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第43卷第7期 黄梓熙,孟 琳,陈良标,等. 斑马鱼3号染色体血红蛋白基因敲除对心血管发育的影响[J].
2023年7月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(07):900-908 ·901 ·
心血管疾病(cardiovascular disease,CVD)的患 1.2.2 CRISPR/Cas9敲除
[7]
病率近年来逐步提升,已经成为我国重大公共卫生 利用 CRISPR/Cas9 技术 对斑马鱼 3 号染色体
问题,每年有2/5的死亡可归因于CVD 。除此之外, 上编码血红蛋白的基因片段 hbba2 到 hbae3 进行双
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CVD的治疗费用也十分高昂,并且仍在不断增长 [2-3] 。 靶点敲除(图1)。基因敲除后利用基因组DNA提取
因此,CVD 的影响因素和治疗方法都需要深入研 试剂盒提取 DNA,进行基因组扩增。参照 NCBI 上
究。红细胞是运输氧气的载体,血红蛋白在机体内 斑马鱼基因序列设计引物,并在上海生工公司进行
发挥着重要的作用,虽然血红蛋白水平和CVD之间 合成。分别使用 3 对引物进行 PCR 扩增,鉴定斑马
的关系仍不明确,但是它与携氧量、血流量及某些炎 鱼的基因型。鉴别结果可分为以下 3 种情况,①使
症过程相关,而有研究显示,血红蛋白水平和 CVD 之 用第 1 对引物进行扩增:上游引物 H6⁃1⁃F(5′⁃GT⁃
间的关系并不是线性关系 ,而是呈 U 型相关 , GAAAGGGTGCTGGTTGTT⁃3′);下游引物 H5⁃12⁃R
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因此血红蛋白水平增高或降低都可能与 CVD 有密 (5′⁃TTAGCTTGCAGAGAGACGGA⁃3′)。扩增后无
切的关系 ,目前对于血红蛋白水平调控心血管发 条带则为野生型(WT)斑马鱼;若扩增出220 bp的条
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育的机制研究较少。 带,则说明此斑马鱼为杂合子(Hb )或纯合子
+/-
斑马鱼基因与人类具有高度的同源性,本研 (Hb ),接着再分别使用HB⁃2⁃F1(5′⁃CAAAGCTTA⁃
-/-
究充分利用斑马鱼易于繁殖、便于在体观察的 AATGTTCGTGC⁃3′)、HB⁃2⁃R1(5′⁃CGATGACAAT⁃
特点以及现有成熟的基因操纵技术,首次在斑 GCTCAGGCAGTC⁃3′)和 H5⁃2⁃F(5′⁃GCGTTCAAA⁃
马鱼中使用 CRISPR/Cas9 技术对 3 号染色体上血 ACAATGCTCTTC⁃3′)、H5⁃2⁃R(5′⁃GGGTAAACGAA⁃
红蛋白基因从 hbba2 到 hbae3 的片段进行敲除,对 CAAAGTCCTGTAAA⁃3′)两对引物扩增;②若扩增
基因敲除后斑马鱼的血红蛋白水平及不同时期心 出472 bp和393 bp的目的条带,则此斑马鱼为杂合
血管发育进行研究,以阐明血红蛋白水平变化影 子(Hb );③若扩增不出 472 bp 和 393 bp 的目的条
+/-
响心血管发育的分子机制,为 CVD 的防治提供新 带,则此斑马鱼为纯合子(Hb )。PCR 扩增的反应
-/-
思路。 条件为:95 ℃下预变性 5 min;95 ℃下变性 30 s,
62 ℃(/58 ℃/55 ℃)下退火 30 s,72 ℃下延伸 30 s,共
1 材料和方法
进行 35 个循环;最后在 72 ℃下再延伸 5 min。PCR
1.1 材料 产物使用1.5%的琼脂糖凝胶电泳成像。
邻联茴香胺(o⁃Dianisidine)粉末(Sigma公司,美 1.2.3 固蓝染色
国);rTaq 酶、PrimeScript TM RT Master Mix 试剂盒、 血 红 蛋 白 催 化 过 氧 化 氢 释 放 出 氧 后 会 使
TB Green Premix Ex Taq (TaKaRa 公司,日本); o⁃Dianisidine 呈现出铁锈的颜色,根据这一特性,使
®
TM
PBS 缓冲液、甲基纤维素(北京索莱宝);Tween⁃20、 用o⁃Dianisidine 检测受精卵中血红蛋白的含量及分
醋酸钠、无水乙醇、甘油(上海生工);30%过氧化氢 布情况。
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(上海国药试剂);4% PFA(上海 Lab Top);TRIzol 配制固蓝染液 :取0.36 mg o⁃Dianisidine粉末、
(Ambion公司,美国)。 13 μL 30%过氧化氢、2 μL 3 mol/L 醋酸钠(pH4.5)、
1.2 方法 240 μL无水乙醇,使用ddH2O定容到600 μL。
1.2.1 斑马鱼饲养 将敲除得到的杂合突变体斑马鱼(Hb )以及野
+/-
AB品系野生型斑马鱼(购于中科院遗传与发育 生型斑马鱼(WT)雌雄各一对分别进行自交,所产受
生物学研究所)及kdrl:EGFP转基因斑马鱼(购于国 精卵收集于不同的培养皿中,同时记录产卵时间,
家斑马鱼资源中心)在上海海圣斑马鱼养殖循环系 随后置于28 ℃ 恒温培养箱中培养。分别取24、28、
统中按照标准方法饲养。养殖水循环水温控制在 30、33、36、48、52 hpf Hb 和WT斑马鱼胚胎(n=30),
+/-
28 ℃,pH值为7.4±0.2,自动进行暗/光循环(10 h/14 h)。 早期胚胎未出膜时,需先将卵膜剥离再进行染色。
通过自然配对交配获得斑马鱼胚胎,并将其保存在 使用 o⁃Dianisidine 染液室温染色 15 min,全程避光,
装有养殖水的培养皿中,置于28 ℃恒温培养箱。斑 随后用PBST漂洗3次,每次漂洗3 min,漂洗完成后
马鱼胚胎的年龄以受精后小时数或天数(hpf或dpf) 将受精卵置于 4% PFA 中固定超过 6 h,PBST 再漂
表示。所有实验操作均经上海海洋大学动物伦理 洗 3 次,每次 3 min,放置在 100%的甘油中,显微镜
委员会批准。 观察染色情况并拍照。