Page 20 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 20

第43卷第7期
               ·906 ·                            南 京    医 科 大 学 学         报                        2023年7月


              A    50                                             B               Hb +/-          WT
                                                                             1     2    3    1     2    3
                                                                                                             2
                   40
                                                                                                             1
                                                                                                             0
                   30                                下调:881                                                  -1
                 -lgP                                无差异                                                     -2
                   20                                上调:794
                   10
                   0
                        -10    -5      0      5
                              log2 (fold change)
                     C              Oxidative phosphorylation                        26
                             NOD⁃like receptor signaling pathway                 44
                                   Glycolysis/Gluconeogenesis                 16
                            Cytokine⁃cytokine receptor interaction            31
                                 Starch and sucrose metabolism         9
                         Non⁃alcoholic fatty liver disease(NAFLD)     14                 -lgP
                                                                       25
                        KEGG Term  Cardiac muscle contraction      26  19                  12
                                   Biosynthesis of amino acids
                                        Carbon metabolism
                                                                                           10
                                                                   15
                                                                                           8
                                             Necroptosis
                           Nicotinate and nicotinamide metabolism
                                     NIF⁃1 signaling pathway    16 9                       6 4
                             Toll⁃like receptor signaling pathway  13
                                     FoxO signaling pathway    20
                                              Lysosome         20
                                   Pentose phosphate pathway   6
                                     IL⁃17 signaling pathway   12
                                 NF⁃kappa B signaling pathway  16
                                                      0          5           10
                                                                      -lgP
                      D            Hb +/-      WT                     E
                                 1   2  3   1   2  3
                                                             1.5
                                                     hif1al  1.0           50
                                                             0.5                 WT
                                                             0                   Hb +/-              ***
                                                             -0.5          40
                                                             -1.0
                                                                          基因相对表达量  20
                                                     hbba2   -1.5          30
                                                     tnnt2c                10              ***  ***
                                                                           1.0
                                                     cybb                  0.5   ***  ***
                                                                            0
                                                                               hif1al  hbba2 tnnt2c  cybb  nos2b
                                                     nos2b

              F
                         Ⅰ                                   Ⅲ                               Ⅴ
                                                                                                 ATP
                                                                                                synthase
                                                Ⅱ                          Ⅳ
                                                          QCR9,QCR10                       ATP6A,ATP6B,ATP6C,
                                                                       COX5B,COX6B,COX7A
                         ND2,ND6              SDH4                                         ATP6E,ATP6N,ATP6L,
                      NDUFA2,NDUFA3,                                                            ATP6S1
                      NDUFA4,NDUFB3,
                      NDUFB7,NDUFB10,

                 A:火山图显示Hb (实验组)和WT(对照组)之间基因上调(红色)、下调(蓝色)和无差异(灰色);B:差异表达基因表达模式的聚类热图,
                             +/-
              红色表示基因表达上调,蓝色表示基因表达下调;C:Hb 中显著富集的与心血管发育相关的KEGG通路;D:hif1al、hbba2、tnnt2c、cybb、nos2b基
                                                    +/-
              因在Hb 和WT 中表达差异热图,红色表示上调,蓝色表示下调;E:差异基因定量PCR 验证,与WT 比较, P < 0.001(n=3);F:氧化磷酸化途
                    +/-
                                                                                      ***
              径,红色方框内基因表达上调,绿色方框内基因表达表示下调。
                                      图6 成年斑马鱼心脏转录组分析及差异基因qRT⁃PCR的验证
                             Figure 6 Transcriptome analysis and qRT⁃PCR verification of adult zebrafish hearts
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