCAN29 PURA
                                hsa⁃miR⁃446c⁃5p    MAP2K7                                   POU4F1
                           MFSD8                                        ZNF317
                                           POLR2F
                                                                                         MET
                                                                      SAMD4B                     POLR2F
                         IFNLR1  ITGA11        BTRC                                                    MYC
                                                                                    MRPL12
                                                                                                MLLT1
                                  MLLT1                             ZNF451
                                         ATP1B4
                                                                     ZNF264
                                                                                        hsa⁃miR⁃446c⁃5p  CDK6
                                                                       ZNF582
                                                                                                  GIGYF1
                       MET              TGFBR2                          CNOT4
                                                                          BTRC        XRCC6  SHROOM2  IGF1R
                             IGF1R
                                                                            IADE2
                                             MYC                             XIAP
                                                                                        ATXNIL
                                      CDK6                                                        TGFBR2
                                                                                      ATXN1
                                                                            MALT1
                                                                                          FERMT2
                                                                                  MAP3K7
                 A:瀑布图显示105例miR⁃449c低表达肺腺癌中突变基因的情况,右侧百分比表示基因突变频率;B:富集分析显示miR⁃449c显著富集的
              信号通路;C:网络图显示miRNA靶基因KEGG通路调控网络;D:网络图显示miRNA靶基因GO功能调控网络。
                                                      图2 突变和富集分析
                                             Figure 2 Mutates and enrichment analysis
              2.5  miR⁃449c可以调节肺腺癌细胞中c⁃Myc、CDK6                 mRNA表达显著升高(图 5C),差异均有统计学意义。
              和MET基因的表达                                              进一步 Western blot 检测蛋白表达,结果显示
                  为了验证在肺腺癌细胞中 miR⁃449c 是否在                      miR⁃449c 过表达后,PC9 和 A549 细胞中 c⁃Myc 及其
              c⁃Myc、CDK6和MET信号转导通路中发挥着相应的                       下 游 细 胞 周 期 调 节 因 子 Cyclin D1、Cyclin D2 和
              作用,首先检测了miR⁃449c过表达后c⁃Myc、CDK6和                   Cyclin E2 蛋白表达均显著降低;miR⁃449c过表达后
              MET mRNA水平的变化。结果显示,与对照miR⁃NC                      MET蛋白表达在两株细胞中结果并不一致;在PC9细
              组相比,miR⁃449c过表达后A549和PC9细胞中c⁃Myc                  胞中,miR⁃449c过表达后CDK6蛋白表达显著增加,
              和 MET mRNA 表达显著降低(图 5A、B),但 CDK6                  但A549细胞中CDK6蛋白表达量均较低(图 5D),因
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