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第43卷第7期             孙文亚,何元林,陈秋臻,等. 小鼠原始卵泡形成过程中可变剪切的动态变化[J].
                  2023年7月                     南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(07):893-899                       ·897 ·


                  表3 卵泡组装过程7种差异可变剪切事件数目及占比                        中可变剪切基因,如异质核糖核蛋白(HRNP)家
                Table 3  The numbers and percentages of seven types of  族基因的富集,表明卵泡组装过程中剪切机制的
                        differential alternative splicing events during fol⁃  不同调节 [16] 。SE 和 AF 类型的可变剪切基因 Sycp1
                        licle assembly               [n(%)]
                                                                  和Hormad1参与了第一次减数分裂前期突触复合体
                                     P < 0.01的DAS事件                     [17-18]
                可变剪切类型                                            的形成       ,它们在卵泡中的表达显著降低,PCR实
                             包囊vs.包囊破裂       包囊破裂vs.卵泡形成
                                                                  验结果表明它们在卵泡发育后期转录本外显子包
                     SE         269(30.1)        816(32.3)
                                                                  含水平呈显著降低趋势(图 4),这与卵母细胞减数
                    A5          118(13.2)        341(13.5)
                                                                  分裂在二倍体期阻滞直至排卵相一致,表明可变剪
                    A3          149(16.7)        368(14.5)
                     RI          61(6.8)          176(7.0)        切基因可能有着抑制减数分裂的作用。另一个确
                    ME           11(1.2)          46(1.8)         定的可变剪切基因 Kdm1a 编码一种组蛋白去甲基
                    AF          247(27.7)        676(26.7)        化酶,它能使组蛋白H3第4赖氨酸和组蛋白H3第9
                    AL           38(4.3)          106(4.2)        赖氨酸去甲基化,PCR 实验显示它的同源异构体在



                A                                            B
                                                              包囊vs.包囊破裂 包囊破裂vs.卵泡形成
                  包囊vs.包囊破裂                包囊破裂vs.卵泡形成
                                                                   down up down up
                       up                                                        protein modification by small protein conjugation
                                                                                 ribonucleoprotein complex biogenesis
                                                  up                             regulation of organelle organization
                      down                                                       cellular protein catabolic process
                                                                                 macromolecule catabolic process
                                                                                 intracellular protein transport
                                                                                 peptide metabolic process
                                                                                 cytoskeleton organization  Gene counts
                                                                                 mRNA metabolic process
                                                                                 chromation organization  50
                                                                                 RNA catabolic process    100
                                                 down
                                                                                 DNA metabolic process    150
                      none                                                       meiotic cell cycle
                                                                                 symbiotic process
                                                                                 organelle fission     -lg P
                                                                                 RNA localization
                                                                                 nuclear division
                                                 none                            ncRNA processing         20
                                                                                 rRNA processing
                                                                                 RNA processing
                                                                                 RNA splicing             10
                                                                                 translation
                                                                                 DNA repair
                                                                                 cell cycle
                   A:可变剪切事件在包囊到包囊破裂转换以及包囊破裂到卵泡生成转换时的动态变化,up表示可变剪切事件发生指标PSI上调,down表示
                下调,none表示无差别;B:包囊到包囊破裂转换以及包囊破裂到卵泡生成转换差异(up或者down)可变剪切基因的基因功能富集,Gene counts
                表示富集基因数目。
                                           图3 卵泡组装过程可变剪切基因动态变化及功能富集
                      Figure 3 Dynamic changes and functional enrichment of alternative splicing genes during follicle assembly



                不同发育阶段的卵细胞中也是动态变化的,这个结                            不同的表达模式,可能也暗示着对卵泡发育不同的
                果和Kdm1a调节神经发育结果类似               [20] ,表明Kdm1a     调控模式。因此,我们发现了以前未被识别的卵母
                的同源异构体同时参与卵泡生成的调控。我们还                             细胞可变剪切事件以及参与调控卵泡组装中可变
                检测了其他几个可变剪切基因,包括 SE 类型的                           剪切基因的动态表达。
                Gtsf1、Eif4a2,AF类型的Ncl的动态变化。Gtsf1是一
                种基本的配子发生因子,在哺乳动物中高度保守,                            3 讨    论
                参与维持配子发生过程中的遗传稳定性,PCR 实验                              哺乳动物原始卵泡的组装是卵巢生殖生物学
                显示它在卵泡中的表达显著上升,可能在卵泡发育                            中最关键的过程之一,它直接影响雌性在整个生殖
                过程中发挥重要作用          [21] ;Eif4a2 是一种真核细胞翻          过程中可用的卵母细胞的储备,决定了生殖寿命。
                译起始因子,在卵巢中有较高的表达;Ncl是一种核                              可变剪切是一种普遍存在的基因表达调节机
                仁蛋白编码基因,两种 AF 类型的同源异构体呈现                          制,通过该机制,单个基因可以器官、组织或细胞
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