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第43卷第5期 刘士玮,罗嘉强,朱子珏,等. 单细胞转录组测序技术在人精原干细胞研究中的应用[J].
2023年5月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(5):732-737 ·733 ·
变发展形成多种单细胞测序方案。其主要过程包 胞时,不会忽略细胞间差异,更能代表整个睾丸的
括细胞悬液样本制备、单细胞捕获、逆转录、cDNA 细胞组成(图1)。近年来,scRNA⁃seq技术在人睾丸
扩增、文库构建、测序及后续分析 。scRNA⁃seq能 细胞的研究应用不断被报道 [6-8] ,本文旨在综述单细
[4]
够精细描述细胞类型、揭示细胞异质性并推测其发 胞转录组测序技术在人SSCs研究中的应用,以期揭
[5]
育轨迹 。因此,scRNA⁃seq 独特而强大,可分析睾 示 SSCs 亚型种类及其转录组水平和生物学功能变
丸个体细胞转录组特征,在检测数千个甚至更多细 化,为SSCs的机制研究提供理论基础。
支持细胞
精子
睾丸样本获取 精子细胞
精母细胞
精原细胞
精原干细胞
间质细胞
测序
组织消化
(单细胞悬液制备) 单细胞捕获 建库
ST
PTM
EC LC
SPG
SPC M
下游分析 聚类与注释 数据过滤
(差异分析、GO注释等) (质量控制)
图1 人睾丸scRNA⁃seq分析流程图
Figure 1 Flow chart of human testis scRNA⁃seq analysis
儿期(12、15、16 周)和婴儿期(5 个月)睾丸进行
1 基于scRNA⁃seq技术揭示SSCs起源
scRNA⁃seq分析,并与前期成人睾丸scRNA⁃seq数据
SSCs 起 源 于 原 始 生 殖 细 胞(primordial germ 进行比较。在SSCs形成前期过程,共鉴定出2种细
cells,PGCs),作为精子发生源头维持产生成熟配 胞阶段,包括:①PGCs 阶段(存在于胚胎、胎儿期):
子。然而,人 PGCs 向 SSCs 分化这一过程涉及的转 特异表达TFAP2C、KIT、NANOG、POUF51、SOX17等
录组水平及功能变化仍未完全阐明,scRNA⁃seq 技 基因;②stage f0阶段(存在于胎儿、婴儿期):特异表
[9]
术有助于认识这一变化过程。 达 PIWIL4、EGR4、MSL3、TSPAN33 等基因 。该发
[8] [6]
Guo 等 将 scRNA⁃seq 鉴定出的成人原始 SSCs 现与前期 Sohni 等 在婴儿期睾丸 scRNA⁃seq 分析
(stage 0阶段)与婴儿(12~13个月)生殖细胞数据进 工作中鉴定的 PGCs 及前 SSCs 阶段相吻合。进一
行降维处理及拟时序分析。结果表明,大部分stage 步,该团队对两阶段的特异表达基因进行GO注释,
0 阶段的基因标志物(PIWIL4、TSPAN33 等)在婴儿 发现 PGCs 阶段与信号转导、性腺和干细胞发育等
生殖细胞中表达上调,发育轨迹上两者位置毗邻, 生物学功能有关,在进入胎儿期时,这些功能通路
提示该婴儿生殖细胞可能是PGCs演变成SSCs的过 受到明显抑制;stage f0 阶段中涉及转录、同源异形
渡阶段。后期,该团队进一步对胚胎期(6~8周)、胎 的相关基因表达上调,同时,发现 SSCs 基因标志物