Page 9 - 南京医科大学学报自然科学版
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第44卷第1期          肖心儒,范     亮,施宇佳,等. A2M在慢性阻塞性肺疾病中的表达及其与免疫细胞浸润的
                  2024年1月               相关性[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(01):001-011,059                 · 3  ·


                10 min,分离血清,通过 ELISA 检测 A2M 蛋白水平;                 Arg⁃1)和抗内参 GAPDH 的一抗(Abcam 公司,英
                另留存 5 mL 全血用于 RT⁃qPCR 测定 A2M 的 mRNA               国),4 ℃摇床孵育过夜。次日 TBST 洗涤 3 次,山羊
                表达水平。所有受试者的血液样本均储存于-80 ℃。                         抗兔IgG二抗(上海碧云天公司)在室温下孵育1.5 h
                1.2.2 细胞培养及处理                                     后,再用 TBST 洗涤 3 次。使用 ECL 显影液(上海碧
                    巨噬细胞系 Raw264.7(武汉普诺赛公司)使用                     云天公司)在化学发光成像程序系统进行曝光拍
                DMEM 培养基培养于 37 ℃、5%CO2 的恒温培养箱                     照。Image J软件用于结果分析。
                内,DMEM 含有 10%胎牛血清和 1%双抗。使用终                       1.2.6 肺功能的测定

                浓度为 50 ng/mL 的白细胞介素(interleukin,IL)⁃4                 本研究使用肺功能仪(耶格公司,德国),根据
                和 IL⁃13 诱导 Raw264.7 细胞 24 h 成为 M2 型巨噬细            2019 年肺活量测定标准         [13] 对受试者进行坐位肺功
                胞(细胞形态为类圆形或纺锤形贴壁);随后用脂质                           能检查,在整个测试过程中操作者持续观察容积和
                体3 000(赛默飞公司,美国)将A2M siRNA(福州尚亚                   流量曲线,并测量 FVC、FEV1和 FEV1/FVC 以及其他
                公司)转染至M2型巨噬细胞;最后分别于转染48 h和                        肺功能测试参数并计算预期值,记录3次测量数值,
                72 h后提取RNA和蛋白用于进一步研究。                             将最高值认定为基值,同时FVC和FEV1的最佳值和
                1.2.3 ELISA测定                                     次佳值之间的差异应小于0.10 L。
                    根据制造商的说明,使用ELISA试剂盒(江苏酶                       1.2.7 生物信息学分析

                标公司)检测血浆样品中A2M的总浓度。在450 nm                            从GEO数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)
                处获得标准品和样品的吸光度值,并比较为每种测                            中筛选芯片数据集,选择标准如下:①数据集必须
                定构建的标准曲线,并用于最小化测定间差异。                             包含全基因组表达mRNA 微阵列数据;②数据集应
                1.2.4 RT⁃qPCR检测                                   包括 COPD 患者和正常吸烟者的肺组织标本;③数
                    使用 RNAliquid 超速全血总 RNA 提取试剂盒                  据集样本数量必须>20。基于以上标准,获得了
               (北京汇天东方科技有限公司)提取总RNA,实验步                           GSE38974 基因表达谱数据集,GSE38974 包含来自
                骤按照说明书进行。使用紫外线分光光度计对提                             COPD患者的23个肺组织样品和来自正常吸烟者的
                取的RNA浓度及纯度进行检测。使用第一链cDNA                          9个肺组织样品。
                合成试剂盒(南京诺唯赞公司)合成第一链互补                             1.2.7.1 差异表达基因和富集分析
                DNA。使用 AceQ qPCR SYBR Green Master Mix(南              使用 R 软件“Limma”识别 COPD 样本和健康对
                京诺唯赞公司)进行 RT⁃qPCR,以评估 mRNA 表达                     照组样本之间的差异表达基因。以调整后的P < 0.05
                的程度。用ABI 7300型荧光定量PCR仪,采用2                 -ΔΔCT  和 |log2 fold change| ≥1 作为截断值。使用 R 软件
                法进行数据的相对定量分析。引物由苏州吉玛公                             clusterProfiler包进行GO和KEGG分析。
                司提供,序列如下:homo⁃A2M(F:5ʹ⁃AGGAAATCG⁃                 1.2.7.2 GSVA分析
                CATCGCACAATG ⁃ 3ʹ;R:5ʹ ⁃ ACGGTGAAAGGGT⁃               GSVA 能评估每个样本中通路活性的潜在变
                GCTCTG⁃3ʹ);homo⁃β⁃actin(F:5ʹ⁃CGTGGACATCCG⁃        化。使用R软件中的“GSVA”包进行分析,计算所有
                CAAAGA⁃3ʹ;R:5ʹ⁃GAAGGTGGACAGCGAGGC⁃3ʹ);            样本中通路的富集评分。
                mus⁃A2M(F:5ʹ⁃AGGAATCTGCCCGAGCTTCT⁃3ʹ;R:           1.2.7.3 免疫细胞浸润的评估

                5ʹ⁃ATGGCCTTGGTCTTGATCTCC⁃ 3ʹ);mus⁃β⁃actin             本研究使用“CIBERSORTx”网站(https://ciber⁃
               (F:5ʹ ⁃ TGTCCACCTTCCAGCAGATGT ⁃ 3ʹ;R:5ʹ ⁃          sortx.stanford.edu)估算了 GSE38974 样本中 22 种免
                AGCTCAGTAACAGTCCGCCTAG⁃3ʹ)。                       疫细胞的比例。
                1.2.5 Western blot实验                              1.3  统计学方法
                    收集经处理的各组细胞,4 ℃下 12 000 g 离心                       使用 SPSS26.0 和 GraphPad Prism7 对实验数据
                10 min 后,在含有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的裂解液                        进行统计分析。采用 Kolmogorov⁃Smirnov 检验测量
               (上海碧云天公司)中裂解 30 min。使用 BCA 蛋白                      数据的正态性。符合正态分布的测量数据表示为
                测定试剂盒(上海碧云天公司)测定蛋白含量。蛋                            均数±标准差(x ± s),分类变量数据表示为例数(百
                白质样品经 10%凝胶(上海雅酶公司)电泳后转移                          分率)[n(%)]。组间比较采用χ 检验或 Fisher 确切
                                                                                               2
                到 PVDF 膜上,利用快速封闭液(上海碧云天公司)                        概率法检验。若符合正态分布,对连续变量使用
                对PVDF膜封闭20 min,加入抗精氨酸酶(arginase⁃1,                t 检验。采用Pearson相关分析对正态分布的资料进
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