Page 20 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第7期
·906 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年7月
A 50 B Hb +/- WT
1 2 3 1 2 3
2
40
1
0
30 下调:881 -1
-lgP 无差异 -2
20 上调:794
10
0
-10 -5 0 5
log2 (fold change)
C Oxidative phosphorylation 26
NOD⁃like receptor signaling pathway 44
Glycolysis/Gluconeogenesis 16
Cytokine⁃cytokine receptor interaction 31
Starch and sucrose metabolism 9
Non⁃alcoholic fatty liver disease(NAFLD) 14 -lgP
25
KEGG Term Cardiac muscle contraction 26 19 12
Biosynthesis of amino acids
Carbon metabolism
10
15
8
Necroptosis
Nicotinate and nicotinamide metabolism
NIF⁃1 signaling pathway 16 9 6 4
Toll⁃like receptor signaling pathway 13
FoxO signaling pathway 20
Lysosome 20
Pentose phosphate pathway 6
IL⁃17 signaling pathway 12
NF⁃kappa B signaling pathway 16
0 5 10
-lgP
D Hb +/- WT E
1 2 3 1 2 3
1.5
hif1al 1.0 50
0.5 WT
0 Hb +/- ***
-0.5 40
-1.0
基因相对表达量 20
hbba2 -1.5 30
tnnt2c 10 *** ***
1.0
cybb 0.5 *** ***
0
hif1al hbba2 tnnt2c cybb nos2b
nos2b
F
Ⅰ Ⅲ Ⅴ
ATP
synthase
Ⅱ Ⅳ
QCR9,QCR10 ATP6A,ATP6B,ATP6C,
COX5B,COX6B,COX7A
ND2,ND6 SDH4 ATP6E,ATP6N,ATP6L,
NDUFA2,NDUFA3, ATP6S1
NDUFA4,NDUFB3,
NDUFB7,NDUFB10,
A:火山图显示Hb (实验组)和WT(对照组)之间基因上调(红色)、下调(蓝色)和无差异(灰色);B:差异表达基因表达模式的聚类热图,
+/-
红色表示基因表达上调,蓝色表示基因表达下调;C:Hb 中显著富集的与心血管发育相关的KEGG通路;D:hif1al、hbba2、tnnt2c、cybb、nos2b基
+/-
因在Hb 和WT 中表达差异热图,红色表示上调,蓝色表示下调;E:差异基因定量PCR 验证,与WT 比较, P < 0.001(n=3);F:氧化磷酸化途
+/-
***
径,红色方框内基因表达上调,绿色方框内基因表达表示下调。
图6 成年斑马鱼心脏转录组分析及差异基因qRT⁃PCR的验证
Figure 6 Transcriptome analysis and qRT⁃PCR verification of adult zebrafish hearts