Page 12 - 南京医科大学学报自然科学版

第43卷第7期
·898 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年7月

A Sycp1 Hormad1 Kdm1a Hnrnpa2b1
6 868 87 82
87
338
9 000 4 958 10 000 445 338 400 4 000
6 000 5 000 200 314 199
3 000 0 0 2 000
0 包囊 731 包囊 2 704 包囊 127 0
包囊
6 000 2 239 2 817 2 000 148 122 300 57 60 1 317
4 000 1 000 200 4 000 478 321
2 000 0 100 2 000
0 0 0
包囊破裂 包囊破裂1 064 包囊破裂 89 包囊破裂 917
包囊破裂 1 394
1 109 104 70 67
6 000 924 1 500 124 200 4 000 487 358
4 000 1 000 100 2 000
2 000 500 0 0
0 卵泡形成 2 444 0 卵泡形成551 卵泡形成 53 卵泡形成 744
136577500
102931700 102931900 102932100 95585200 95585400 95585600 95585800 136577500 136578000136578000 51467200 51467400 51467600
ENSMUST00000199930.1 ENSMUST00000107154.3 ENSMUST00000116273.8 ENSMUST00000204158.2
ENSMUST00000196988.4 ENSMUST00000029754.12 ENSMUST00000105847.7 ENSMUST00000203954.2
Mael Gtsf1 Eif4a2 Ncl
4 093 4 027
7 500 90 73 1 500 4 000
5 000 60 14 1 000 361 210
2 500 30 500 67 2 000
0 包囊 0 包囊 0 0
4 250 7 4 144 8 包囊 187 包囊 723
7 500 1 000 600
5 000 500 35 7 400 174 3 000 233
2 000
2 500 0 200 48 1 000
0 包囊破裂 7 包囊破裂 94 0 包囊破裂 91 0
1 406 1 358 1 500 300 包囊破裂 679
2 000 1 000 107 200 31 80 6 000
4 000
1 000 500 15 100 2 000 77
0 卵泡形成 2 0 卵泡形成 132 0 卵泡形成 87 0 卵泡形成 1 083
166226600 166227000 166227400 103428400 103428700 23108800 23109000 23109200 86358200 86358600 86359000
ENSMUST00000194057.5 ENSMUST00000153930.7 ENSMUST00000232287.1 ENSMUST00000185785.1
ENSMUST00000038782.3 ENSMUST00000129837.1 ENSMUST00000168891.7 ENSMUST00000185676.6
B 1.5 Sycp1 0.8 Hormad1 1.0 Kdm1a 0.8 Hnrnpa2b1
同源异构体相对表达水平 1.0 0 E17.5 P0.5 P2.5 同源异构体相对表达水平 0.6 0 E17.5 P0.5 P2.5 同源异构体相对表达水平 0.8 0 E17.5 P0.5 P2.5 同源异构体相对表达水平 0.6 0 E17.5 P0.5 P2.5
*
**
**
0.6
**
0.4
0.4
**
0.4
** **
0.5
0.2
0.2
**
0.2
同源异构体相对表达水平 1.0 Mael 同源异构体相对表达水平 0.4 Gtsf1 ** 同源异构体相对表达水平 1.0 Eif4a2 同源异构体相对表达水平 1.0 Ncl E17.5
**
0.8
0.8
P0.5
0.8
0.3
**
P2.5
0.6
0.6
0.6
0.2
0.4
0.4
0.4
**
0.1
**
0.2
0.2
0.2
0
0
0
0
P2.5
P2.5
P2.5
AF1
E17.5 P0.5
E17.5 P0.5
E17.5 P0.5
AF2
A：桑基图可视化可变剪切事件，图中曲线连接的地方代表剪切位点，横向坐标表示基因组坐标，纵向刻度表示对应的测序深度分布，曲线
旁数字代表检测到的比对到该区域的reads数目；B：PCR荧光灰度值分析E17.5、P0.5、P2.5时期可变剪切基因的同源异构体相对表达水平，与
E17.5比较，P < 0.05，P < 0.01（n=3）。
*
**
图4 代表性差异可变剪切基因的可视化及PCR验证
Figure 4 Sashimiplots and PCR validation of representative differential alternative splicing genes
类型特异性的方式产生一个以上独特的 mRNA 种 间检测到广泛的可变剪切事件，尤其是卵泡期检测
类 。可变剪切是多细胞真核生物转录组高度复 到了最多的可变剪切事件，其中包囊到包囊破裂和
［9］
杂的重要原因，丰富了蛋白质和表型性状的多样 包囊破裂到卵泡期分别富集了 893 和 2 529 个 DAS
性 ［22］ 。小鼠基因组中的绝大多数（89%）蛋白质编 事件。这表明卵泡期的可变剪切较为活跃，为卵泡
码基因都经历了可变剪切 ［13］ 。目前对大量细胞 的功能性基因表达或蛋白多样性提供了支持。本研
RNA⁃seq 数据的可变剪切研究较多，只有较少的研 究数据也显示了可变剪切基因沿着发育轨迹的动
究集中在单细胞水平上。 态表达模式。这表明单细胞亚型多样性影响蛋白
本研究在卵泡组装过程的细胞发育阶段转换之 的编码谱，进而影响卵泡形成过程中的细胞分化。