Page 154 - 南京医科大学学报自然科学版

第43卷第5期
·736 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年5月

可以结合显微成像和测序技术在获得基因表达 ［6］ SOHNI A，TAN K，SONG H W，et al. The neonatal and
数据的同时最大程度地保留样本的空间位置信 adult human testis defined at the single ⁃ cell level［J］.
息 ［27］ ，结合scRNA⁃seq 技术鉴定的不同SSCs亚群及 Cell Rep，2019，26（6）：1501-1517
转录组水平信息，可以有效描述不同SSCs亚群的空 ［7］ BIRNBAUM K D. Power in numbers：single⁃cell RNA⁃
Seq strategies to dissect complex tissues［J］. Annu Rev
间组成及转录组水平变化。其二，scRNA⁃seq 技术
Genet，2018，52：203-221
是在转录组水平上描述精原干细胞，仅能比较不同
［8］ GUO J，GROW E J，MLCOCHOVA H，et al. The adult hu⁃
SSCs亚群的转录组水平变化。然而，精子发生这一
man testis transcriptional cell atlas［J］. Cell Res，2018，28
复杂过程受到多方面调控，由于技术限制，scRNA⁃seq （12）：1141-1157
技术无法描述不同SSCs亚群在代谢组学、蛋白质水 ［9］ GUO J，SOSA E，CHITIASHVILI T，et al. Single⁃cell anal⁃
平、转录后调控如 microRNA 等水平上的变化。基 ysis of the developing human testis reveals somatic niche
于 scRNA⁃seq 技术，联合多组学分析能有效描述精 cell specification and fetal germline stem cell establish⁃
原干细胞在精子发生中的生物过程。 ment［J］. Cell Stem Cell，2021，28（4）：764-778
综上所述，scRNA⁃seq 技术可高效捕获睾丸内 ［10］ CLERMONT Y. Renewal of spermatogonia in man［J］. Am
J Anat，1966，118（2）：509-524
单个细胞，进行高通量测序分析，获取其转录组水
［11］ HERMANN B P，SUKHWANI M，HANSEL M C，et al.
平信息，精细描述细胞类型，揭示细胞异质性，推测
Spermatogonial stem cells in higher primates：are there
其发育轨迹。近年，诸多研究鉴定不同 SSCs 亚群， differences from those in rodents?［J］. Reproduction，
揭示其转录谱水平及功能变化，提供用于鉴定、分 2010，139（3）：479-493
选SSCs 亚群的基因标志物，为SSCs 自我更新、增殖 ［12］ EHMCKE J，WISTUBA J，SCHLATT S. Spermatogonial
与分化研究提供理论基础。然而，scRNA⁃seq 技术 stem cells：questions，models and perspectives［J］. Hum
是基于已消化的睾丸细胞，从而难以揭示睾丸空间 Reprod Update，2006，12（3）：275-282
异质性。另外，个体之间存在遗传差异，因而不同 ［13］ SHAMI A N，ZHENG X，MUNYOKI S K，et al. Single⁃
cell RNA sequencing of human，macaque，and mouse tes⁃
研究分析结果存在偏差。未来，对人睾丸 scRNA⁃
tes uncovers conserved and divergent features of mamma⁃
seq数据集，进行大样本联合分析具有重要价值，有
lian spermatogenesis［J］. Dev Cell，2020，54（4）：529-
助于区分样本及细胞类型差异；进一步联合多组学
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（空间转录组学、DNA 甲基化组、组蛋白修饰等）分
［14］HERMANN B P，CHENG K，SINGH A，et al. The mam⁃
析，更有助于阐释睾丸SSCs空间构成及其转录组水 malian spermatogenesis single ⁃ cell transcriptome，from
平，在揭示SSCs增殖与分化调控机制并深入研究精 spermatogonial stem cells to spermatids［J］. Cell Rep，
子发生生物学过程中具有重要价值，可能为男性不 2018，25（6）：1650-1667
育诊疗提供新策略。 ［15］GUO J，GROW E J，YI C，et al. Chromatin and single⁃cell
RNA⁃Seq profiling reveal dynamic signaling and metabol⁃
［参考文献］
ic transitions during human spermatogonial stem cell de⁃
［1］ ZHU F，YAN P，ZHANG J，et al. Deficiency of TPPP2，a velopment［J］. Cell Stem Cell，2017，21（4）：533-546
factor linked to oligoasthenozoospermia，causes subfertility ［16］ WANG M，LIU X，CHANG G，et al. Single⁃cell RNA se⁃
in male mice［J］. J Cell Mol Med，2019，23（4）：2583-2594 quencing analysis reveals sequential cell fate transition
［2］ MAKELA J A，HOBBS R M. Molecular regulation of sper⁃ during human spermatogenesis［J］. Cell Stem Cell，2018，
matogonial stem cell renewal and differentiation［J］. Re⁃ 23（4）：599-614
production，2019，158（5）：R169-R187 ［17］DI PERSIO S，TEKATH T，SIEBERT⁃KUSS L M，et al.
［3］ TANG F，BARBACIORU C，WANG Y，et al. mRNA⁃Seq Single ⁃ cell RNA ⁃ seq unravels alterations of the human
whole ⁃ transcriptome analysis of a single cell［J］. Nat spermatogonial stem cell compartment in patients with im⁃
Methods，2009，6（5）：377-382 paired spermatogenesis［J］. Cell Rep Med，2021，2（9）：
［4］ LUECKEN M D，THEIS F J. Current best practices in sin⁃ 100395
gle⁃cell RNA⁃seq analysis：a tutorial［J］. Mol Syst Biol， ［18］ POTTER S J，DEFALCO T. Role of the testis interstitial
2019，15（6）：e8746 compartment in spermatogonial stem cell function［J］. Re⁃
［5］ WU A R，WANG J，STREETS A M，et al. Single⁃cell tran⁃ production，2017，153（4）：R151⁃R162
scriptional analysis［J］. Annu Rev Anal Chem（Palo Alto ［19］ HASEGAWA K，SAGA Y. FGF8⁃FGFR1 signaling acts as
Calif），2017，10（1）：439-462 a niche factor for maintaining undifferentiated spermato⁃