Page 15 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 15

第43卷第7期         黄梓熙,孟 琳,陈良标,等. 斑马鱼3号染色体血红蛋白基因敲除对心血管发育的影响[J].
                  2023年7月                     南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(07):900-908                       ·901 ·


                    心血管疾病(cardiovascular disease,CVD)的患           1.2.2  CRISPR/Cas9敲除
                                                                                           [7]
                病率近年来逐步提升,已经成为我国重大公共卫生                                利用 CRISPR/Cas9 技术 对斑马鱼 3 号染色体
                问题,每年有2/5的死亡可归因于CVD 。除此之外,                        上编码血红蛋白的基因片段 hbba2 到 hbae3 进行双
                                                 [1]
                CVD的治疗费用也十分高昂,并且仍在不断增长                    [2-3] 。  靶点敲除(图1)。基因敲除后利用基因组DNA提取
                因此,CVD 的影响因素和治疗方法都需要深入研                           试剂盒提取 DNA,进行基因组扩增。参照 NCBI 上
                究。红细胞是运输氧气的载体,血红蛋白在机体内                            斑马鱼基因序列设计引物,并在上海生工公司进行
                发挥着重要的作用,虽然血红蛋白水平和CVD之间                           合成。分别使用 3 对引物进行 PCR 扩增,鉴定斑马
                的关系仍不明确,但是它与携氧量、血流量及某些炎                           鱼的基因型。鉴别结果可分为以下 3 种情况,①使
                症过程相关,而有研究显示,血红蛋白水平和 CVD 之                        用第 1 对引物进行扩增:上游引物 H6⁃1⁃F(5′⁃GT⁃
                间的关系并不是线性关系 ,而是呈 U 型相关 ,                          GAAAGGGTGCTGGTTGTT⁃3′);下游引物 H5⁃12⁃R
                                        [4]
                                                           [5]
                因此血红蛋白水平增高或降低都可能与 CVD 有密                         (5′⁃TTAGCTTGCAGAGAGACGGA⁃3′)。扩增后无
                切的关系 ,目前对于血红蛋白水平调控心血管发                            条带则为野生型(WT)斑马鱼;若扩增出220 bp的条
                        [6]
                育的机制研究较少。                                         带,则说明此斑马鱼为杂合子(Hb )或纯合子
                                                                                                    +/-
                    斑马鱼基因与人类具有高度的同源性,本研                          (Hb ),接着再分别使用HB⁃2⁃F1(5′⁃CAAAGCTTA⁃
                                                                      -/-
                究充分利用斑马鱼易于繁殖、便于在体观察的                              AATGTTCGTGC⁃3′)、HB⁃2⁃R1(5′⁃CGATGACAAT⁃
                特点以及现有成熟的基因操纵技术,首次在斑                              GCTCAGGCAGTC⁃3′)和 H5⁃2⁃F(5′⁃GCGTTCAAA⁃
                马鱼中使用 CRISPR/Cas9 技术对 3 号染色体上血                    ACAATGCTCTTC⁃3′)、H5⁃2⁃R(5′⁃GGGTAAACGAA⁃
                红蛋白基因从 hbba2 到 hbae3 的片段进行敲除,对                    CAAAGTCCTGTAAA⁃3′)两对引物扩增;②若扩增
                基因敲除后斑马鱼的血红蛋白水平及不同时期心                             出472 bp和393 bp的目的条带,则此斑马鱼为杂合
                血管发育进行研究,以阐明血红蛋白水平变化影                             子(Hb );③若扩增不出 472 bp 和 393 bp 的目的条
                                                                        +/-
                响心血管发育的分子机制,为 CVD 的防治提供新                          带,则此斑马鱼为纯合子(Hb )。PCR 扩增的反应
                                                                                            -/-
                思路。                                               条件为:95 ℃下预变性 5 min;95 ℃下变性 30 s,
                                                                  62 ℃(/58 ℃/55 ℃)下退火 30 s,72 ℃下延伸 30 s,共
                1 材料和方法
                                                                  进行 35 个循环;最后在 72 ℃下再延伸 5 min。PCR
                1.1  材料                                           产物使用1.5%的琼脂糖凝胶电泳成像。
                    邻联茴香胺(o⁃Dianisidine)粉末(Sigma公司,美              1.2.3  固蓝染色
                国);rTaq 酶、PrimeScript TM  RT Master Mix 试剂盒、          血 红 蛋 白 催 化 过 氧 化 氢 释 放 出 氧 后 会 使
                TB Green Premix Ex Taq (TaKaRa 公司,日本);            o⁃Dianisidine 呈现出铁锈的颜色,根据这一特性,使
                        ®
                                       TM
                PBS 缓冲液、甲基纤维素(北京索莱宝);Tween⁃20、                    用o⁃Dianisidine 检测受精卵中血红蛋白的含量及分
                醋酸钠、无水乙醇、甘油(上海生工);30%过氧化氢                         布情况。
                                                                                   [7]
               (上海国药试剂);4% PFA(上海 Lab Top);TRIzol                     配制固蓝染液 :取0.36 mg o⁃Dianisidine粉末、
               (Ambion公司,美国)。                                     13 μL 30%过氧化氢、2 μL 3 mol/L 醋酸钠(pH4.5)、
                1.2  方法                                           240 μL无水乙醇,使用ddH2O定容到600 μL。
                1.2.1  斑马鱼饲养                                          将敲除得到的杂合突变体斑马鱼(Hb )以及野
                                                                                                       +/-
                    AB品系野生型斑马鱼(购于中科院遗传与发育                         生型斑马鱼(WT)雌雄各一对分别进行自交,所产受
                生物学研究所)及kdrl:EGFP转基因斑马鱼(购于国                       精卵收集于不同的培养皿中,同时记录产卵时间,
                家斑马鱼资源中心)在上海海圣斑马鱼养殖循环系                            随后置于28 ℃ 恒温培养箱中培养。分别取24、28、
                统中按照标准方法饲养。养殖水循环水温控制在                             30、33、36、48、52 hpf Hb 和WT斑马鱼胚胎(n=30),
                                                                                       +/-
                28 ℃,pH值为7.4±0.2,自动进行暗/光循环(10 h/14 h)。            早期胚胎未出膜时,需先将卵膜剥离再进行染色。
                通过自然配对交配获得斑马鱼胚胎,并将其保存在                            使用 o⁃Dianisidine 染液室温染色 15 min,全程避光,
                装有养殖水的培养皿中,置于28 ℃恒温培养箱。斑                          随后用PBST漂洗3次,每次漂洗3 min,漂洗完成后
                马鱼胚胎的年龄以受精后小时数或天数(hpf或dpf)                        将受精卵置于 4% PFA 中固定超过 6 h,PBST 再漂
                表示。所有实验操作均经上海海洋大学动物伦理                             洗 3 次,每次 3 min,放置在 100%的甘油中,显微镜
                委员会批准。                                            观察染色情况并拍照。
   10   11   12   13   14   15   16   17   18   19   20