Page 10 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 10
第43卷第7期
·896 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年7月
A B C
E17.5 10 000
包囊 包囊破裂 卵泡形成 包囊 包囊破裂
包囊 8 000 942
2 044 232
可变剪切事件数目
P0.5 6 000 22 419
包囊破裂 4 000 1 674 1 781
P2.5 2 000 4 137
卵泡形成 0 卵泡形成
SE A5 A3 ME RI AF AL
A:卵泡组装过程生殖细胞发育阶段:E17.5(包囊)、P0.5(包囊破裂)、P2.5(卵泡形成);B:卵泡组装过程生殖细胞发育阶段7种可变剪
切事件数目;C:卵泡组装过程生殖细胞发育阶段可变剪切事件的韦恩图,数字表示可变剪切事件的数目,重合部分数字表示各个发育阶段可
变剪切事件重合的数目。
图1 卵泡组装过程中可变剪切事件
Figure 1 Alternative splicing events during follicle assembly
A 包囊 包囊破裂 卵泡形成 B
Alyref Ccdc12 Brdt Cdc51
2.0
E17.5
*
* P0.5
* * * P2.5
1.5
mRNA相对表达量 1.0 * * * * * * * *
*
Ddx1 Fmr1 Hspa2 Hspa8
*
*
*
*
0.5
* * * * * *
* *
*
*
Zranb2 Pabpc1 Rbm38 Strap 0
Alyref Ccdc12 Brdt Cdc51 Ddx1 Fmr1 Hspa2 Hspa8 Zranb2 Pabpc1 Rbm38 Strap
A:可变剪切因子在包囊、包囊破裂和卵泡形成3个细胞发育阶段表达的小提琴图;B:RT⁃PCR检测可变剪切因子在卵泡组装各个阶段的
相对表达量,与E17.5比较,P < 0.05,P < 0.01(n=3)。
*
**
图2 卵泡组装过程中可变剪切因子的表达
Figure 2 Expression of splicing factors during follicle assembly
增多,再一次表明卵泡形成时可变剪切事件的活 胞形成时功能性蛋白编码基因的多样性。
跃。此外,细胞发育阶段转换之间的DAS事件类型 2.4 卵泡组装过程中可变剪切基因的动态调控
表现出高度的特异性(表3)。在分析DAS事件的类 桑基图显示了卵母细胞从包囊到包囊破裂、包
型时,发现 SE 和 AF 是最丰富的剪切形式。与以往 囊破裂到卵泡形成之间转换时 DAS 事件的动态变
对其他细胞类型的研究不同,本研究结果显示卵母 化,可见相比包囊到包囊破裂过渡阶段,包囊破裂
细胞中 AF 类型的可变剪切的比例极高,特别是从 到卵泡形成过渡阶段的可变剪切发生了剧烈变化
包 囊 破 裂 过 渡 到 卵 泡 形 成 时 ,共 发 现 676 例 (图3A)。GO分析揭示从包囊到包囊破裂DAS基因
(26.7%)AF可变剪切事件。卵泡组装过程中细胞发 富集在细胞周期,从包囊破裂到卵泡期的 DAS 基
育阶段间的 DAS 事件再一次表明随着生殖细胞发 因富集在 RNA 剪切、翻译、DNA 修复过程和减数
育进程,可变剪切事件发生了剧烈变化以支持卵细 分裂细胞周期等生物学过程(图 3B)。剪切调控