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第43卷第7期
·1006 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年7月
p14ARF 和 p73 等启动子区 CpG 岛的高甲基化会抑 的组蛋白H3K4me3富集增加,并调控了IL⁃17A的表
制其表达。组蛋白修饰也可调控基因表达。组蛋 达 [21] 。根据上述的研究,我们提出PAH—一碳代谢
白甲基化是一种常见的组蛋白标记,通过在赖氨酸 —表观遗传—炎症因子的调控轴,从代谢角度解读
或精氨酸残基上添加甲基而发生 [24] 。一般来说, 了PAH影响儿童哮喘发生发展的分子机制。
H3K4、H3K36 和 H3K79 被认为是占据染色质中活
3 基于色氨酸代谢解析PAH相关炎症的机制
跃转录基因区域的活性标记。H3K9、H3K27 和
H4K20 被称为抑制标记,通常与沉默的基因表达相 3.1 色氨酸代谢与炎症
关 [25] 。组蛋白H3K4在增强子区域和启动子区域高 色氨酸(tryptophan,Trp)是一种必需的芳香族
度富集,它的甲基化调节在转录启动子区中发挥作 氨基酸,是许多微生物代谢物和宿主代谢物的生物
用,有助于促进 RNA 聚合酶Ⅱ的募集 [26] 。一项对 合成前体。色氨酸在肠道免疫功能和肠道菌群的
哮喘儿童表观遗传模式的分析发现,哮喘儿童的 平衡中起着至关重要的作用。色氨酸代谢遵循三
LINE⁃1甲基化水平显著升高,这表明全基因组甲基 个主要途径:①肠道微生物群将色氨酸直接转化
化水平上升。PAH 中 FLA 的内暴露水平与 LINE⁃1 为吲哚代谢物,可激活芳香受体(aryl hydrocarbon
[33]
的甲基化呈正相关。另一方面,研究表明基因特异 receptor,AHR) ;②免疫细胞和上皮细胞中通过吲
性高甲基化与多环芳烃暴露之间存在正相关。例 哚胺 2,3⁃双加氧酶(indoleamine 2,3⁃dioxygenase,
如,亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR, IDO)代谢的犬尿氨酸途径 [34] ;③通过色氨酸羟化酶
BSP)发现多环芳烃暴露的工人外周血淋巴细胞中 1(recombinant tryptophan hydroxylase 1,TPH1)在肠
[35]
抑癌基因p16INK4α的CpG位点特异性高甲基化 。 嗜铬细胞中代谢产生5⁃羟色胺的途径 。
[27]
2.3 PAH通过一碳代谢介导表观遗传诱发哮喘 临床研究表明,色氨酸代谢与炎症性肠病
已有研究表明环境刺激能改变 DNA 甲基化模 (inflammatory bowel disease,IBD)相关。人群队列研
式,包括全基因组和特异性DNA甲基化。一项在纽 究结果表明,IBD 患者血清中色氨酸水平降低 [36] 。
约市的队列研究发现孕期暴露 PAH 会导致新生儿 此外,克罗恩病(Crohn’s disease,CD)患者血清中色
脐带血中白细胞全基因组低甲基化 [28] 。另有针对 氨酸含量远低于正常人群 [36] ,并且其患者的粪便中
新生儿脐带血中的PAH⁃DNA加合物与LINE⁃1甲基 色氨酸含量升高 [37] 。动物模型研究显示,低色氨酸
化水平的研究发现,产前暴露PAH与全基因组低甲 饮食也增加了小鼠对葡聚糖硫酸钠引起的炎症的
基化相关 [29] 。烟草烟雾中的 PAH 也被证明可以降 易感性 [38] 。除肠道炎症外,哮喘等炎症性呼吸道疾
低启动子区 CpG 位点的甲基化水平,促进 RUNX3、 病也与色氨酸代谢异常相关。其中同时存在多种
IL6R 等基因的表达,增加罹患心血管疾病的风 食物过敏的哮喘患者犬尿氨酸、喹啉酸、血清素比
险 [30] 。同时,这些基因与炎症疾病相关,例如,在过 单一食物过敏患者显著降低 [39] ;Ciprandi 等 [40] 报道
敏性哮喘患者气道中IL⁃6R水平升高。相关的研究 过敏性鼻炎患者的血清中色氨酸和犬尿氨酸水平
显示环境 PAH 的暴露会引起哮喘和过敏性鼻炎患 高于对照组;同样,Kositz 等 [41] 报告称,过敏患者血
者 Treg 细胞中 FOXP3 启动子区高甲基化,并降低 清中的色氨酸水平高于健康献血者,并表明较高的
FOXP3 的表达 [31] 。无论全基因组还是特异性 DNA 色氨酸水平可能是由于特异性中 IDO⁃1 活性较低。
都显示出与 PAH 相关的甲基化模式改变。这些人 以上研究表明,色氨酸代谢谱的改变可以增加机体
群研究表明PAH作为环境因素的潜在作用,可以通 的易感性或直接诱发炎症。
过改变特异性位点的表观遗传来调控基因表达。 3.2 色氨酸代谢物可作为环境污染物暴露标志物
Seumois 等 [32] 对哮喘患者与对照组人群的初始 T 细 色氨酸代谢物除了与机体免疫稳态相关,还能
胞、CD4 T 细胞、辅助性 T 细胞 1(T helper cell 1, 作为环境污染物的暴露标志物,包括色氨酸、吲哚、
+
Th1)和 辅 助 性 T 细 胞 2(T helper cell 2,Th2)中 犬尿酸、犬尿氨酸、黄尿酸、5⁃甲氧基色氨酸和硫酸
H3K4me2的全基因组分布分析发现,H3K4me2富集 吲哚酚 [42] 。高镉暴露地区的人群研究显示镉的暴
的增强子区与细胞类型相关。这个结果表明参与T 露会引起色氨酸代谢异常。随着女性居民镉暴露
细胞分化的DNA 与H3K4me2结合存在哮喘特异性 程度加重,色氨酸水平上调;乙酰血清素随其暴露
差异。PAH暴露动物模型的肺组织中,通过染色质 程度的上升而下降。在评估女性孕期空气污染与
免疫沉淀实验检测发现结合在 IL⁃17A 启动子区域 代谢标志物相关的研究中发现,与空气污染和辅助